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ludeng8710

新虫 (小有名气)

[求助] 过渡态能量反而比两个反应物的能量加和还要低?求教!

有机反应中的过渡态搜寻,反应物有两个,一带正电荷,一带负电荷,是 离子对的形式反应,优化反应物时电荷和自旋密度都是默认的“0 2”,过渡态是“0 1”
,过渡态结构和振动模式是对的,但能量反而比两个反应物的能量加和还要低,不知道怎么回事,百思不得其解,求教!
O(∩_∩)O谢谢~
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lishijunzong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

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御剑江湖: 金币+2, 谢谢回帖交流 2012-03-21 14:30:29
ludeng8710: 金币+3 2012-03-21 20:44:07
你优化时候不能按照默认的,应选用11或-11,先做完这一步再说吧

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2楼2012-03-21 12:21:50
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tudoudigua

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

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御剑江湖: 金币+2, 谢谢回帖交流 2012-03-21 14:30:35
ludeng8710: 金币+2 2012-03-21 20:44:20
很怪异。很可能过渡态找 的不好,试着在找找
人生总是在习惯那些不习惯的习惯!
3楼2012-03-21 14:02:52
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ludeng8710

新虫 (小有名气)

送鲜花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by lishijunzong at 2012-03-21 12:21:50:
你优化时候不能按照默认的,应选用11或-11,先做完这一步再说吧

为什么这样设置呀?O(∩_∩)O谢谢~
4楼2012-03-21 15:07:58
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jintongyin

木虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
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小红豆: 金币+3, 3x 2012-03-21 18:39:07
ludeng8710: 金币+2 2012-03-21 20:44:32
可能在路径入口的地方有个络合物阱,扫描一下IRC可以跑200个点,看看路径最后走到什么地方,看看最后一点是不是比反应物加和能量低,如果是再把最后一点结构拿出来优化,这个就是前期络合物了
5楼2012-03-21 17:38:07
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purplez

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
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小红豆: 金币+5, 3x 2012-03-21 18:39:19
ludeng8710: 金币+3 2012-03-21 20:44:39
这个情况并不是太怪异
对于正负离子直接反应的情况,由于反应性很高,计算中出现过渡态能量会很低,甚至低于反应物也是有的
类似情况在其他高反应活性的体系也是有的比如双自由基成键,卡宾加成

有个文献你可以参考下:J. AM. CHEM. SOC. 2008, 130, 5634–5635

你可以考虑再做一次成键的扫描,如果整个过程全程放热,那么就是上面提到的这种情况
6楼2012-03-21 17:57:03
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viger87

木虫 (正式写手)

送鲜花一朵
电荷肯定是错的,反应物改成相应的,+1和-1,还有,不敢肯定你的自旋多重度对不对,具体体系具体分析(不过一般是1)
有花堪折直须折,末待花落空折枝!
7楼2012-03-22 18:36:27
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