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急求fftw3.3.1安装问题，解答
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我最近用cygwin安装gromacs。但是在安装fftw3.3.1的时候出现问题。 1）安装过程中没有报错。但是在安装gromacs4.4.5，./configure 提示错误，cannot find fftw3f library. cygwin， gromacs ,fftw都 是从官网下载的 fftw我是安装的我自定义的文件夹下。 路径用setenv 命令做了设置。 2)我查看了下fftw 下/include /lib 文件夹，发现安装后文件很少，没有看到fftw3f为文件名的文件。 我查看了下fftw3.3.1 解压后的文件，也没有看到fftw3f文件名的文件 请高手指点下 另外我在redhat9.0下安装gromacs4.4.5也出现了同样的问题。 |
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刚用cygwin安装gromacs。 echo$cppflags -i/home/fftw/include echo$ ldflags -l/home/fftw/lib ./configure --enable-float --enable-threads --prefix=/home/gromacs checking for fftw3.h... configure: error: Cannot find the default external FFT library (fftw3). Other alternatives are 'fftw2', or 'mkl' for Intel MKL. You are STRONGLY recommended to use one of these - fftw is free. Use CPPFLAGS and LDFLAGS if the library is installed in a non-standard location. (see FAQ at http://www.gromacs.org) If you dont care about performance you can also specify 'fftpack' to use a slower set of FFTs built into Gromacs. (Just install FFTW3 unless you really know what you are doing). |
13楼2012-03-02 11:50:07
qphll
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【答案】应助回帖
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chaizhm(金币+3): 2012-03-02 14:13:29
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chaizhm(金币+3): 2012-03-02 14:13:29
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几点建议: (1) cygwin不是长久之道, 建议直接ubuntu http://www.ubuntu.com/ (2) 请将安装fftw和gromacs的步骤贴出来, 这样大家才好帮你看到底哪里出了问题. 一般而言, 安装完成以后, lib下面需要libfftw3.a 和 libfftw3f.a, 看你是不是单精度双精度都安装 . |
2楼2012-03-02 09:02:49
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安装过程是这样的 fftw 1）./configure --enable-float --enable-threads --enable-sse --enable-sse2 --prefix=/home/fftw 2)make 3)make install setenv cppflags -i/home/fftw/include setenv ldflags -l/home/fftw/lib gromacs 1)./configure --enable-float --prefix=/home/gromacs error cannot find fftw3f library 这就是我的安装过程，都是参照网上的建议做的。一前我使用的是gromacs3版本的，都没有出现过这个问题。因为科研的需要，要用到升级版本。但是这个问题一直解决不了。 文件libfftw3.a我有的 |
3楼2012-03-02 09:55:49
qphll
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4楼2012-03-02 10:39:07