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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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happywyh

主管区长

优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!


[交流] 引物设计

在NCBI中对目的基因进行BLAST时,发现对比结果显示是plus/minus,进行序列分析时发现目的基因序列没有ATG...TAA,反之是TTA...CAT,引物设计时,使用目的基因的反相互补序列进行设计的吗?
求解释...
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happywyh

版主

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引用回帖:
: Originally posted by lxj341401 at 2012-03-13 18:17:59:
你的目的基因实际上是提供的这个序列的反向互补链,所以设计引物的时候先反向互补再设计。

为什么会出现这种现象,plus是模板链,与mRNA互补序列,测序时怎么会得到minus序列~~谢谢赐教
3楼2012-03-13 21:07:34
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happywyh(金币+2): 2012-03-13 19:29:25
你的目的基因实际上是提供的这个序列的反向互补链,所以设计引物的时候先反向互补再设计。

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2楼2012-03-13 18:17:59
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lxj341401

超级版主

优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!


★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5): 给个红包,谢谢回帖
happywyh(金币+3): 2012-03-13 22:31:53
引用回帖:
3楼: Originally posted by happywyh at 2012-03-13 21:07:34:
为什么会出现这种现象,plus是模板链,与mRNA互补序列,测序时怎么会得到minus序列~~谢谢赐教

测基因组的时候就测一条链,但转录的时候模板并非永远在一条链上。就像你看到的质粒图谱一样,箭头有顺时针的,也有逆时针的,就是这个原因。
4楼2012-03-13 22:20:30
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happywyh

主管区长

优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!


引用回帖:
: Originally posted by lxj341401 at 2012-03-13 22:20:30:
测基因组的时候就测一条链,但转录的时候模板并非永远在一条链上。就像你看到的质粒图谱一样,箭头有顺时针的,也有逆时针的,就是这个原因。

谢谢~~明白了
5楼2012-03-13 22:32:08
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