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ldzh0531

木虫 (小有名气)

[求助] qst3寻找过渡态时出现不需要的虚频

如题,用qst3寻找过渡态时,在非反应方向上出现了虚频怎么消除。有些反应的反应物和产物的结构除了在反应方向上不一样外,其他地方也有不一样的。理论上,这些不一样的地方都可能出现虚频,可是那些非反应方向的虚频是不想要的,g09算出一个虚频就终止了,根本不对。怎么有办法在输入文件的时候就大致规定一下反应的方向呢?
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wenjinmiao

银虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
ldzh0531(金币+3): ★★★很有帮助 2012-03-05 10:52:35
消除虚频的主要方法是改变构型。其次在计算上还可以尝试:nosymm;加大循环次数;提高收敛度;iop(1/8=1)等。通常对于势能面很平,较小的虚频很难消除。当出现两个以上虚频时,可以先看一下振动模式。如果多余的虚频,和想要的振动模式发生在不同原子上,可以先固定过渡态模式所对应的原子,然后做opt到minimal,一般可以把多余的虚频去掉,再放开做全优化。或许会有所收获。
4楼2012-03-05 10:13:47
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ldzh0531

木虫 (小有名气)

我做过一个计算,计算出来的虚频就只是单键的旋转,根本不对!也不知道该怎么改
2楼2012-03-02 16:33:05
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ldzh0531

木虫 (小有名气)

哪位大神知道一下
3楼2012-03-04 21:41:10
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mchen10

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gmy1990(金币+2): 2012-03-06 12:21:02
ldzh0531(金币+3): ★★★很有帮助 2012-03-09 12:53:42
半经验的程序组
如 mopac 和 ampac 有一个叫EF的方法 (eigenvalue following)
可指定跟踪某个虚频 (详见ampac manual::EF)
可以先用mopac或ampac优化
得到结果去算gaussian
更痛苦的是梦没醒路已经不能走了
5楼2012-03-06 01:43:42
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