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沧海一杯

银虫 (正式写手)


[交流] MB与DNA之间的作用力

MB作为杂交指示剂与ssDNA、dsDNA作用力不同,DNA杂交形成双链后,电化学信号是应该变大还是变小?怎么看到不同的说法啊?有文献说MB与dsDNA两种作用力,与ssDNA只有静电作用,因而杂交后电化学信号增大。另外一种说法,MB与G具有特殊作用,因而形成双链后,抑制与G作用,所以电流降低。何解??
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hqixia

金虫 (小有名气)


引用回帖:
2楼: Originally posted by xuehaier at 2012-05-09 17:45:56:
Methylene blue as an electrochemical discriminator of single-and double-stranded oligonucleotides immobilised on gold substrates

这篇文章说的挺清楚的

这篇文章的CV图是不是说MB与ssDNA的结合比dsDNA更好~?
4楼2012-05-09 20:43:54
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xuehaier

木虫 (正式写手)


引用回帖:
4楼: Originally posted by hqixia at 2012-05-09 20:43:54:
这篇文章的CV图是不是说MB与ssDNA的结合比dsDNA更好~?

MB与ssDNA的结合显然更强   我一个师兄做过  ssDNA的信号更强
5楼2012-05-09 21:15:32
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普通回帖

xuehaier

木虫 (正式写手)



沧海一杯(金币+1): 谢谢参与
Methylene blue as an electrochemical discriminator of single-and double-stranded oligonucleotides immobilised on gold substrates

这篇文章说的挺清楚的
2楼2012-05-09 17:45:56
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hqixia

金虫 (小有名气)



沧海一杯(金币+1): 谢谢参与
我也想知道~~~MB和双链DNA的作用模式到底是怎么样的?
3楼2012-05-09 20:29:03
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xuehaier

木虫 (正式写手)


引用回帖:
3楼: Originally posted by hqixia at 2012-05-09 20:29:03:
我也想知道~~~MB和双链DNA的作用模式到底是怎么样的?

嵌入 多元环结构易产生嵌入作用
6楼2012-05-09 21:22:06
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沧海一杯

银虫 (正式写手)


引用回帖:
2楼: Originally posted by xuehaier at 2012-05-09 17:45:56:
Methylene blue as an electrochemical discriminator of single-and double-stranded oligonucleotides immobilised on gold substrates

这篇文章说的挺清楚的

谢谢,研究研究
7楼2012-05-10 08:02:47
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沧海一杯

银虫 (正式写手)


引用回帖:
5楼: Originally posted by xuehaier at 2012-05-09 21:15:32:
MB与ssDNA的结合显然更强   我一个师兄做过  ssDNA的信号更强

确实有文章报道ssDNA信号更强,但是我看到不同文献有不同的解释,这是怎么回事?
(1)Highly sensitive electrochemical impedance spectroscopic detection of DNA hybridization based on Aunano–CNT/PANnano films,Talanta 77 (2009) 1021–1026
(2)Application of chitosan/Fe3O4 microsphere–graphene  composite  modified  carbon ionic  liquid  electrode  for  the  electrochemical  detection  of  the  PCR  product  of soybean Lectin gene sequence,Talanta 87 (2011) 106–112
9楼2012-05-10 08:07:52
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沧海一杯

银虫 (正式写手)


引用回帖:
4楼: Originally posted by hqixia at 2012-05-09 20:43:54:
这篇文章的CV图是不是说MB与ssDNA的结合比dsDNA更好~?

(1)Highly sensitive electrochemical impedance spectroscopic detection of DNA hybridization based on Aunano–CNT/PANnano films,Talanta 77 (2009) 1021–1026
(2)Application of chitosan/Fe3O4 microsphere–graphene  composite  modified  carbon ionic  liquid  electrode  for  the  electrochemical  detection  of  the  PCR  product  of soybean Lectin gene sequence,Talanta 87 (2011) 106–112
这两篇文献对ssDNA、dsDNA有不同的作用效果,怎么回事?
10楼2012-05-10 08:09:05
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xuehaier

木虫 (正式写手)


引用回帖:
10楼: Originally posted by 沧海一杯 at 2012-05-10 08:09:05:
(1)Highly sensitive electrochemical impedance spectroscopic detection of DNA hybridization based on Aunano–CNT/PANnano films,Talanta 77 (2009) 1021–1026
(2)Application of chitosan/Fe ...

我倾向于2009年的那一篇文章说得对
11楼2012-05-10 17:02:00
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沧海一杯

银虫 (正式写手)


引用回帖:
11楼: Originally posted by xuehaier at 2012-05-10 17:02:00:
我倾向于2009年的那一篇文章说得对

很多文献都倾向于这种结果,但是为什么相反的结果也会发表呢?不矛盾么?
12楼2012-05-10 20:05:23
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xuehaier

木虫 (正式写手)


★ ★ ★ ★ ★ ★
沧海一杯: 金币+6 2012-05-10 20:52:18
引用回帖:
12楼: Originally posted by 沧海一杯 at 2012-05-10 20:05:23:
很多文献都倾向于这种结果,但是为什么相反的结果也会发表呢?不矛盾么?

多数审稿人未必是专门做这个的 所以有可能不太了解这些细节问题

而且MB应该是与DNA带负电的骨架结合,单链更易于结合,形成双链后会有空间位阻效应使结合减少,,只能依靠嵌入作用,而嵌入作用的分子较少,导致鸟嘌呤的氧化减少,这是我认为的主要原因。这两篇文章中那一部分引用的文献你也可以看看。

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13楼2012-05-10 20:23:07
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沧海一杯

银虫 (正式写手)


送鲜花一朵
引用回帖:
13楼: Originally posted by xuehaier at 2012-05-10 20:23:07:
多数审稿人未必是专门做这个的 所以有可能不太了解这些细节问题

而且MB应该是与DNA带负电的骨架结合,单链更易于结合,形成双链后会有空间位阻效应使结合减少,,只能依靠嵌入作用,而嵌入作用的分子较少,导 ...

非常感谢,你帮我解决了一个很大的困惑,谢谢!!!
14楼2012-05-10 20:52:12
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沧海一杯

银虫 (正式写手)


引用回帖:
13楼: Originally posted by xuehaier at 2012-05-10 20:23:07:
多数审稿人未必是专门做这个的 所以有可能不太了解这些细节问题

而且MB应该是与DNA带负电的骨架结合,单链更易于结合,形成双链后会有空间位阻效应使结合减少,,只能依靠嵌入作用,而嵌入作用的分子较少,导 ...

顺便问一句,MB是带正电的么?
15楼2012-05-10 20:55:30
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hqixia

金虫 (小有名气)


引用回帖:
6楼: Originally posted by xuehaier at 2012-05-09 21:22:06:
嵌入 多元环结构易产生嵌入作用

那为什么MB与ssDNA结合比与dsDNA更强烈?这个怎么解释??谢谢指导~~
16楼2012-05-10 22:15:32
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简单回复
2012-05-10 08:04   回复  
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3楼: Originally posted by hqixia at 2012-05-09 20:29:03: 我也想知道~~~MB和双链DNA的作用模式到底是怎么样的?

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