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可米kemi

银虫 (小有名气)

[求助] 环糊精包合物中怎么手动设置XYZ轴 已有1人参与

我在对一个环糊精包合物结构优化后,想看看客体分子在环糊精中的插入程度。请问:
    1.在这个过程中我应该怎么手动设置XYZ轴,从而确定XYZ平面?
    2.在设XYZ轴的时候,应该以什么为固定点,糖苷键么?
    求高手解答,谢谢。
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29050801

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

1.在这个过程中我应该怎么手动设置XYZ轴,从而确定XYZ平面?
    2.在设XYZ轴的时候,应该以什么为固定点,糖苷键么?
--------------------
1.
我是先找了三个氧原子,然后依次确定中心;
用三个氧原子确定所在平面的法线;
法线和中心,就可以得到轴线,其他的就随意定了

2.
第一个已经说到了

以上为自己采用的方法
不一定对
仅供参考
个人主页http://cnrdn.com/pXg5
2楼2014-12-16 11:14:44
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