| 查看: 2299 | 回复: 5 | ||||
dongwen176木虫 (小有名气)
|
[求助]
MOLCAS并行计算安装方法
|
|
molcas单核计算的程序好安装，但是并行的不太好弄， 步骤是先安装mpich，再安装ga，再安装molcas 最近在fedora8,和fedora14下安装，mpich和mpich2都尝试过了，安装ga也哼成功，但是测试总是通不过，后面的molcas安装虽然也可以，但是总是无法实现并行计算。molcas内置ga版本较低，谁能提供一套完整的molcas并行计算安装方法，包括附带软件的安装。 或者帮我看看ga测试的结果： > Checking sdot ... fdot wrong 3156754.75 0. 0:0:... exiting:: 0 0:0:... exiting:: 0 Last System Error Message from Task 0:: Resource temporarily unavailable [0] MPI Abort by user Aborting program ! [0] Aborting program! p0_13966: p4_error: : 0 Interrupt Killed by signal 2. p0_13966: (4.250000) net_send: could not write to fd=4, errno = 32 |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 计算 |
» 猜你喜欢
200年来人们一直无法破解的难题： 气液临界点状态方程
已经有7人回复
-
细胞培养，这22个细节一定要注意！（一）
已经有0人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有145人回复
-
关于引力延迟下双星系统角动量不守恒的疑惑---求高手解答！
已经有10人回复
-
CSC访学博后项目获批，外方学校暂停合作该怎么办？
已经有51人回复
-
请问四氢呋喃溶解的聚合物用甲醇沉淀时，如何使沉淀过程加速？
已经有2人回复
-
Chemical Bonding at Surfaces and Interfaces,最经典的一本表面上化学相互作用教材
已经有0人回复
-
分子动力学模拟合作需求
已经有0人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- GPU并行计算C语言书籍或者源代码
已经有7人回复
- 远程登录linux系统如何实现fluent并行计算？
已经有6人回复
- 6core 的机器适合并行计算吗？
已经有3人回复
- gaussian 03Revison-E01版在Window 下不能并行计算啊!
已经有9人回复
- 【求助完结】Linux系统下MS5.5的并行计算调度问题
已经有12人回复
- 【整理】今天整理硬盘上的资料，偶然发现的好玩的小东西就直接发上来吧
已经有105人回复
- 【求助】单机多核UDF怎么并行计算
已经有15人回复
nxh2007
新虫 (初入文坛)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 1899.5
- 帖子: 13
- 在线: 73.5小时
- 虫号: 1328421
- 注册: 2011-06-22
- 性别: GG
- 专业: 原子和分子物理
2楼2012-04-18 18:26:32
dongwen176
木虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 1831.3
- 红花: 1
- 帖子: 179
- 在线: 195.6小时
- 虫号: 91819
- 注册: 2005-09-07
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
3楼2012-04-19 12:22:32
nxh2007
新虫 (初入文坛)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 1899.5
- 帖子: 13
- 在线: 73.5小时
- 虫号: 1328421
- 注册: 2011-06-22
- 性别: GG
- 专业: 原子和分子物理
|
我只安装molcas74时，遇到的错误提示是一样的。 这是安装时的提示信息 *** *** Installing molcas databases *** molcas mkhelp molcas extract Please wait .... /usr/bin/sh sbin/firstrun ********* Molcas installation failed ********* ** ** ** Check the content of files: ** ** Test/Failed_Tests/test000.err ** ** and Test/Failed_Tests/test000.log ** ** for more information ** ** ** ********************************************** make: *** [data/ABDATA] Error 1 这是test000.log /public/software/intel/composer_xe_2011_sp1.7.256/mpirt/bin/intel64/mpirun: line 86: /public/software/intel/composer_xe_2011_sp1.7.256/mpirt/bin/intel64/mpivars.sh: No such file or directory /public/software/intel/composer_xe_2011_sp1.7.256/mpirt/bin/intel64/mpirun: line 86: /public/software/intel/composer_xe_2011_sp1.7.256/mpirt/bin/intel64/mpivars.sh: No such file or directory --- Start Module: auto at Thu Apr 19 11:56:50 2012 >>> Export MOLCAS_PRINT=VERBOSE /public/software/intel/composer_xe_2011_sp1.7.256/mpirt/bin/intel64/mpirun: line 86: /public/software/intel/composer_xe_2011_sp1.7.256/mpirt/bin/intel64/mpivars.sh: No such file or directory /public/software/intel/composer_xe_2011_sp1.7.256/mpirt/bin/intel64/mpirun: line 86: /public/software/intel/composer_xe_2011_sp1.7.256/mpirt/bin/intel64/mpivars.sh: No such file or directory /public/software/intel/composer_xe_2011_sp1.7.256/mpirt/bin/intel64/mpirun: line 86: /public/software/intel/composer_xe_2011_sp1.7.256/mpirt/bin/intel64/mpivars.sh: No such file or directory --- Start Module: gateway at Thu Apr 19 11:56:52 2012 /public/software/intel/composer_xe_2011_sp1.7.256/mpirt/bin/intel64/mpirun: line 86: /public/software/intel/composer_xe_2011_sp1.7.256/mpirt/bin/intel64/mpivars.sh: No such file or directory Command exited with non-zero status 255 real 0.39 user 0.26 sys 0.06 --- Stop Module: gateway at Thu Apr 19 11:56:52 2012 /rc=255 (Unknown) --- --- Stop Module: auto at Thu Apr 19 11:56:52 2012 /rc=255 (Unknown) --- |
4楼2012-04-19 14:44:08
nxh2007
新虫 (初入文坛)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 1899.5
- 帖子: 13
- 在线: 73.5小时
- 虫号: 1328421
- 注册: 2011-06-22
- 性别: GG
- 专业: 原子和分子物理
5楼2012-04-19 14:50:24
dongwen176
木虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 1831.3
- 红花: 1
- 帖子: 179
- 在线: 195.6小时
- 虫号: 91819
- 注册: 2005-09-07
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
6楼2012-04-19 15:35:24
10