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起司喵

新虫 (初入文坛)

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[交流] 【求助】请高手指点如何用UCSC提取miRNA上游2kb区域中的TFBS 已有1人参与

网上有一些教程，是利用UCSC genome browser提取基因上游区域的启动子。
现在本人想提取miRNA上游2kb范围内的所有转录因子结合位点，
多次尝试未果。请大侠们指点，大概的操作步骤即可。非常感谢~

[ Last edited by 起司喵 on 2012-5-9 at 14:22 ]

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Be urself

1楼 2012-05-09 14:20:31

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

tclxcccc

新虫 (初入文坛)

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★
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我都是下好转录因子结合位点，自己扩区域，然后再下载tfbs，在比对到区域的。还有简便的方法可以直接提取么？

2楼2012-05-10 15:37:08

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

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