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happywyh
铁虫
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虫号: 1664499
[交流]
引物设计
在NCBI中对目的基因进行BLAST时,发现对比结果显示是plus/minus,进行序列分析时发现目的基因序列没有ATG...TAA,反之是TTA...CAT,引物设计时,使用目的基因的反相互补序列进行设计的吗?
求解释...
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2012-03-13 14:39:48
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Originally posted by
lxj341401
at 2012-03-13 22:20:30:
测基因组的时候就测一条链,但转录的时候模板并非永远在一条链上。就像你看到的质粒图谱一样,箭头有顺时针的,也有逆时针的,就是这个原因。
谢谢~~明白了
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2012-03-13 22:32:08
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happywyh(金币+2):
2012-03-13 19:29:25
你的目的基因实际上是提供的这个序列的反向互补链,所以设计引物的时候先反向互补再设计。
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happywyh
2楼
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lxj341401
at 2012-03-13 18:17:59:
你的目的基因实际上是提供的这个序列的反向互补链,所以设计引物的时候先反向互补再设计。
为什么会出现这种现象,plus是模板链,与mRNA互补序列,测序时怎么会得到minus序列~~谢谢赐教
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3楼
2012-03-13 21:07:34
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3楼
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Originally posted by
happywyh
at 2012-03-13 21:07:34:
为什么会出现这种现象,plus是模板链,与mRNA互补序列,测序时怎么会得到minus序列~~谢谢赐教
测基因组的时候就测一条链,但转录的时候模板并非永远在一条链上。就像你看到的质粒图谱一样,箭头有顺时针的,也有逆时针的,就是这个原因。
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4楼
2012-03-13 22:20:30
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