24小时热门版块排行榜    

查看: 1028  |  回复: 1
本帖产生 1 个 CMEI ,点击这里进行查看

p452_1

至尊木虫 (知名作家)

[交流] 交流:对于网友咨询的绝对构型和Friedel对的回答 已有1人参与

1、Friedel pairs是什么?

定义:The couple of reflections h, k, l and -h, -k, -l is called a Friedel pair, or Bijvoet pair。反射点h, k, l和它的倒置位置(inversion of the origin)的反射点-h, -k, -l 就定义叫做一个Friedel pair。对于中心对称的晶体结构,Friedel pair是完全等效的,所以在测试和结构解析时候,都选择合并(merge)Friedel pair,不予考虑。但是对于非中心对称的晶体结构,Friedel pair就不是完全等效的,至少在衍射强度上存在差异。这时候就不可以再选择合并(merge)Friedel pair。尤其是手性结构,不合并(not merge)Friedel pair有助于确定比较小的flack parameter。


2、反常散射测绝对构型就是用Friedel pairs的数值吗?[/color]

看网上介绍的好像是这样的。具体做法是:

Friedel pairs 数目的确定

在.ins中加merg 3,精修后在CIF中的total reflection number
如 _reflns_number_total              2627
再把merg 3换成MERG 2,精修后在CIF中的total reflection number
如 _reflns_number_total              3762

两者相减, 得到的就是Friedel pairs 的数目.

当你利用反常散射确定绝对构型时, 在CIF中要加
  _refine_ls_abs_structure_details   'Flack (1983), XXXX Friedel pairs'

这里的XXXX 用 3762-2627 = 1035来代替.

另外,  在CIF中填加
_chemical_absolute_configuration  ad
以表明绝对构型是用反常散射确定的.

参考英文:
[An easy way to determine the number of Friedel pairs is to look at the difference between the number of unique reflections used in SHELXL when a MERG2 and MERG 3 instruction is used (MERG 3 forces Friedel pairs to be merged before use).]


3、用Mo靶并且没有重原子的晶体测出的数据里面有没有Friedel pairs?
应该有Friedel pairs,但是数目比较少,主要是因为衍射比较弱和分辨率不够好。建议对于纯有机化合物使用Cu靶比较好。我一般在测晶体数据时候,如果觉得可能是手性的,在选择衍射数据收集方法时候就选择not merge Friedel pairs. 在结构解析时候,即作XPREP时候,一旦推导出是手性空间群或者非中心对称空间群,下面就要选择not merge Friedel pairs。这样解析,应该对晶体绝对构型的确定有帮助。

[ Last edited by p452_1 on 2012-3-10 at 01:51 ]
回复此楼

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

老歪博
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
送鲜花一朵
感谢分享!
2楼2012-03-10 12:08:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 p452_1 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 国自然面上复盘~欢迎讨论 +4 晴天加油 2026-08-26 5/250 2026-08-26 21:27 by 木风9012
[基金申请] 我不理解! +15 Edward_pc 2026-08-26 23/1150 2026-08-26 20:34 by zzuzxg
[基金申请] 2026国自然函评费到账 +22 羊腰板 2026-08-21 25/1250 2026-08-26 15:00 by zuocuiping
[基金申请] 2026年8月25日国自然放榜前突然收到列入评审专家邮件,有关系吗? +25 木水思豆 2026-08-25 28/1400 2026-08-26 14:53 by draco1987
[基金申请] 出来了 +9 trojank 2026-08-26 9/450 2026-08-26 14:25 by 宝贝虫子
[基金申请] 为什么国自然不能直接公布 +4 bjdxyxy 2026-08-26 4/200 2026-08-26 13:12 by qingmu1201
[基金申请] 科研孤儿太难了 +21 我4大白菜 2026-08-20 22/1100 2026-08-26 11:29 by nlgza
[基金申请] 国合里面能看到了 +7 一怀馨秋 2026-08-26 7/350 2026-08-26 11:23 by zhaosm1982
[基金申请] 项目信息和经费信息在系统里都可以看到了 +6 wittyboy 2026-08-26 14/700 2026-08-26 10:55 by wittyboy
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
[基金申请] 今天务委会开完了,明天出结果吗 +19 angus9576 2026-08-25 23/1150 2026-08-26 10:03 by zp519
[基金申请] 牛来!米来!面来! +8 beefly 2026-08-26 8/400 2026-08-26 08:37 by xuzhipiao
[基金申请] 在坚冰还盖着北海的时候,我看到了怒放的梅花。 (金币+10) +6 ziyangfang 2026-08-25 9/450 2026-08-25 20:26 by huagongfeihu
[基金申请] 明天应该可查了!? +6 chengyan1220 2026-08-23 6/300 2026-08-25 19:45 by zfd97
[基金申请] 今日不放榜?网传国自然预计 8 月 27 日可查结果 +17 医学老男孩 2026-08-20 22/1100 2026-08-25 15:36 by 医学老男孩
[基金申请] 没有任何消息-是不是就凉了 +9 图啦图啦 2026-08-24 10/500 2026-08-25 11:59 by 南海小哥
[基金申请] 建议基金发布提前给出明确的时间点 +13 kulium 2026-08-21 16/800 2026-08-24 16:27 by superceng
[基金申请] 让我中一个面上吧! +13 大萍1987 2026-08-20 16/800 2026-08-24 10:23 by 太傻了
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧? +4 哈哈蛤? 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
[基金申请] 基金啊基金 +4 longfie172 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:58 by mark mao
信息提示
请填处理意见