24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 2746  |  回复: 8
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

liufeila

新虫 (小有名气)

[求助] 求CONTCAR转换成MS的.cif的程序以及原子坐标问题

如题:1.想让从MS中建立的模型经过VASP优化以后能够转化成.cif的文件,用MS看图, 觉得这样会准确一些。求程序。
         2.MS另存为CELL文件复制到POSCAR文件的坐标,有一部分原子不优化,想固定,这一部分原子怎么才能找到?POSCAR文件里面根本看不出。
      谢谢大侠们。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

future_wl

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

VESTA中导出的CIF在MS里面打不开啊,还是应该用getcif.pl,虽然复杂一些
未来就是现在
9楼2013-03-27 14:03:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答

zzy870720z

荣誉版主 (文坛精英)

优秀版主优秀版主优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
liufeila: 金币+2, ★★★很有帮助, 多谢,很有帮助 2012-04-12 14:41:48
sunyang1988: 金币+2, 谢谢帮助 2012-04-13 12:14:57
http://theory.cm.utexas.edu/vtsttools/scripts/
这里面有POSCAR转化为XYZ文件的脚本,可以使用

另外,站内也有很多资源
http://muchong.com/html/200911/1690400.html
博学、审问、慎思、明辨、笃学
2楼2012-04-12 14:34:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liufeila

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by zzy870720z at 2012-04-12 14:34:55:
http://theory.cm.utexas.edu/vtsttools/scripts/
这里面有POSCAR转化为XYZ文件的脚本,可以使用

另外,站内也有很多资源
http://muchong.com/html/200911/1690400.html

1. 下载附件中的getcif.pl文件,复制到vtstscripts目录下。并确保该目录在环境变量$PATH中。vtstscripts下载见 http://theory.cm.utexa ... ools/scripts/
2. 将脚本文件变成可执行文件。
chmod +x getcif.pl
3. 在VASP工作目录下运行脚本。运行结果会显示凭屏幕上,同时保存在out.cif文件中。

请问vtstscripts是怎么回事?
3楼2012-04-12 14:42:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zzy870720z

荣誉版主 (文坛精英)

优秀版主优秀版主优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖


sunyang1988: 金币+1, 辛苦了 2012-04-13 12:15:08
sunyang1988: 应助指数+1 2012-04-13 12:15:39
引用回帖:
3楼: Originally posted by liufeila at 2012-04-12 14:42:57:
1. 下载附件中的getcif.pl文件,复制到vtstscripts目录下。并确保该目录在环境变量$PATH中。vtstscripts下载见 http://theory.cm.utexa ... ools/scripts/
2. 将脚本文件变成可执行文件。
chmod +x getcif.pl
...

VTST Script,也就是TRANSITION STATE TOOLS FOR VASP,呵呵,下载下来看看,这个挺不错的,处理工具很实用
博学、审问、慎思、明辨、笃学
4楼2012-04-12 14:46:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 急需调剂 +8 绝不放弃22 2026-04-15 9/450 2026-04-18 06:45 by 研可安
[考博] 求博导|生物质基多孔碳/超级电容方向,已有相关成果,寻能源材料/碳材料方向老师 +3 猪猪人Zzz 2026-04-12 3/150 2026-04-17 19:10 by 阳阳阳^_^
[考研] 271求调剂 +37 2261744733 2026-04-11 39/1950 2026-04-17 10:11 by 黑科技矿业
[论文投稿] 有没有接收比较快的sci期刊呀,最好在一个月之内的,研三孩子求毕业 20+4 之护着 2026-04-16 5/250 2026-04-17 10:02 by bobvan
[考研] 22专硕求调剂 +10 haoyun上岸 2026-04-11 12/600 2026-04-16 22:21 by 猪会飞
[考研] 22408 312求调剂 +23 门路摸摸 2026-04-14 25/1250 2026-04-16 21:21 by Art1977
[考研] 307中医考研调剂 +6 于以采蘩 2026-04-14 6/300 2026-04-16 16:20 by qingfeng258
[考研] 297,工科调剂?河南农业大学本科 +14 河南农业大学-能 2026-04-14 14/700 2026-04-16 14:41 by dingyanbo1
[考研] 290调剂生物0860 +38 哇哈哈,。 2026-04-11 44/2200 2026-04-16 09:52 by cuisz
[考研] 279学硕食品专业求调剂院校 20+7 孤独的狼爱吃羊 2026-04-12 29/1450 2026-04-16 09:00 by screening
[考研] 求调剂 +11 小聂爱学习 2026-04-11 15/750 2026-04-15 21:57 by noqvsozv
[考研] 通信工程求调剂!!! +6 zlb770521 2026-04-14 6/300 2026-04-15 20:00 by 学员JpLReM
[考研] 生物学调剂 +9 纸扇zhishan 2026-04-13 9/450 2026-04-15 18:28 by AN流800
[考研] 考研英一数一338分 +9 长江大学东校区 2026-04-13 10/500 2026-04-14 00:41 by 王珺璞
[考研] 一志愿中南大学 0855 机械 286 求调剂 +11 不会吃肉 2026-04-12 11/550 2026-04-13 21:59 by bljnqdcc
[考研] 290求调剂 +18 柯淮然 2026-04-12 20/1000 2026-04-13 12:56 by cyh—315
[考研] 0831一轮调剂失败求助 +10 小熊睿睿_s 2026-04-11 10/500 2026-04-12 22:43 by 长弓傲
[考研] 调剂结束 +6 floriea 2026-04-12 8/400 2026-04-12 18:13 by zhouxiaoyu
[考研] 291求调剂 +8 关忆北. 2026-04-11 8/400 2026-04-12 09:32 by 逆水乘风
[考研] 调剂求助 +6 果然有我 2026-04-11 7/350 2026-04-11 16:22 by 明月此时有
信息提示
请填处理意见