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哪位帮我分析一下，一个简单程序 已有6人参与
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我写得这个文件运行后，用vmd看发现分子不运动，这是为什么？谢谢啊！ units real boundary p p p atom_style atomic neighbor 0.3 bin neigh_modify delay 2 #create geometry lattice fcc 5.405 region 1 block 0 15 0 15 -5 10 create_box 2 1 region 2 block 0 15 0 15 -5 0 create_atoms 1 region 2 region 3 block 0 15 0 15 0 10 create_atoms 2 region 3 create_atoms 2 random 20000 123 3 region 4 cone z 72.9 32.4 0 8.034 3 33 units box delete_atoms region 4 mass 1 39.948 mass 2 195.08 # potentials pair_style lj/cut 11.9175 pair_modify shift yes pair_coeff 2 2 0.24036 3.405 pair_coeff 1 1 2.4036 3.405 pair_coeff 1 2 0.24036 3.405 #define groups group solid region 1 group liquid region 2 # initialvelocities velocity all create 96 2323 dist gaussian fix 1 all npt temp 300.0 300.0 100.0 iso 0.0 0.0 1000.0 compute liq_temp liquid temp compute liq_iso all pressure liq_temp thermo_style custom step c_liq_temp c_liq_iso dump 1 all atom 1000 dump.all minimize 1.0e-6 1.0e-6 1000 1000 |
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3楼2012-03-26 11:18:25
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