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IRC 结果分析
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TS寻找过渡态，完了以后用IRC扫描势能面，顺利收敛，，在分析结果的时候却意外的发现，irc的势能面扫描过程中，开始点和结束点的几何构型几乎一样，反应产物，感觉只是键在来回震荡。 好吧，问题出来了 1、这样的结果说明什么？ 如果这是一个正常的结果，是不是意味着我的反应不能发生 2、如果不是正常的结果，，改如何避免这样的情况呢？ 拜请各位大神不吝赐教。 本人计算的是一个是H原子的迁移过程，涉及自由基。 IRC输入文件如下： %chk=h3tsirc2.chk %nprocshared=4 %mem=4GB # b3lyp/6-31g scfcyc=300 irc=(calcfc,maxpoints=20) TS-Ph-H-OC-Ph 0 2 第一张，irc扫描完以后的结果  irc扫描完以后的结果 |
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我提取了你提供的结构，然后优化了一下，做出了IRC，正常结束。可以很清楚地从我上传的图片上看到H自由基的转移过程。这个IRC还是比较标准的。 你的问题是，你给我的过渡态结构，没有完全converged，距离稳定的过渡态结构，还是有微小的结构差别的。我提取了你给我的结构，在你的所用的基组和方法下，走了7步之后，才完全converged了。这可能是就是你为什么做IRC，总走到一个同一个结构的原因，因为你提供的结构没有收敛，所用IRC在找force的方向的时候，总会偏向于你的过渡态所在的势能面鞍点的方向。 下边是我的input的route section还有优化好的结构,for you refence #B3LYP/6-31G irc(maxpoints=14,calcfc) CHECK 0 2 C -2.63111700 -0.70748700 0.56895500 C -2.97700400 0.42177700 -0.19740600 C -4.18867800 0.45474300 -0.92437400 C -5.04835900 -0.63912900 -0.87442100 C -4.70445400 -1.76609100 -0.10952400 C -3.50058500 -1.80090500 0.60443000 H -1.68296300 -0.73042600 1.09608400 H -4.43441600 1.33479400 -1.50904000 H -5.98215900 -0.62085900 -1.42632500 H -5.37748500 -2.61700800 -0.07481100 H -3.23705600 -2.67754400 1.18566100 C -2.07578400 1.57485900 -0.23763000 O -2.15712500 2.58760900 -0.91821100 H -1.06959100 1.50288200 0.65255700 C 4.94303000 0.75826500 -0.43868100 C 3.63962900 0.92450800 0.03522000 C 2.78501900 -0.18898700 0.12927900 C 3.24515100 -1.46246100 -0.25093100 C 4.54860200 -1.62076400 -0.72284200 C 5.39878500 -0.51083000 -0.81800400 H 5.60270300 1.61654500 -0.51072800 H 3.28158800 1.90214900 0.33244300 H 2.57117500 -2.30744100 -0.16795600 H 4.90192000 -2.60395800 -1.01529700 H 6.41266300 -0.63478500 -1.18519600 C 1.39365900 -0.08144600 0.62397600 O 0.61239400 -1.02219600 0.78588700 O 1.05326900 1.25529300 0.86960100 O -0.25275500 1.39171200 1.54951400  |
28楼2012-05-25 15:07:56
meteoric30
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2楼2012-05-18 15:35:18
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