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可米kemi

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[求助] 环糊精包合物中怎么手动设置XYZ轴已有1人参与

我在对一个环糊精包合物结构优化后，想看看客体分子在环糊精中的插入程度。请问：
1.在这个过程中我应该怎么手动设置XYZ轴，从而确定XYZ平面？
2.在设XYZ轴的时候，应该以什么为固定点，糖苷键么？
求高手解答，谢谢。

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1楼2012-05-02 22:51:13

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29050801

新虫 (小有名气)

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【答案】应助回帖

1.在这个过程中我应该怎么手动设置XYZ轴，从而确定XYZ平面？
2.在设XYZ轴的时候，应该以什么为固定点，糖苷键么？
--------------------
1.
我是先找了三个氧原子，然后依次确定中心；
用三个氧原子确定所在平面的法线；
法线和中心，就可以得到轴线，其他的就随意定了

2.
第一个已经说到了

以上为自己采用的方法
不一定对
仅供参考

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2楼2014-12-16 11:14:44

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