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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 动植物 » 综合其他 » 植物的密码子使用频率数据库
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waiwaidou_1983

铜虫 (小有名气)

[交流] 植物的密码子使用频率数据库

植物的密码子使用频率数据库
除了这个 http://www.kazusa.or.jp/codon/

还有别的吗？
这个数据貌似有点老
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1楼2012-03-19 15:03:54
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萝卜涨价了

铜虫 (初入文坛)
★
waiwaidou_1983(金币+1): 谢谢参与
www.detaibio.com/tools/你可以到这个看一下，里面是一系列的生物工具合计，除了密码子使用频率表，还有密码子频率计算还有其它的好多。我看里面有好多物种的密码子使用频率表，楼主可以自行去看看有没有自己的。
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4楼2018-05-02 14:52:18
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genomelin

银虫 (小有名气)
★ ★ ★
waiwaidou_1983(金币+1): 谢谢参与
SongQ5285: 金币+2, 鼓励积极交流 2012-03-20 20:03:44
拖refseq数据自己算得了，目前注释比较准的也就是水稻和拟南芥了，其他的植物的注释都不是太好
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2楼2012-03-20 16:44:28
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yangsh_nj

木虫 (著名写手)
★ ★ ★
waiwaidou_1983(金币+1): 谢谢参与
SongQ5285: 金币+2, 鼓励积极交流 2012-03-20 20:04:04
这个还真的根据各已经发布基因组的annotation自己算就行。
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3楼2012-03-20 17:58:36
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