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欢仔

银虫 (正式写手)

[求助] 植物RNA的提取

我在提富含多糖多酚的植物的RNA,提的效果不是很好,大家有什么好方法没

我在文献中查到了CTAB结合SDS法,这个方法如下我对其中的几个温度不太理解 请大侠们解释下吧  第二步中的提到的低温处理 起到了什么作用啊  大家也帮我看下这个方法有什么不合理的地方没   谢谢大家了
1  CTAB结合SDS法。分别称取叶片、叶柄和韧皮部各0.4 g于研钵中,加入0.05 g PVP,加入适量液氮,迅速研磨成粉末状,并将所有粉末全部转入2 mL离心管中;加入800 μL提取液(680 μL CTAB提取液、 80 μL 10%SDS、40 μL β-巯基乙醇;
CTAB 提取液成分为:2%CTAB、2.5 mol/L NaCl、0.5 mol/L Tris、50 mmol/LEDTA),用力剧烈震荡使所有粉末均匀悬浮于提取液中;
2  [font=黑体]65℃水浴20 min,期间剧烈震荡,使其充分混合,水浴后将离心管迅速放入-80℃冰箱中低温处理2 h以上;
3  取出经低温处理后的混合物,将其置于45℃水浴10 min,期间轻轻震荡,使完全溶解;
4   4℃,12000 r/min 离心30 min,将上清液转入预冷的2 mL离心管中,加入等体积酚∶氯仿∶异戊醇(25:24:1,V/V/V),在冰上用力振荡,使其充分混匀,
5  4℃,12000 r/min离心15 min(抽提2次),将上清液转入预冷过的1.5 mL离心管中,加入12 mol/L LiCl,使其终浓度为2 mol/L,冰上轻震荡充分混匀后置于-20℃条件下存放2 h以上;
6  4℃,12000 r/min 离心 10 min,去除上清液,加入 400 μL 预冷的75%的酒精清洗(重复2次);室温下干燥15 min,加 20 μL DEPC-H2O 溶 解
进 行 下 一 步 试 验 或 置于-80℃冰箱中保存备用。
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starseacow

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★ ★ ★ ★ ★ ★
西瓜: 金币+3, Good! 2012-05-14 18:52:49
欢仔: 金币+3, ★★★★★最佳答案, 非常感谢 2012-05-14 21:25:18
同意楼上的意见,可能要在操作上下点功夫。楼主所说的CTAB-SDS法,我只查到2012年中国农学通报上一篇关于葡萄的文章,不知楼主是否参考的这个。这种方法没见别的文献有报道,建议楼主参考时要谨慎。
多糖多酚类植物材料提RNA,我觉得主要需要添加一步抽提派出糖及酚的干扰,我手头收集的文献有建议使用70%丙酮抽提后用SDS-LiCl法提取。此外还有很多文献提出有用的建议,楼主不妨以比较可靠的经典方法做基础,参考这些文献自己摸索一下,不要盲目照着单一文献做。
植物生理群69993869,为避免广告,申请加入请提供木虫昵称,院校及专业信息
11楼2012-05-14 18:17:50
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starseacow

专家顾问 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
欢仔: 金币+2, ★★★很有帮助, 谢谢 2012-05-13 23:56:41
65度水浴这步主要起到裂解细胞,释放出核酸的作用。在提取RNA过程中建议不要剧烈震动,适当振摇即可。
植物生理群69993869,为避免广告,申请加入请提供木虫昵称,院校及专业信息
2楼2012-05-13 22:32:57
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欢仔

银虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by starseacow at 2012-05-13 22:32:57:
65度水浴这步主要起到裂解细胞,释放出核酸的作用。在提取RNA过程中建议不要剧烈震动,适当振摇即可。

那后面放到-80度 冰箱低温处理2h  起到什么作用 -80不是都结冰了吗 很费解
勇于尝试新鲜事物
3楼2012-05-13 23:56:14
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starseacow

专家顾问 (职业作家)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by 欢仔 at 2012-05-13 23:56:14:
那后面放到-80度 冰箱低温处理2h  起到什么作用 -80不是都结冰了吗 很费解

低温处理的作用主要是让核酸析出沉淀,为什么-80度我也不理解,楼主从哪里看到这个方法?
植物生理群69993869,为避免广告,申请加入请提供木虫昵称,院校及专业信息
4楼2012-05-14 00:23:38
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