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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 引物设计
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happywyh

铁虫 (小有名气)

[交流] 引物设计

在NCBI中对目的基因进行BLAST时，发现对比结果显示是plus/minus，进行序列分析时发现目的基因序列没有ATG...TAA，反之是TTA...CAT，引物设计时，使用目的基因的反相互补序列进行设计的吗？
求解释...
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1楼 2012-03-13 14:39:48
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happywyh

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
楼: Originally posted by lxj341401 at 2012-03-13 22:20:30:
测基因组的时候就测一条链，但转录的时候模板并非永远在一条链上。就像你看到的质粒图谱一样，箭头有顺时针的，也有逆时针的，就是这个原因。

谢谢~~明白了
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5楼2012-03-13 22:32:08
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lxj341401

至尊木虫 (著名写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5): 给个红包，谢谢回帖
happywyh(金币+2): 2012-03-13 19:29:25
你的目的基因实际上是提供的这个序列的反向互补链，所以设计引物的时候先反向互补再设计。
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happywyh
2楼2012-03-13 18:17:59
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happywyh

铁虫 (小有名气)
送鲜花一朵
引用回帖:
楼: Originally posted by lxj341401 at 2012-03-13 18:17:59:
你的目的基因实际上是提供的这个序列的反向互补链，所以设计引物的时候先反向互补再设计。

为什么会出现这种现象，plus是模板链，与mRNA互补序列，测序时怎么会得到minus序列~~谢谢赐教
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3楼2012-03-13 21:07:34
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lxj341401

至尊木虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5): 给个红包，谢谢回帖
happywyh(金币+3): 2012-03-13 22:31:53
引用回帖:
3楼: Originally posted by happywyh at 2012-03-13 21:07:34:
为什么会出现这种现象，plus是模板链，与mRNA互补序列，测序时怎么会得到minus序列~~谢谢赐教

测基因组的时候就测一条链，但转录的时候模板并非永远在一条链上。就像你看到的质粒图谱一样，箭头有顺时针的，也有逆时针的，就是这个原因。
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4楼2012-03-13 22:20:30
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