24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 2867  |  回复: 7

cbzgj

金虫 (小有名气)

[求助] 在diamond软件中 怎么让氢键键长信息以列表的形式显示出来

1.在diamond软件中 怎么让氢键信息以列表的形式显示出来
我的问题是在画好氢键之后,在diamond软件中,能不能把氢键键长信息以列表的形式显示出来,就跟晶体的键长键角似的那样列出来呢???
感谢各位牛人相助~

2.
Donor -H•••acceptora        D•••H        H•••A        D•••A        D-H•••A
N(2)-H(2B)•••O(8)                        X              Y             Z                W
N(3)-H(3A)•••O(7)       
N(4)-H(4A)•••O(9)       
N(5)-H(5E)•••O(8)       
N(6)-H(6E)•••O(10)       

这个X,Y,Z,W分别指那个距离?谢谢,初涉这个领域,请解释清楚通俗一点,再次感谢
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mashulin

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
drg1984(金币+1): 感谢热心帮助! 2012-03-03 19:10:34
不能,这些信息只能在***.lis 文件中查到,查到后给定Diamond氢键的距离,而画出含氢键的的晶体结构图。
2楼2012-03-03 18:07:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pop-popy

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
drg1984(金币+1): 感谢热心帮助! 2012-03-03 19:10:42
cbzgj(金币+50): ★★★很有帮助 10 2012-03-03 19:29:01
在Diamond里右边信息表栏里请把其选为table of H-bond infos之后右键save table保存为txt文件即可。
以你的为例:
X指N(2)-H(2B)距离
Y指H(2B)-O(8)距离
Z指N(2)-O(8)距离
W指N(2)-H(2B)-O(8)夹角

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

退思补过
3楼2012-03-03 18:11:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pop-popy

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
drg1984(金币+1): 感谢热心指点! 2012-03-03 19:10:55
lichun1210(金币+1): 鼓励回帖交流~ 2012-03-03 19:33:56
忘了,你在做上面的步骤之前,应该先在命令Build下拉菜单中Create H-bonds
退思补过
4楼2012-03-03 18:14:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cbzgj

金虫 (小有名气)

送鲜花一朵
引用回帖:
: Originally posted by pop-popy at 2012-03-03 18:11:58:
在Diamond里右边信息表栏里请把其选为table of H-bond infos之后右键save table保存为txt文件即可。
以你的为例:
X指N(2)-H(2B)距离
Y指H(2B)-O(8)距离
Z指N(2)-O(8)距离
W指N(2)-H(2B)-O(8)夹角

太感谢了
5楼2012-03-03 19:30:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cbzgj

金虫 (小有名气)

送鲜花一朵
引用回帖:
: Originally posted by pop-popy at 2012-03-03 18:11:58:
在Diamond里右边信息表栏里请把其选为table of H-bond infos之后右键save table保存为txt文件即可。
以你的为例:
X指N(2)-H(2B)距离
Y指H(2B)-O(8)距离
Z指N(2)-O(8)距离
W指N(2)-H(2B)-O(8)夹角

但是为什么我的氢键已经生成,右边“H-bond infos”下面没有任何数据呢,都是空白的,更别说去save了
6楼2012-03-03 19:37:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pop-popy

金虫 (正式写手)

你在做上面的步骤之前,应该先在命令Build下拉菜单中Create H-bonds
退思补过
7楼2012-03-03 19:38:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pop-popy

金虫 (正式写手)


lichun1210(金币+1): 鼓励回帖交流~ 2012-03-03 19:55:49
如果你确定有氢键那Create H-bonds时你的参数没设置好吧?
退思补过
8楼2012-03-03 19:40:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 cbzgj 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 085600材料与化工301分求调剂院校 +7 刺痛jk 2026-04-06 8/400 2026-04-06 07:30 by 小小树2024
[考研] 一志愿北京交通大学材料工程总分358求调剂 +4 cs0106 2026-04-04 4/200 2026-04-05 18:46 by imissbao
[考研] 301求调剂 +12 121. 2026-04-04 12/600 2026-04-05 09:00 by 来看流星雨10
[考研] 考研调剂 +6 15615482637 2026-04-04 6/300 2026-04-04 22:43 by yu221
[考研] 材料与化工306分找调剂 +23 沧海轻舟e 2026-04-02 27/1350 2026-04-04 21:52 by laoshidan
[考研] 292求调剂 +11 2022080213 2026-04-04 13/650 2026-04-04 18:38 by macy2011
[考研] 265求调剂 +17 林深温澜 2026-04-01 20/1000 2026-04-04 01:09 by userper
[考研] 322求调剂 +6 FZAC123 2026-04-03 6/300 2026-04-03 22:23 by 科研小专家
[考研] 化工求调剂 +11 荔香芝士椰奶 2026-04-03 11/550 2026-04-03 22:06 by 啵啵啵0119
[考研] 一志愿重庆大学085404,总分314分,求调剂 +4 zf83hn 2026-04-03 4/200 2026-04-03 21:25 by 啵啵啵0119
[考研] 274求调剂 +9 顺理成张 2026-04-03 10/500 2026-04-03 15:10 by 啊俊!
[考研] 考研调剂 +3 李木子0120 2026-04-02 5/250 2026-04-02 21:45 by dongzh2009
[考研] 土木304求调剂 +4 兔突突突, 2026-04-02 5/250 2026-04-02 21:16 by 兔突突突,
[考研] 一志愿北京科技材料科学与工程288分,求调剂 +14 是辰啊 2026-04-02 14/700 2026-04-02 21:10 by dongzh2009
[考研] 一志愿北京科技大学材料学硕328分求调剂 +6 1段时间 2026-03-31 7/350 2026-04-02 13:57 by 3041
[考研] 一志愿北交大材料工程总分358 +3 cs0106 2026-04-02 5/250 2026-04-02 11:37 by olim
[考研] 考研调剂 +12 Amber00 2026-03-31 12/600 2026-04-02 09:04 by sanrepian
[考研] 复试调剂 +7 双马尾痞老板2 2026-03-31 7/350 2026-03-31 19:49 by Dyhoer
[考研] 085601英二数二求调剂 总分325 +4 余航航 2026-03-31 4/200 2026-03-31 17:38 by 唐沐儿
[考研] 083000环境科学与工程调剂,总分281 +4 橙子(胜意) 2026-03-30 4/200 2026-03-31 00:44 by Linzejun
信息提示
请填处理意见