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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 同一个平板上挑的两个菌测序，序列差很多，大家帮我看看啊，有比对图！谢谢啦
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陈年芬芳

新虫 (小有名气)

[求助] 同一个平板上挑的两个菌测序，序列差很多，大家帮我看看啊，有比对图！谢谢啦

4-3-1和4-3-2是一个菌斑摇菌后分装的两管样品测序结果
4-2-1和4-2-2是同一个平板上另一个菌斑摇菌后分装的两管测序结果
91和92是引物。
四个样品的峰图都没有问题
为什么4-3这组和4-2这组的序列差这么多啊？都是同一批的啊。
第一次碰到这种情况，以前也只是二三个碱基的差异，这次差太多了，什么原因啊？
我们这个没有人做，也没法和别人比对。肿么办？
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1楼2012-04-08 13:57:40
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yingyangyang

木虫 (正式写手)
引用回帖:
17楼: Originally posted by 陈年芬芳 at 2012-05-31 10:41:18
我觉得这个可能性最大了，但是如果这样的话，仍然阳性的的就直接测序了，没有做酶切啊。...

我们一般会做个没切验证下片段导入的大小和正确位置，因为我们想要导入的片段大小一般是固定的，所有根据酶切片段的大小可以判断插入片段的大小，同是可以进一步确认片段插入位点的正确性。因为插入位点若不正确，酶切后片段大小很正确插入位点的酶切结果是不一样的。
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18楼2012-06-02 23:12:17
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asdf6074053

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

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杩欎箞浣庣殑鐩镐技鎬т竴瀹氭槸鏈夊?囬槼鎬х殑锛屼负浠�涔堜�?鏄窡鐩殑搴?鍒楁瘮瀵瑰憿锛熻�屾槸浠栦滑鐩镐簰姣旓紵鑰屼笖鎴戞劅瑙夊鏋滄寫鍏嬮殕鏃舵病闂鐨勮�?鏄病蹇呰�?灏嗗?曞厠闅嗗垎涓ょ鍐?�?曠嫭娴嬪�?鐨勶紝浣犵殑鏄?屽湪骞虫?夸笂闀夸簡澶氫箙寮�濮嬫寫鐨勶紵
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2楼2012-04-09 12:42:50
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asdf6074053

新虫 (初入文坛)
★ ★
西瓜: 金币+2, 鼓励交流 2012-04-10 18:30:43
不好意思，不知怎么的就乱码了，其实单克隆是没必要分量管单独测序的，除非挑克隆过程就有问题。你是在菌长了多久挑的克隆？
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3楼2012-04-09 12:53:01
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陈年芬芳

新虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by asdf6074053 at 2012-04-09 12:53:01:
不好意思，不知怎么的就乱码了，其实单克隆是没必要分量管单独测序的，除非挑克隆过程就有问题。你是在菌长了多久挑的克隆？

大概14个小时吧，测两个也是为了有保障，但是为什么两个菌斑的结果差异这么大啊？
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4楼2012-04-09 13:05:33
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