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320080920001

金虫 (正式写手)

引用回帖:
17楼: Originally posted by wanglei512 at 2012-04-23 10:06:26:
没看出来KpnI这个点有啥作用,你为啥要用KpnI切,你的目的片段两头既然是PmlI,那么你的骨架两头也应该是PmlI,

对啊 我当时做错了 一时糊涂 但是后来只用PmlI切了之后还是没有连接成功
21楼2012-04-28 18:06:12
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320080920001

金虫 (正式写手)

320080920001: 回帖置顶 2012-04-28 19:43:10
前几天和老板一起去苏州听冷泉港亚洲会议去了 没有做实验 现在把载体的图发上来 不过我还是得做平末端连接 不知道怎么办啊 主要是没找到失败原因
22楼2012-04-28 18:29:10
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320080920001

金虫 (正式写手)

320080920001: 回帖置顶 2012-04-28 19:44:58
补图片





23楼2012-04-28 19:44:48
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weigh1111

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

我觉得楼主载体加多了片段加少了~像这种连接的话片段怎么着也该是载体量的5倍以上吧。而且体系可以调到15微升,载体和片段DNA都多加点,比如载体2微升片段7微升这种比例,相应的水少加点。连接是一个概率性的事件,DNA量加大了,出的概率也会更大。平末端连接我觉得16度过夜就差不多了,22度连粘末端没问题,连平端可能稍微嫌高了一点,4度温度太低了酶活性可能不太好。
24楼2012-05-07 20:37:23
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320080920001

金虫 (正式写手)

320080920001: 回帖置顶 2012-05-08 00:09:53
各位好 我的连接做出来了 原因我觉得是T4 ligase buffer的问题,我重新订了一管酶和buffer,连接体系不变,就做出来了,后来16度连接两小时(老板逼的,我是不相信,可是结果让我不得不信了),也出来了。 结果有些戏剧性,不过还是挺感谢那些给出建议和分析的好心人,我也给你人回过贴,知道强忍着分析一个问题的不易,感谢你们,祝大家实验顺利,多发Paper。 有一句话,叫做出来的实验都一样,失败的实验千万种啊!
25楼2012-05-08 00:09:44
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9921218

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
25楼: Originally posted by 320080920001 at 2012-05-08 00:09:44:
各位好 我的连接做出来了 原因我觉得是T4 ligase buffer的问题,我重新订了一管酶和buffer,连接体系不变,就做出来了,后来16度连接两小时(老板逼的,我是不相信,可是结果让我不得不信了),也出来了。 结果有 ...

你好,很关注你的帖子。
我的连接也出状况了
我的载体是EcoRⅤ单酶切 后切胶回收,然后用的CIAP去磷酸化(65℃  30min   试剂盒回收)。目的片段是SacⅡ酶切后,用DNA PolymeraseⅠ切口平移变成平末端。
载体 92ng/ul  目的片段250ng/ul    连接比例做过8:1   10:1  ,16℃水浴锅过夜连接。
转化zeocin平板   什么都不长
我找不到原因了   想问问有什么建议么?
七彩泡泡
26楼2012-05-14 19:33:49
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9921218

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
25楼: Originally posted by 320080920001 at 2012-05-08 00:09:44:
各位好 我的连接做出来了 原因我觉得是T4 ligase buffer的问题,我重新订了一管酶和buffer,连接体系不变,就做出来了,后来16度连接两小时(老板逼的,我是不相信,可是结果让我不得不信了),也出来了。 结果有 ...

你好,很关注你的帖子。
我的连接也出状况了
我的载体是EcoRⅤ单酶切 后切胶回收,然后用的CIAP去磷酸化(65℃  30min   试剂盒回收)。目的片段是SacⅡ酶切后,用DNA PolymeraseⅠ切口平移变成平末端。
载体 92ng/ul  目的片段250ng/ul    连接比例做过8:1   10:1  ,16℃水浴锅过夜连接。
转化zeocin平板   什么都不长
我找不到原因了   想问问有什么建议么?
七彩泡泡
27楼2012-05-14 19:34:40
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320080920001

金虫 (正式写手)

引用回帖:
27楼: Originally posted by 9921218 at 2012-05-14 19:34:40:
你好,很关注你的帖子。
我的连接也出状况了
我的载体是EcoRⅤ单酶切 后切胶回收,然后用的CIAP去磷酸化(65℃  30min   试剂盒回收)。目的片段是SacⅡ酶切后,用DNA PolymeraseⅠ切口平移变成平末端。
载体 ...

我没用过zeocin的板子 不知道有没有确认板子的抗性 还有关于你的连接buffer的使用次数 最好一次化开后分装,每次取一支用,还有你的DNA polymerase I 是带有3‘——5’的外切酶活性吗?这个需要确认一下。每一步实验后要有对照试验。
28楼2012-05-14 23:18:58
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9921218

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
28楼: Originally posted by 320080920001 at 2012-05-14 23:18:58:
我没用过zeocin的板子 不知道有没有确认板子的抗性 还有关于你的连接buffer的使用次数 最好一次化开后分装,每次取一支用,还有你的DNA polymerase I 是带有3‘——5’的外切酶活性吗?这个需要确认一下。每一步实

你好  抗生素的问题可以排除,我做过质粒的转化,长了菌落。我用的连接酶是TKARA的高效连接酶SoutionⅠ,酶和缓冲液是mix的。我的平移活性的酶之前也做过别的连接,也没有问题。
七彩泡泡
29楼2012-05-22 10:30:13
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320080920001

金虫 (正式写手)

引用回帖:
29楼: Originally posted by 9921218 at 2012-05-22 10:30:13:
你好  抗生素的问题可以排除,我做过质粒的转化,长了菌落。我用的连接酶是TKARA的高效连接酶SoutionⅠ,酶和缓冲液是mix的。我的平移活性的酶之前也做过别的连接,也没有问题。

不知道你的Mix是否有问题 我换了buffer就做出来了
30楼2012-05-22 19:17:38
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