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ellemiu

铁杆木虫 (正式写手)

[求助] IRC 结果分析

TS寻找过渡态,完了以后用IRC扫描势能面,顺利收敛,,在分析结果的时候却意外的发现,irc的势能面扫描过程中,开始点和结束点的几何构型几乎一样,反应产物,感觉只是键在来回震荡。

好吧,问题出来了
1、这样的结果说明什么? 如果这是一个正常的结果,是不是意味着我的反应不能发生

2、如果不是正常的结果,,改如何避免这样的情况呢?
拜请各位大神不吝赐教。

本人计算的是一个是H原子的迁移过程,涉及自由基。
IRC输入文件如下:
%chk=h3tsirc2.chk
%nprocshared=4
%mem=4GB
# b3lyp/6-31g scfcyc=300 irc=(calcfc,maxpoints=20)

TS-Ph-H-OC-Ph

0 2

第一张,irc扫描完以后的结果

irc扫描完以后的结果
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业精于勤荒于嬉,成于思而毁于随
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necturnal

铜虫 (初入文坛)

我提取了你提供的结构,然后优化了一下,做出了IRC,正常结束。可以很清楚地从我上传的图片上看到H自由基的转移过程。这个IRC还是比较标准的。
你的问题是,你给我的过渡态结构,没有完全converged,距离稳定的过渡态结构,还是有微小的结构差别的。我提取了你给我的结构,在你的所用的基组和方法下,走了7步之后,才完全converged了。这可能是就是你为什么做IRC,总走到一个同一个结构的原因,因为你提供的结构没有收敛,所用IRC在找force的方向的时候,总会偏向于你的过渡态所在的势能面鞍点的方向。
下边是我的input的route section还有优化好的结构,for you refence
#B3LYP/6-31G  irc(maxpoints=14,calcfc)

CHECK

0 2
C                 -2.63111700   -0.70748700    0.56895500
C                 -2.97700400    0.42177700   -0.19740600
C                 -4.18867800    0.45474300   -0.92437400
C                 -5.04835900   -0.63912900   -0.87442100
C                 -4.70445400   -1.76609100   -0.10952400
C                 -3.50058500   -1.80090500    0.60443000
H                 -1.68296300   -0.73042600    1.09608400
H                 -4.43441600    1.33479400   -1.50904000
H                 -5.98215900   -0.62085900   -1.42632500
H                 -5.37748500   -2.61700800   -0.07481100
H                 -3.23705600   -2.67754400    1.18566100
C                 -2.07578400    1.57485900   -0.23763000
O                 -2.15712500    2.58760900   -0.91821100
H                 -1.06959100    1.50288200    0.65255700
C                  4.94303000    0.75826500   -0.43868100
C                  3.63962900    0.92450800    0.03522000
C                  2.78501900   -0.18898700    0.12927900
C                  3.24515100   -1.46246100   -0.25093100
C                  4.54860200   -1.62076400   -0.72284200
C                  5.39878500   -0.51083000   -0.81800400
H                  5.60270300    1.61654500   -0.51072800
H                  3.28158800    1.90214900    0.33244300
H                  2.57117500   -2.30744100   -0.16795600
H                  4.90192000   -2.60395800   -1.01529700
H                  6.41266300   -0.63478500   -1.18519600
C                  1.39365900   -0.08144600    0.62397600
O                  0.61239400   -1.02219600    0.78588700
O                  1.05326900    1.25529300    0.86960100
O                 -0.25275500    1.39171200    1.54951400


28楼2012-05-25 15:07:56
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meteoric30

木虫 (正式写手)

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★ ★
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ellemiu: 金币+2, 有帮助, irc直接拿的TS的结果来继续的,不太明白irc的产物是指什么,你指的是最后一步的状态进行优化吗》?步长设大一点怎样设呢? 2012-05-18 16:19:23
步长设大一点,irc的产物优化了吗?优化的结果看看是不是和ts一样
2楼2012-05-18 15:35:18
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ellemiu

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by meteoric30 at 2012-05-18 15:35:18:
步长设大一点,irc的产物优化了吗?优化的结果看看是不是和ts一样

irc直接拿的TS的结果来继续的,不太明白irc的产物是指什么,你指的是最后一步的状态进行优化吗?

还有步长设大一点怎样设呢?
业精于勤荒于嬉,成于思而毁于随
3楼2012-05-18 16:20:22
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ldzh0531

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
ellemiu: 金币+1, 有帮助, 我算出的虚频为-1415,其实我只是想扫势能面看看TS是不是正确的 2012-05-21 10:14:58
IRC只是根据频率计算单点,并不优化。想要得到准确构型要提取出终端点优化。另外,通常氢转移的虚频要大于1000
4楼2012-05-18 17:58:22
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