| 查看: 2316 | 回复: 14 | ||
| 本帖产生 1 个 BioEPI ，点击这里进行查看 | ||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||
[求助]
请问怎样根据ID号删除序列
|
||
我有一个ID文件和一个FASTA格式的数据库文件，请问怎样能根据ID文件里的内容删除数据库里的序列，unix命令好像能解决，但不会用。请高手帮忙啊 |
回复此楼» 猜你喜欢
请问社科规划办官网上的“项目查询模块”与“项目申报模块”的账号密码一样吗？
已经有3人回复
-
用NBS溴化时溶剂除了CCl4外还有什么
已经有9人回复
-
40+中年人失业后，还能找到好工作吗？
已经有15人回复
-
二审4个多月了还是Awaiting Reviewer Scores
已经有5人回复
-
申请科研项目纯靠实力能成功吗？
已经有12人回复
-
极限拉扯，如何抉择
已经有15人回复
14楼2012-09-21 11:05:26
gaoyang636
木虫 (著名写手)
- BioEPI: 17
- 应助: 202 (大学生)
- 金币: 4111.4
- 散金: 7
- 红花: 14
- 帖子: 1108
- 在线: 159.8小时
- 虫号: 384065
- 注册: 2007-05-27
- 专业: 基因组学
2楼2012-04-15 15:43:26
3楼2012-04-15 16:16:04
gaoyang636
木虫 (著名写手)
- BioEPI: 17
- 应助: 202 (大学生)
- 金币: 4111.4
- 散金: 7
- 红花: 14
- 帖子: 1108
- 在线: 159.8小时
- 虫号: 384065
- 注册: 2007-05-27
- 专业: 基因组学
【答案】应助回帖
amisking: BioEPI+1, 鼓励帮助解答，欢迎继续交流。 2012-04-15 18:36:51
|
写了个简单的Perl脚本，需要你电脑中安装有Perl和相应的BioPerl模块；平台不限，Win或者linux都行。 由于不知道你的数据啥样子，也许需要略微修改此脚本，我测试过可以用。 根据提供的id删除相应的序列。 用法： “delete_by_id.pl fasta_file id_file” 即可 |
» 本帖附件资源列表
-
欢迎监督和反馈：小木虫仅提供交流平台，不对该内容负责。
本内容由用户自主发布，如果其内容涉及到知识产权问题，其责任在于用户本人，如对版权有异议，请联系邮箱：xiaomuchong@tal.com - 附件 1 : delete_by_ID.pl
2012-04-15 16:14:23, 765 bytes
4楼2012-04-15 16:17:07