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181805776

铁虫 (正式写手)

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专业: 药物化学

[求助] 求助怎么将Sybyl中的database中的分子批量优化以及加氢

求助怎么将Sybyl中的database中的分子批量优化以及加氢，因为有100个要与蛋白质对接，手动一个一个优化加氢太累了，求助各位前辈。
据说导入批量分子的时候，Spreadsheent窗口中选择Compute菜单——Minimize就可以批量优化了，但是好像还是每次都只能优化一个啊？

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1楼 2012-05-07 19:40:24

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sports07

新虫 (初入文坛)

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专业: 生物化学

【答案】应助回帖

★ ★
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2012-05-12 15:19:18

打开database之后，compute-minimize-跳出一个小框框，点ok，意思好像是会覆盖原来的mol2文件，然后选择优化参数，然后ok，就可以了。但是发现每个分子优化时间4s左右，远比一个个优化要短，优化之后我尝试过单独优化，发现总体不会变化太多。

3楼2012-05-12 00:34:32

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tenkou

新虫 (初入文坛)

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【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
zh1987hs: 金币+1, 谢谢 2012-05-08 20:29:22

全部选中分子，然后再点compute

2楼2012-05-08 18:09:55

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