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dongwen176木虫 (小有名气)
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MOLCAS并行计算安装方法
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molcas单核计算的程序好安装，但是并行的不太好弄， 步骤是先安装mpich，再安装ga，再安装molcas 最近在fedora8,和fedora14下安装，mpich和mpich2都尝试过了，安装ga也哼成功，但是测试总是通不过，后面的molcas安装虽然也可以，但是总是无法实现并行计算。molcas内置ga版本较低，谁能提供一套完整的molcas并行计算安装方法，包括附带软件的安装。 或者帮我看看ga测试的结果： > Checking sdot ... fdot wrong 3156754.75 0. 0:0:... exiting:: 0 0:0:... exiting:: 0 Last System Error Message from Task 0:: Resource temporarily unavailable [0] MPI Abort by user Aborting program ! [0] Aborting program! p0_13966: p4_error: : 0 Interrupt Killed by signal 2. p0_13966: (4.250000) net_send: could not write to fd=4, errno = 32 |
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我只安装molcas74时，遇到的错误提示是一样的。 这是安装时的提示信息 *** *** Installing molcas databases *** molcas mkhelp molcas extract Please wait .... /usr/bin/sh sbin/firstrun ********* Molcas installation failed ********* ** ** ** Check the content of files: ** ** Test/Failed_Tests/test000.err ** ** and Test/Failed_Tests/test000.log ** ** for more information ** ** ** ********************************************** make: *** [data/ABDATA] Error 1 这是test000.log /public/software/intel/composer_xe_2011_sp1.7.256/mpirt/bin/intel64/mpirun: line 86: /public/software/intel/composer_xe_2011_sp1.7.256/mpirt/bin/intel64/mpivars.sh: No such file or directory /public/software/intel/composer_xe_2011_sp1.7.256/mpirt/bin/intel64/mpirun: line 86: /public/software/intel/composer_xe_2011_sp1.7.256/mpirt/bin/intel64/mpivars.sh: No such file or directory --- Start Module: auto at Thu Apr 19 11:56:50 2012 >>> Export MOLCAS_PRINT=VERBOSE /public/software/intel/composer_xe_2011_sp1.7.256/mpirt/bin/intel64/mpirun: line 86: /public/software/intel/composer_xe_2011_sp1.7.256/mpirt/bin/intel64/mpivars.sh: No such file or directory /public/software/intel/composer_xe_2011_sp1.7.256/mpirt/bin/intel64/mpirun: line 86: /public/software/intel/composer_xe_2011_sp1.7.256/mpirt/bin/intel64/mpivars.sh: No such file or directory /public/software/intel/composer_xe_2011_sp1.7.256/mpirt/bin/intel64/mpirun: line 86: /public/software/intel/composer_xe_2011_sp1.7.256/mpirt/bin/intel64/mpivars.sh: No such file or directory --- Start Module: gateway at Thu Apr 19 11:56:52 2012 /public/software/intel/composer_xe_2011_sp1.7.256/mpirt/bin/intel64/mpirun: line 86: /public/software/intel/composer_xe_2011_sp1.7.256/mpirt/bin/intel64/mpivars.sh: No such file or directory Command exited with non-zero status 255 real 0.39 user 0.26 sys 0.06 --- Stop Module: gateway at Thu Apr 19 11:56:52 2012 /rc=255 (Unknown) --- --- Stop Module: auto at Thu Apr 19 11:56:52 2012 /rc=255 (Unknown) --- |
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