应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 请教，CoMFA多个分子做模板怎么操作？非常感谢！
51/1返回列表
查看: 1186  |  回复: 6
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

zhenguo86

木虫 (著名写手)

[求助] 请教，CoMFA多个分子做模板怎么操作？非常感谢！

请教，CoMFA多个分子做模板怎么操作？非常感谢！
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2012-04-29 19:24:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zlp-lw

木虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by ky96998 at 2012-05-09 22:02:02
一般就选择活性最高那个分子做模板，选取模版分子共同骨架上面的某些原子进行叠合就行了。...

您好，请教一下，模板分子的共同骨架在选择的时候有没有什么要求？是随便选择的吗？
赞一下 回复此楼
5楼2013-04-13 15:21:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答

ky96998

金虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★
zh1987hs: 金币+4, 谢谢 2012-05-03 11:13:31
楼主没有把问题说清楚，你所说的多个分子做模版，到底是这些分子有共同（相似）的骨架呢还是没有共同（相似）的骨架呢？这个不得而知。如果骨架相同或者相似可以选取原子来叠合啊。如果没有相同（相似）的骨架而有受体结构，也知道活性化合物与受体的结合信息（药效元素作用信息），那就可以采取分子对接的方式来叠合，这时候选择对接构象时要根据正确的药效元素作用方式来选择。如果不符合以上两种情况可能就不好做了。
赞一下 回复此楼
2楼2012-05-02 17:13:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhenguo86

木虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by ky96998 at 2012-05-02 17:13:02:
楼主没有把问题说清楚，你所说的多个分子做模版，到底是这些分子有共同（相似）的骨架呢还是没有共同（相似）的骨架呢？这个不得而知。如果骨架相同或者相似可以选取原子来叠合啊。如果没有相同（相似）的骨架而有 ...

有共同骨架，分子很相似，做CoMFA，将几个活性最高的化合物叠合到一起之后怎样用它作为模板，来进行下一步的训练集叠合，非常感谢Sybyl初学很多基本操作不会
赞一下 回复此楼
3楼2012-05-03 09:55:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ky96998

金虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by zhenguo86 at 2012-05-03 09:55:04:
有共同骨架，分子很相似，做CoMFA，将几个活性最高的化合物叠合到一起之后怎样用它作为模板，来进行下一步的训练集叠合，非常感谢Sybyl初学很多基本操作不会

一般就选择活性最高那个分子做模板，选取模版分子共同骨架上面的某些原子进行叠合就行了。
赞一下 回复此楼
4楼2012-05-09 22:02:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭