应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 请教，CoMFA多个分子做模板怎么操作？非常感谢！
51/1返回列表
查看: 1534  |  回复: 6
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

zhenguo86

木虫 (著名写手)

[求助] 请教，CoMFA多个分子做模板怎么操作？非常感谢！

请教，CoMFA多个分子做模板怎么操作？非常感谢！
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2012-04-29 19:24:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhenguo86

木虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by ky96998 at 2012-05-02 17:13:02:
楼主没有把问题说清楚，你所说的多个分子做模版，到底是这些分子有共同（相似）的骨架呢还是没有共同（相似）的骨架呢？这个不得而知。如果骨架相同或者相似可以选取原子来叠合啊。如果没有相同（相似）的骨架而有 ...

有共同骨架，分子很相似，做CoMFA，将几个活性最高的化合物叠合到一起之后怎样用它作为模板，来进行下一步的训练集叠合，非常感谢Sybyl初学很多基本操作不会
赞一下 回复此楼
3楼2012-05-03 09:55:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答

ky96998

金虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★
zh1987hs: 金币+4, 谢谢 2012-05-03 11:13:31
楼主没有把问题说清楚，你所说的多个分子做模版，到底是这些分子有共同（相似）的骨架呢还是没有共同（相似）的骨架呢？这个不得而知。如果骨架相同或者相似可以选取原子来叠合啊。如果没有相同（相似）的骨架而有受体结构，也知道活性化合物与受体的结合信息（药效元素作用信息），那就可以采取分子对接的方式来叠合，这时候选择对接构象时要根据正确的药效元素作用方式来选择。如果不符合以上两种情况可能就不好做了。
赞一下 回复此楼
2楼2012-05-02 17:13:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ky96998

金虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by zhenguo86 at 2012-05-03 09:55:04:
有共同骨架，分子很相似，做CoMFA，将几个活性最高的化合物叠合到一起之后怎样用它作为模板，来进行下一步的训练集叠合，非常感谢Sybyl初学很多基本操作不会

一般就选择活性最高那个分子做模板，选取模版分子共同骨架上面的某些原子进行叠合就行了。
赞一下 回复此楼
4楼2012-05-09 22:02:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zlp-lw

木虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by ky96998 at 2012-05-09 22:02:02
一般就选择活性最高那个分子做模板，选取模版分子共同骨架上面的某些原子进行叠合就行了。...

您好，请教一下，模板分子的共同骨架在选择的时候有没有什么要求？是随便选择的吗？
赞一下 回复此楼
5楼2013-04-13 15:21:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 申请科研项目纯靠实力能成功吗？ 200+5 David1982 2026-10-13 8/400 2026-10-14 21:38 by lhw_GPA4.0
[硕博家园] 中科院海洋所招收海洋材料相关领域博士研究生及研究助理 +3 sujiner 2026-10-08 4/200 2026-10-14 20:40 by qicaiyun
[有机交流] OpenAI又攻克数学难题了，离AI做有机合成还有多远？ +8 wangyl_123 2026-10-10 13/650 2026-10-14 15:12 by zuesli
[教师之家] 课题组会帮你通过考核么？ +4 好运来～9527 2026-10-10 7/350 2026-10-13 08:41 by xli1984
[基金申请] 入职后第一次管课题组的专利缴费，对账才发现官费比别人多掏了一倍 +6 13108017953 2026-10-08 6/300 2026-10-12 20:07 by w3w3y3
[公派出国] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 9/450 2026-10-11 22:34 by XQNyDCa1Tk5n
[公派出国] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 22:26 by XQNyDCa1Tk5n
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 9/450 2026-10-11 22:15 by XQNyDCa1Tk5n
[考博] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 22:11 by XQNyDCa1Tk5n
[教师之家] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 (EPI+-1)(金币-50) +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 22:06 by XQNyDCa1Tk5n
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 (EPI+-1)(金币-50) +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 14:25 by VOMexwnDzOFZ
[教师之家] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 (EPI+-1)(金币-50) +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 14:05 by VOMexwnDzOFZ
[考研] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 13:51 by VOMexwnDzOFZ
[硕博家园] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 13:45 by VOMexwnDzOFZ
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 10:54 by VOMexwnDzOFZ
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 10:34 by VOMexwnDzOFZ
[考博] 招收博士生一名 +3 mandolin 2026-10-10 3/150 2026-10-11 10:21 by 不是山谷！
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 4/200 2026-10-11 03:14 by M0zrYVSAnxpE
[有机交流] 各位大佬，路线设计求助 +6 zapen 2026-10-08 8/400 2026-10-10 15:59 by zapen
[有机交流] 我应该选哪条合成路线让实验成功率高一些？ +5 jing816y 2026-10-08 9/450 2026-10-10 09:05 by zapen
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭