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cbzgj

金虫 (小有名气)

[求助] 在diamond软件中 怎么让氢键键长信息以列表的形式显示出来

1.在diamond软件中 怎么让氢键信息以列表的形式显示出来
我的问题是在画好氢键之后，在diamond软件中，能不能把氢键键长信息以列表的形式显示出来，就跟晶体的键长键角似的那样列出来呢？？？
感谢各位牛人相助~

2.
Donor -H•••acceptora        D•••H        H•••A        D•••A        D-H•••A
N(2)-H(2B)•••O(8)                        X              Y             Z                W
N(3)-H(3A)•••O(7)       
N(4)-H(4A)•••O(9)       
N(5)-H(5E)•••O(8)       
N(6)-H(6E)•••O(10)       

这个X,Y,Z,W分别指那个距离？谢谢，初涉这个领域，请解释清楚通俗一点，再次感谢
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1楼 2012-03-03 17:48:59
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mashulin

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
drg1984(金币+1): 感谢热心帮助！ 2012-03-03 19:10:34
不能，这些信息只能在***.lis 文件中查到，查到后给定Diamond氢键的距离，而画出含氢键的的晶体结构图。
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2楼2012-03-03 18:07:58
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pop-popy

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
drg1984(金币+1): 感谢热心帮助！ 2012-03-03 19:10:42
cbzgj(金币+50): ★★★很有帮助 10 2012-03-03 19:29:01
在Diamond里右边信息表栏里请把其选为table of H-bond infos之后右键save table保存为txt文件即可。
以你的为例：
X指N(2)-H(2B)距离
Y指H(2B)-O(8)距离
Z指N(2)-O(8)距离
W指N(2)-H(2B)-O(8)夹角
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cbzgj cbzgj
退思补过
3楼2012-03-03 18:11:58
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pop-popy

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
drg1984(金币+1): 感谢热心指点！ 2012-03-03 19:10:55
lichun1210(金币+1): 鼓励回帖交流~ 2012-03-03 19:33:56
忘了，你在做上面的步骤之前，应该先在命令Build下拉菜单中Create H-bonds
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退思补过
4楼2012-03-03 18:14:25
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cbzgj

金虫 (小有名气)
送鲜花一朵
引用回帖:
楼: Originally posted by pop-popy at 2012-03-03 18:11:58:
在Diamond里右边信息表栏里请把其选为table of H-bond infos之后右键save table保存为txt文件即可。
以你的为例：
X指N(2)-H(2B)距离
Y指H(2B)-O(8)距离
Z指N(2)-O(8)距离
W指N(2)-H(2B)-O(8)夹角

太感谢了
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5楼2012-03-03 19:30:52
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cbzgj

金虫 (小有名气)
送鲜花一朵
引用回帖:
楼: Originally posted by pop-popy at 2012-03-03 18:11:58:
在Diamond里右边信息表栏里请把其选为table of H-bond infos之后右键save table保存为txt文件即可。
以你的为例：
X指N(2)-H(2B)距离
Y指H(2B)-O(8)距离
Z指N(2)-O(8)距离
W指N(2)-H(2B)-O(8)夹角

但是为什么我的氢键已经生成，右边“H-bond infos”下面没有任何数据呢，都是空白的，更别说去save了
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6楼2012-03-03 19:37:59
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pop-popy

金虫 (正式写手)
你在做上面的步骤之前，应该先在命令Build下拉菜单中Create H-bonds
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退思补过
7楼2012-03-03 19:38:53
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pop-popy

金虫 (正式写手)
★
lichun1210(金币+1): 鼓励回帖交流~ 2012-03-03 19:55:49
如果你确定有氢键那Create H-bonds时你的参数没设置好吧？
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退思补过
8楼2012-03-03 19:40:59
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