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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 关于DNA表达
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sunxiaosha

银虫 (小有名气)

[求助] 关于DNA表达

现在实验已经知道一个单链DNA的序列，想知道哪个基因片段是表达特定部位的，比如鸡的腿部之类的 请教各位该如何知道
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1楼 2012-05-23 10:50:46
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gaoyang636

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
sunxiaosha: 金币+5, ★★★很有帮助, 谢谢 2012-05-23 15:34:07
首先你这里只知道这是个DNA序列，请问知道它基因的信息么？上面含有什么基因，是否是基因全长？（咱们假设果然是有某些基因的全长或者大部分长度好了）……
然后你就可以根据该基因的序列，设计RealTime引物；
同时你把可能的/感兴趣几个组织（举例：心，肝脏，腿部肌肉……）取样，提取RNA，反转录，定量并稀释后可得模板；
然后拿这个模板+你设计的引物，跑一下定量PCR，做出来的图就是组织分布图了。
这基本上算是生物专业的一块儿工作了，lz外行做起来会比较辛苦，最好找公司或者合作
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2楼2012-05-23 15:21:44
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sunxiaosha

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by gaoyang636 at 2012-05-23 15:21:44:
首先你这里只知道这是个DNA序列，请问知道它基因的信息么？上面含有什么基因，是否是基因全长？（咱们假设果然是有某些基因的全长或者大部分长度好了）……
然后你就可以根据该基因的序列，设计RealTime引物；
同

我是用试剂盒提取鸡腿的单链DNA，想送到测序公司测序。然后想要表达腿部基因的那个片段，请您再指教下，谢谢
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3楼2012-05-23 15:36:26
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gaoyang636

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by sunxiaosha at 2012-05-23 15:36:26:
我是用试剂盒提取鸡腿的单链DNA，想送到测序公司测序。然后想要表达腿部基因的那个片段，请您再指教下，谢谢

我还是不很理解……请lz先指教：
1 试剂盒提取鸡腿的单链DNA，什么试剂盒？为啥要单链DNA? 你怎么确定这不是普通的双链基因组DNA?
2 你的意思是不是 “想要 决定这个部位最后发育生长成为腿的 那个/那些基因”？ 而不是要 只在腿部表达的基因而已？ 就是要决定 ”腿之所以成为腿“ 的基因？
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4楼2012-05-24 09:03:22
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sunxiaosha

银虫 (小有名气)
★ ★
yqbter: 金币+2, 鼓励应助！ 2012-05-25 08:13:56
引用回帖:
4楼: Originally posted by gaoyang636 at 2012-05-24 09:03:22:
我还是不很理解……请lz先指教：
1 试剂盒提取鸡腿的单链DNA，什么试剂盒？为啥要单链DNA? 你怎么确定这不是普通的双链基因组DNA?
2 你的意思是不是 “想要 决定这个部位最后发育生长成为腿的 那个/那些基因”？

1 试剂盒是组织DNA提取试剂盒，能提取出单链DNA来。要单链DNA是因为想检测变异的，利用碱基互补配对，如果变异碱基就不能完全配对。
2 我想要的是决定这个部位最后发育生长成为腿的 那个/那些基因
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5楼2012-05-24 15:39:12
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gaoyang636

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
sunxiaosha: 金币+5 2012-05-25 09:21:42
第二点：我总觉得是个大科学问题……不是一两个基因能搞定的，我无能为力了；
第一点：你想利用配对互补，我理解了，是想要点芯片么，还是怎么弄？我怎么觉得还是测序更简单易行呢？
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6楼2012-05-24 19:46:02
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sunxiaosha

银虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by gaoyang636 at 2012-05-24 19:46:02:
第二点：我总觉得是个大科学问题……不是一两个基因能搞定的，我无能为力了；
第一点：你想利用配对互补，我理解了，是想要点芯片么，还是怎么弄？我怎么觉得还是测序更简单易行呢？

首先谢谢你的帮助。
    我是做生物传感器的，把单链DNA修饰到传感器上。检测其他DNA是不是变异了，如果是，信号就会不那么强大。
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7楼2012-05-25 09:21:32
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