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yi315730581

木虫 (正式写手)

[求助] vasp5.2计算E-V曲线

最近将vasp4.6,换成了5.2,采用4.6计算E-V曲线的脚本文件run文件不能在5.2上运行,是因为5.2更新了脚本文件还是由于其它原因造成的?望各位虫友不吝赐教啊,小弟感激不尽
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bingmou

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
liliangfang: 金币+2, 谢谢交流 2012-05-05 09:52:54
franch: 专家考核 2012-05-07 12:36:47
yi315730581: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2012-05-29 08:23:06
首先,是你的环境变量有问题,至少系统找不到vasp这个可执行文件。
其次,我觉得你的脚本也有我问题,a应该是长度单位,那么280A实在太大了,我怀疑是2.82这个量级才对,或284这个应该优化之后的体积
6楼2012-05-05 06:11:26
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dxf_dxf_dxf

银虫 (小有名气)

请给出更多的信息以便大家更好的帮助你:
  你所使用的脚本文件内容
  你的INCAR文件内容
  运行后stdout和stderr内容(如果是集群,为xxx.exxx和xxx.oxxx两个文件)
CODE:
tail OUTCAR

结果
2楼2012-05-03 18:28:16
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fzx2008

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
liliangfang: 金币+1, 多谢指教 2012-05-04 08:52:29
两个版本
确实有些地方有些不同
需要根据实际情况来修正一下脚本
3楼2012-05-04 00:14:17
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yi315730581

木虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by fzx2008 at 2012-05-04 00:14:17:
两个版本
确实有些地方有些不同
需要根据实际情况来修正一下脚本

下面是计算时LOG文件提示
a= -252
./run: line 39: vasp: command not found
tail: 无法打开"OSZICAR" 读取数据: 没有那个文件或目录
a= -254
./run: line 39: vasp: command not found
tail: 无法打开"OSZICAR" 读取数据: 没有那个文件或目录
a= -256
./run: line 39: vasp: command not found
tail: 无法打开"OSZICAR" 读取数据: 没有那个文件或目录
a= -258
./run: line 39: vasp: command not found
tail: 无法打开"OSZICAR" 读取数据: 没有那个文件或目录
a= -260
如果要进行修正,您是否知道E-V脚本如何修正,
这是4.6里面的run脚本文件,在5.2要怎么改呢?
for a in -276 -278 -280 -282 -284 -286 -288 -290 -292
do
echo "a= $a"

cat >POSCAR <   system=Sm2O3-mc
$a ! opt v=284.34
   9.4358829241445026    0.0093440932014115    0.0000000000000000
     0.0093440932014115    9.4358829241445026    0.0000000000000000
     0.0000000000000000    0.0000000000000000    3.1935538427218289
   3   5  16
Direct
  0.0000000000000000  0.0000000000000000  0.0000000000000000
  0.5000000000000000  0.0000000000000000  0.0000000000000000
  0.0000000000000000  0.5000000000000000  0.0000000000000000
  0.5000000000000000  0.5000000000000000  0.0000000000000000
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  0.6558114838898069  0.6558114838898069  0.0000000000000000
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  0.5876280207777420  0.9100961576735108  0.5000000000000000
!

vasp


E=`tail -1 OSZICAR`
echo $a $E >>SUMMARY

done
真正的人生属于力争上游的人
4楼2012-05-04 09:57:09
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