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WSW_Alone

木虫 (著名写手)

[求助] 高氏一号分离的菌用16S通用引物扩增不出条带

如题,最近用高氏一号涂布并分离保存菌种,肉眼观察应该都是细菌,进行鉴定的时候(模板直接是扎菌/菌液)用16S通用引物8f,1492r进行直接PCR,但是基本上扩增不出条带,即使扩增出来条带也很淡。
请教一下各位前辈这是什么情况?不胜感激。

PCR产物电泳结果
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處世樹為模,本固任從枝葉動;立身錢作樣,內方還要外邊圓。
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WSW_Alone

木虫 (著名写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by girlfisher at 2012-03-22 11:45:05:
高氏一号分离放线菌,放线菌为G+,high G+C菌。一般直接菌体PCR细胞不易破碎,建议提取DNA再做PCR

你们一般采用什么方法提取DNA?
處世樹為模,本固任從枝葉動;立身錢作樣,內方還要外邊圓。
7楼2012-03-23 09:27:40
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feierorange

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
WSW_Alone: 金币+1, 有帮助 2012-05-04 01:13:34
我们实验室做的都可以啊,应该和培养基关系不大吧,是不是PCR过程的问题呢?ps:我们用的引物是27f, 1492r或1525r了
2楼2012-03-22 09:27:33
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WSW_Alone

木虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by feierorange at 2012-03-22 09:27:33:
我们实验室做的都可以啊,应该和培养基关系不大吧,是不是PCR过程的问题呢?ps:我们用的引物是27f, 1492r或1525r了

你们预处理是怎样的?ps:引物关系很大吗?
處世樹為模,本固任從枝葉動;立身錢作樣,內方還要外邊圓。
3楼2012-03-22 09:29:38
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feierorange

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by WSW_Alone at 2012-03-22 09:29:38:
你们预处理是怎样的?ps:引物关系很大吗?

预处理很简单,就是菌体洗涤一下,也用的菌液,8f我没用过,不太清楚,PCR出问题的原因会比较多了,你是别的培养基都可以,唯独高氏一号不行吗?
4楼2012-03-22 09:39:40
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