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111222000

金虫 (正式写手)

[交流] 计算断键？？ 已有3人参与

最近计算一种30多原子的CHON化合物，用hf、3-21g结构优化，结果高斯能正常结束，但是用GV打开一看，我的化合物被优化的四分五裂，本来一种化合物，结果被弄成了四部分碎片，虽然GV中的那根棒棒只是一种形式，单这也太离谱了，求教这是什么原因？如何修改？谢谢

[ Last edited by 111222000 on 2012-5-5 at 22:51 ]
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1楼 2012-05-05 22:47:29
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zhangmt

至尊木虫 (著名写手)

我叫MT
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
根据2001年高压物理学报《利用分子轨道法计算黑索金的生成热和分子结构》文章给出的黑索金结构，属于扭曲的船式结构，但三个硝基的N都是sp2杂化，硝基链接的N原子也是sp2杂化（近似），所以，很难说是平伏键还是直立键。当然，它的结构是PM3优的，可信度难说。另外，NO2换成NF2，N的杂化似乎应该变成Sp3，这样结构的变化又不好预测。感觉上小虫画的两个直立键一个平伏键的椅式结构有一定道理。而三个平伏键的船式结构也未尝不可。这个就像小虫说的那样，楼主有的忙了，要多算几个构型对比一下了。DFT应该是要优于HF的，鉴于F的电负性，弥散应该是要的。变形估计不小，极化也是必须的。就这么几个小原子，计算起来应该是比较快的。
其实，不是说HF就算不好，但是如果结果太离谱，我感觉初始结构不好一般来说占的可能性更大，尤其不是搞计算化学的，做实验的把计算看得很简单，似乎就是个黑匣子，扔里就能出结果。呵呵。要真是这样，该有多好。
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一群自以为正义凛然的年轻人将一切不能以科学解释的事情定性为封建迷信并大刀阔斧地进行消灭，其实这是修养不足学识浅薄的一种体现，也是可恶的偏执和愚蠢的自以
8楼2012-05-07 13:17:58
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zhangmt

至尊木虫 (著名写手)

我叫MT
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
gmy1990: 金币+2 2012-05-06 14:49:43
没有足够的信息，初步猜测是初始结构太离谱导致的。。解决方案，给一个合理的初始结构，重新优化。。
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一群自以为正义凛然的年轻人将一切不能以科学解释的事情定性为封建迷信并大刀阔斧地进行消灭，其实这是修养不足学识浅薄的一种体现，也是可恶的偏执和愚蠢的自以
2楼2012-05-05 23:58:35
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111222000

金虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by zhangmt at 2012-05-05 23:58:35:
没有足够的信息，初步猜测是初始结构太离谱导致的。。解决方案，给一个合理的初始结构，重新优化。。

我用GV画图，如何使初始结构更合理呢？谢谢
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3楼2012-05-06 11:43:33
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lishijunzong

铁杆木虫 (正式写手)
把结构放上来看看
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4楼2012-05-06 12:13:40
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