24小时热门版块排行榜    

查看: 2286  |  回复: 5
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

dongwen176

木虫 (小有名气)

[求助] MOLCAS并行计算安装方法

molcas单核计算的程序好安装,但是并行的不太好弄,
步骤是先安装mpich,再安装ga,再安装molcas
最近在fedora8,和fedora14下安装,mpich和mpich2都尝试过了,安装ga也哼成功,但是测试总是通不过,后面的molcas安装虽然也可以,但是总是无法实现并行计算。molcas内置ga版本较低,谁能提供一套完整的molcas并行计算安装方法,包括附带软件的安装。


或者帮我看看ga测试的结果:
> Checking sdot ...
  fdot wrong   3156754.75  0.
0:0:... exiting:: 0
0:0:... exiting:: 0
Last System Error Message from Task 0:: Resource temporarily unavailable
[0] MPI Abort by user Aborting program !
[0] Aborting program!
p0_13966:  p4_error: : 0
Interrupt
Killed by signal 2.
p0_13966: (4.250000) net_send: could not write to fd=4, errno = 32
回复此楼
将进酒,君莫停!
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

nxh2007

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by dongwen176 at 2012-04-19 12:22:32:
前面两个软件都不用装,因为并行计算才用到。

我只安装molcas74时,遇到的错误提示是一样的。
这是安装时的提示信息
***
*** Installing molcas databases
***

molcas mkhelp
molcas extract
Please wait ....
/usr/bin/sh sbin/firstrun
  ********* Molcas installation failed *********
  **                                          **
  **  Check the content of files:             **
  **          Test/Failed_Tests/test000.err   **
  **    and   Test/Failed_Tests/test000.log   **
  **  for more information                    **
  **                                          **
  **********************************************
make: *** [data/ABDATA] Error 1




这是test000.log   
/public/software/intel/composer_xe_2011_sp1.7.256/mpirt/bin/intel64/mpirun: line 86: /public/software/intel/composer_xe_2011_sp1.7.256/mpirt/bin/intel64/mpivars.sh: No such file or directory
/public/software/intel/composer_xe_2011_sp1.7.256/mpirt/bin/intel64/mpirun: line 86: /public/software/intel/composer_xe_2011_sp1.7.256/mpirt/bin/intel64/mpivars.sh: No such file or directory
--- Start Module: auto at Thu Apr 19 11:56:50 2012
>>> Export MOLCAS_PRINT=VERBOSE
/public/software/intel/composer_xe_2011_sp1.7.256/mpirt/bin/intel64/mpirun: line 86: /public/software/intel/composer_xe_2011_sp1.7.256/mpirt/bin/intel64/mpivars.sh: No such file or directory
/public/software/intel/composer_xe_2011_sp1.7.256/mpirt/bin/intel64/mpirun: line 86: /public/software/intel/composer_xe_2011_sp1.7.256/mpirt/bin/intel64/mpivars.sh: No such file or directory
/public/software/intel/composer_xe_2011_sp1.7.256/mpirt/bin/intel64/mpirun: line 86: /public/software/intel/composer_xe_2011_sp1.7.256/mpirt/bin/intel64/mpivars.sh: No such file or directory
--- Start Module: gateway at Thu Apr 19 11:56:52 2012
/public/software/intel/composer_xe_2011_sp1.7.256/mpirt/bin/intel64/mpirun: line 86: /public/software/intel/composer_xe_2011_sp1.7.256/mpirt/bin/intel64/mpivars.sh: No such file or directory
Command exited with non-zero status 255
real 0.39
user 0.26
sys 0.06
--- Stop Module: gateway at Thu Apr 19 11:56:52 2012 /rc=255 (Unknown) ---
--- Stop Module: auto at Thu Apr 19 11:56:52 2012 /rc=255 (Unknown) ---
4楼2012-04-19 14:44:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

nxh2007

新虫 (初入文坛)

弱弱的问一下
我安装单核计算的molcas  怎么老不成功呢
我先装sharutils-4.6.3 再装了maich-1.2.7pl  又装了molcas74

为什么最终老是运行不成呢
2楼2012-04-18 18:26:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dongwen176

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by nxh2007 at 2012-04-18 18:26:32:
弱弱的问一下
我安装单核计算的molcas  怎么老不成功呢
我先装sharutils-4.6.3 再装了maich-1.2.7pl  又装了molcas74

为什么最终老是运行不成呢

前面两个软件都不用装,因为并行计算才用到。
将进酒,君莫停!
3楼2012-04-19 12:22:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

nxh2007

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by dongwen176 at 2012-04-19 12:22:32:
前面两个软件都不用装,因为并行计算才用到。

你能把molcas软件发过来么。 不胜感激  
nxh20075040@126.com
5楼2012-04-19 14:50:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[公派出国] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全 +3 5lbyq5wrhb 2026-02-07 3/150 2026-02-08 03:05 by vs90ilomwc
[考博] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全 +3 5lbyq5wrhb 2026-02-07 3/150 2026-02-08 02:52 by vs90ilomwc
[论文投稿] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全 +3 3rkserf6qr 2026-02-07 4/200 2026-02-08 02:45 by vs90ilomwc
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全 +3 3rkserf6qr 2026-02-07 3/150 2026-02-08 02:32 by vs90ilomwc
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全 +5 2h7du0nuhk 2026-02-07 5/250 2026-02-08 02:27 by vs90ilomwc
[考博] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全 +5 2h7du0nuhk 2026-02-07 5/250 2026-02-08 02:25 by vs90ilomwc
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全 +4 2h7du0nuhk 2026-02-07 5/250 2026-02-08 02:12 by vs90ilomwc
[考博] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全 +4 2h7du0nuhk 2026-02-07 6/300 2026-02-08 02:07 by vs90ilomwc
[教师之家] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全 +4 2h7du0nuhk 2026-02-07 6/300 2026-02-08 02:05 by vs90ilomwc
[公派出国] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全 +4 2h7du0nuhk 2026-02-07 7/350 2026-02-08 01:45 by vs90ilomwc
[考博] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全 +4 2h7du0nuhk 2026-02-07 7/350 2026-02-08 01:32 by vs90ilomwc
[教师之家] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全 +4 2h7du0nuhk 2026-02-07 7/350 2026-02-08 01:26 by vs90ilomwc
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全 +4 2h7du0nuhk 2026-02-07 7/350 2026-02-08 01:12 by vs90ilomwc
[教师之家] 有院领导为了换新车,用横向课题经费买了俩车 +7 瞬息宇宙 2026-02-04 7/350 2026-02-07 21:47 by tfang
[有机交流] 酰胺脱乙酰基 10+5 chibby 2026-02-03 12/600 2026-02-07 19:29 by 江东闲人
[基金申请] 有时候真觉得大城市人没有县城人甚至个体户幸福 +9 苏东坡二世 2026-02-04 10/500 2026-02-07 12:37 by 小毛球
[考博] 天津大学招2026.09的博士生,欢迎大家推荐交流(博导是本人) +4 a793625982 2026-02-05 5/250 2026-02-07 10:57 by a793625982
[公派出国] CSC & MSCA 博洛尼亚大学能源材料课题组博士/博士后招生|MSCA经费充足、排名优 +4 雨念 2026-02-01 6/300 2026-02-06 23:32 by MelissaPon
[基金申请] 面上项目申报 +3 Tide man 2026-02-01 3/150 2026-02-05 22:56 by god_tian
[硕博家园] 博士延得我,科研能力直往上蹿 +7 偏振片 2026-02-02 7/350 2026-02-04 17:36 by 陈氏帝国
信息提示
请填处理意见