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wangcui2011
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急求nwchem应用实例
各位热心的虫友,本人学nwchem时间不长,现需要用nwchem中的QM/MM模块研究化学反应,阻力重重,希望有高人提供这方面的程序实例。不胜感激!
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想一千次,不如去做一次。华丽的跌倒,胜过无谓的徘徊。千里之行,始于足下,即使无功而返,也不浪费大好青春。
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2012-03-15 22:34:56
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2012-08-08 11:24:02
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bay__gulf
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gmy1990: 金币+3
2012-03-16 10:39:15
nwchem 的 qmmm 是西北太平洋的Marat Valiev 开发的, 你可以参考一下他的文章
http://emslbios.pnl.gov/bios/biosketch.nsf/bynameinit/valiev_m
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wangcui2011
2楼
2012-03-16 08:51:54
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wangcui2011
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2楼
:
Originally posted by
bay__gulf
at 2012-03-16 08:51:54:
nwchem 的 qmmm 是西北太平洋的Marat Valiev 开发的, 你可以参考一下他的文章
http://emslbios.pnl.gov/bios/biosketch.nsf/bynameinit/valiev_m
版主,你好。谢谢你的热心回帖。
我大致看了一下他近两年的文章,他用文字描述的怎样用NWChem里面的QM/MM模块做他的体系,我能看懂。我的问题在于:在做QM/MM计算之前要用prepare模块产生.rst和.top文件,我就失败在这一步,每次都只能生成一个后缀名为 .frg_TMP的文件,下面该怎样进行就不知道了。NWChem6.0里面的所有关于prepare的例子就走不通,这样就不能往下面计算了。我承认,我的水平很次。
很头疼,不知道该怎么办。希望版主给些建议。或者除了手册有什么资料可以参考。
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想一千次,不如去做一次。华丽的跌倒,胜过无谓的徘徊。千里之行,始于足下,即使无功而返,也不浪费大好青春。
3楼
2012-03-19 11:04:41
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bay__gulf
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3楼
:
Originally posted by
wangcui2011
at 2012-03-19 11:04:41:
版主,你好。谢谢你的热心回帖。
我大致看了一下他近两年的文章,他用文字描述的怎样用NWChem里面的QM/MM模块做他的体系,我能看懂。我的问题在于:在做QM/MM计算之前要用prepare模块产生.rst和.top文件,我就失 ...
里头问题挺多, 等忙完我整理一下吧
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4楼
2012-03-19 12:20:22
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