24小时热门版块排行榜    

查看: 2692  |  回复: 8
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

liufeila

新虫 (小有名气)

[求助] 求CONTCAR转换成MS的.cif的程序以及原子坐标问题

如题:1.想让从MS中建立的模型经过VASP优化以后能够转化成.cif的文件,用MS看图, 觉得这样会准确一些。求程序。
         2.MS另存为CELL文件复制到POSCAR文件的坐标,有一部分原子不优化,想固定,这一部分原子怎么才能找到?POSCAR文件里面根本看不出。
      谢谢大侠们。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

future_wl

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

VESTA中导出的CIF在MS里面打不开啊,还是应该用getcif.pl,虽然复杂一些
未来就是现在
9楼2013-03-27 14:03:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答

zzy870720z

荣誉版主 (文坛精英)

优秀版主优秀版主优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
liufeila: 金币+2, ★★★很有帮助, 多谢,很有帮助 2012-04-12 14:41:48
sunyang1988: 金币+2, 谢谢帮助 2012-04-13 12:14:57
http://theory.cm.utexas.edu/vtsttools/scripts/
这里面有POSCAR转化为XYZ文件的脚本,可以使用

另外,站内也有很多资源
http://muchong.com/html/200911/1690400.html
博学、审问、慎思、明辨、笃学
2楼2012-04-12 14:34:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liufeila

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by zzy870720z at 2012-04-12 14:34:55:
http://theory.cm.utexas.edu/vtsttools/scripts/
这里面有POSCAR转化为XYZ文件的脚本,可以使用

另外,站内也有很多资源
http://muchong.com/html/200911/1690400.html

1. 下载附件中的getcif.pl文件,复制到vtstscripts目录下。并确保该目录在环境变量$PATH中。vtstscripts下载见 http://theory.cm.utexa ... ools/scripts/
2. 将脚本文件变成可执行文件。
chmod +x getcif.pl
3. 在VASP工作目录下运行脚本。运行结果会显示凭屏幕上,同时保存在out.cif文件中。

请问vtstscripts是怎么回事?
3楼2012-04-12 14:42:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zzy870720z

荣誉版主 (文坛精英)

优秀版主优秀版主优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖


sunyang1988: 金币+1, 辛苦了 2012-04-13 12:15:08
sunyang1988: 应助指数+1 2012-04-13 12:15:39
引用回帖:
3楼: Originally posted by liufeila at 2012-04-12 14:42:57:
1. 下载附件中的getcif.pl文件,复制到vtstscripts目录下。并确保该目录在环境变量$PATH中。vtstscripts下载见 http://theory.cm.utexa ... ools/scripts/
2. 将脚本文件变成可执行文件。
chmod +x getcif.pl
...

VTST Script,也就是TRANSITION STATE TOOLS FOR VASP,呵呵,下载下来看看,这个挺不错的,处理工具很实用
博学、审问、慎思、明辨、笃学
4楼2012-04-12 14:46:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料学硕318求调剂 +5 February_Feb 2026-03-19 5/250 2026-03-19 23:51 by 23Postgrad
[考研] 一志愿中国海洋大学,生物学,301分,求调剂 +5 1孙悟空 2026-03-17 6/300 2026-03-19 23:46 by zcl123
[考研] 能源材料化学课题组招收硕士研究生8-10名 +4 脱颖而出 2026-03-16 12/600 2026-03-19 16:17 by 脱颖而出
[考研] 085600材料与化工调剂 324分 +10 llllkkkhh 2026-03-18 12/600 2026-03-19 14:33 by llllkkkhh
[考研] 一志愿 西北大学 ,070300化学学硕,总分287,双非一本,求调剂。 +3 晨昏线与星海 2026-03-19 3/150 2026-03-19 13:36 by houyaoxu
[考研] 一志愿福大288有机化学,求调剂 +3 小木虫200408204 2026-03-18 3/150 2026-03-19 13:31 by houyaoxu
[考研] 一志愿985,本科211,0817化学工程与技术319求调剂 +10 Liwangman 2026-03-15 10/500 2026-03-19 10:25 by 无际的草原
[考研] 304求调剂 +6 司空. 2026-03-18 6/300 2026-03-18 23:03 by 星空星月
[考研] 328求调剂,英语六级551,有科研经历 +3 生物工程调剂 2026-03-17 7/350 2026-03-18 20:41 by Wangjingyue
[考研] 材料专业求调剂 +5 hanamiko 2026-03-18 5/250 2026-03-18 20:19 by 星空星月
[考研] 一志愿武理材料305分求调剂 +5 想上岸的鲤鱼 2026-03-18 6/300 2026-03-18 17:53 by 无际的草原
[考研] 311求调剂 +6 26研0 2026-03-15 6/300 2026-03-18 14:43 by haxia
[考研] 070300化学319求调剂 +6 锦鲤0909 2026-03-17 6/300 2026-03-18 13:22 by Iveryant
[考研] 299求调剂 +5 △小透明* 2026-03-17 5/250 2026-03-18 11:49 by 尽舜尧1
[考研] 301求调剂 +9 yy要上岸呀 2026-03-17 9/450 2026-03-18 08:58 by 无际的草原
[考研] 275求调剂 +4 太阳花天天开心 2026-03-16 4/200 2026-03-17 10:53 by 功夫疯狂
[考研] 321求调剂 +5 大米饭! 2026-03-15 5/250 2026-03-16 16:33 by houyaoxu
[考研] 326求调剂 +3 mlpqaz03 2026-03-15 3/150 2026-03-16 07:33 by Iveryant
[考研] 中科大材料与化工319求调剂 +3 孟鑫材料 2026-03-14 3/150 2026-03-14 20:10 by ms629
[考研] 一志愿哈工大材料324分求调剂 +5 闫旭东 2026-03-14 5/250 2026-03-14 14:53 by 木瓜膏
信息提示
请填处理意见