24小时热门版块排行榜    

查看: 3220  |  回复: 13

friendy

银虫 (小有名气)

[求助] 急求fftw3.3.1安装问题,解答

我最近用cygwin安装gromacs。但是在安装fftw3.3.1的时候出现问题。
1)安装过程中没有报错。但是在安装gromacs4.4.5,./configure 提示错误,cannot find fftw3f library.
cygwin, gromacs ,fftw都 是从官网下载的
fftw我是安装的我自定义的文件夹下。
路径用setenv 命令做了设置。

2)我查看了下fftw 下/include /lib 文件夹,发现安装后文件很少,没有看到fftw3f为文件名的文件。
我查看了下fftw3.3.1 解压后的文件,也没有看到fftw3f文件名的文件

请高手指点下

另外我在redhat9.0下安装gromacs4.4.5也出现了同样的问题。
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

计算资料

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖置顶 ( 共有1个 )

friendy

银虫 (小有名气)

引用回帖:
: Originally posted by qphll at 2012-03-02 09:02:49:
几点建议:

(1) cygwin不是长久之道, 建议直接ubuntu
http://www.ubuntu.com/

(2) 请将安装fftw和gromacs的步骤贴出来, 这样大家才好帮你看到底哪里出了问题.

一般而言, 安装完成以后, lib下面需要libff ...

安装过程是这样的 fftw
1)./configure --enable-float --enable-threads --enable-sse --enable-sse2 --prefix=/home/fftw
2)make
3)make install
setenv cppflags -i/home/fftw/include
setenv ldflags -l/home/fftw/lib
gromacs
1)./configure --enable-float --prefix=/home/gromacs

error cannot find fftw3f library
这就是我的安装过程,都是参照网上的建议做的。一前我使用的是gromacs3版本的,都没有出现过这个问题。因为科研的需要,要用到升级版本。但是这个问题一直解决不了。
文件libfftw3.a我有的
3楼2012-03-02 09:55:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

qphll

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
chaizhm(金币+3): 2012-03-02 14:13:29
几点建议:

(1) cygwin不是长久之道, 建议直接ubuntu
http://www.ubuntu.com/

(2) 请将安装fftw和gromacs的步骤贴出来, 这样大家才好帮你看到底哪里出了问题.

一般而言, 安装完成以后, lib下面需要libfftw3.a 和 libfftw3f.a, 看你是不是单精度双精度都安装 .
Life, Love, Laugh.
2楼2012-03-02 09:02:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qphll

金虫 (正式写手)

★ ★
chaizhm(金币+2): 2012-03-02 14:13:40
引用回帖:
3楼: Originally posted by friendy at 2012-03-02 09:55:49:
安装过程是这样的 fftw
1)./configure --enable-float --enable-threads --enable-sse --enable-sse2 --prefix=/home/fftw
2)make
3)make install
setenv cppflags -i/home/fftw/include
setenv ldflags - ...

你在setenv以后, echo 一下cppflags 和 ldflags看看是不是路径已经设置正确.

另外, cywin下的, 已经是csh(tcsh)吗? 有可能是bash吗?
Life, Love, Laugh.
4楼2012-03-02 10:39:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qphll

金虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by friendy at 2012-03-02 09:55:49:
安装过程是这样的 fftw
1)./configure --enable-float --enable-threads --enable-sse --enable-sse2 --prefix=/home/fftw
2)make
3)make install
setenv cppflags -i/home/fftw/include
setenv ldflags - ...

另外, 在configure gromacs的时候, 如果是fftw3, 那么应该加上,  --with-fft=fftw3
Life, Love, Laugh.
5楼2012-03-02 10:40:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

friendy

银虫 (小有名气)

引用回帖:
: Originally posted by qphll at 2012-03-02 10:40:42:
另外, 在configure gromacs的时候, 如果是fftw3, 那么应该加上,  --with-fft=fftw3

我用的是bash, linux下是不是也可以用echo命令?
我也用with-fft=fftw3安装了,也是出错,找不到fftw3
另外有个问题,我在安装fftw时,360和金山报毒,我把他们关掉安装了一次,结果系统崩溃了。有没有办法解决下?
6楼2012-03-02 10:46:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qphll

金虫 (正式写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by friendy at 2012-03-02 10:46:42:
我用的是bash, linux下是不是也可以用echo命令?
我也用with-fft=fftw3安装了,也是出错,找不到fftw3
另外有个问题,我在安装fftw时,360和金山报毒,我把他们关掉安装了一次,结果系统崩溃了。有没有办法解 ...

嗯, 怪不得呢.

确定一下, 在命令行下面, 输入 echo $SHELL

如果是bash, 那么设置环境变量的命令是,

export CPPFLAGS="-I/home/fftw"
export LDFLAGS="-L/home/fftw"

如果是csh或者tcsh

那么,

setenv CPPFLAGS -I/home/fftw
setenv LDFLAGS -L/home/fftw

记得, 设置好环境变量以后, 再double check一下:

echo $CPPFLAGS
echo $LDFLAGS

看看是不是设置成功了.

至于360和金山, 我就只能冒汗了....... 你自己看着办吧.....
Life, Love, Laugh.
7楼2012-03-02 10:51:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

friendy

银虫 (小有名气)

引用回帖:
: Originally posted by qphll at 2012-03-02 10:39:07:
你在setenv以后, echo 一下cppflags 和 ldflags看看是不是路径已经设置正确.

另外, cywin下的, 已经是csh(tcsh)吗? 有可能是bash吗?

我用命令
$echo cppflags
cppflags
没有内容,这是怎么回事?
8楼2012-03-02 10:52:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qphll

金虫 (正式写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by friendy at 2012-03-02 10:52:15:
我用命令
$echo cppflags
cppflags
没有内容,这是怎么回事?

echo $CPPFLAGS 没啥东西?

那么 export

或者 env呢??
Life, Love, Laugh.
9楼2012-03-02 10:54:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

friendy

银虫 (小有名气)

引用回帖:
: Originally posted by qphll at 2012-03-02 10:54:12:
echo $CPPFLAGS 没啥东西?

那么 export

或者 env呢??

$echo $cppflags
-i/home/fftw/include
$echo $ldflags
-l/home/fftw/lib
$./configure --enable-float --enable-threads --prefix=/home/gromacs
cannot find the default external fft library (fftw3)
10楼2012-03-02 11:15:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 friendy 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 0703化学336分求调剂 +3 zbzihdhd 2026-03-15 4/200 2026-03-16 23:52 by zbzihdhd
[考研] 化学调剂0703 +8 啊我我的 2026-03-11 8/400 2026-03-16 17:23 by 我的船我的海
[考研] 0703一志愿211 285分求调剂 +5 ly3471z 2026-03-13 5/250 2026-03-16 16:16 by 哦哦123
[考研] 0703化学调剂,求各位老师收留 +8 秋有木北 2026-03-14 8/400 2026-03-16 15:21 by 哦哦123
[考研] 材料与化工专硕调剂 +3 heming3743 2026-03-16 3/150 2026-03-16 15:05 by peike
[考研] 344求调剂 +3 knight344 2026-03-16 3/150 2026-03-16 09:42 by 无际的草原
[考研] 070305求调剂 +3 mlpqaz03 2026-03-14 4/200 2026-03-15 11:04 by peike
[考研] 331求调剂(0703有机化学 +5 ZY-05 2026-03-13 6/300 2026-03-14 10:51 by Jy?
[考研] 330求调剂 +3 ?酱给调剂跪了 2026-03-13 3/150 2026-03-14 10:13 by JourneyLucky
[考研] 一志愿湖师大化学289求调剂 +6 XMCMM3.14159 2026-03-10 6/300 2026-03-14 00:28 by JourneyLucky
[考研] 321求调剂 +3 CUcat 2026-03-10 3/150 2026-03-14 00:25 by JourneyLucky
[考研] 332求调剂 +3 zjy101327 2026-03-11 6/300 2026-03-13 22:48 by JourneyLucky
[考研] 材料工程调剂 +9 咪咪空空 2026-03-12 9/450 2026-03-13 22:05 by 星空星月
[考研] 求材料调剂 085600英一数二总分302 前三科235 精通机器学习 一志愿哈工大 +4 林yaxin 2026-03-12 4/200 2026-03-13 22:04 by 星空星月
[考研] 四川大学085601材料工程专硕 初试294求调剂 +4 祝我们好在冬天 2026-03-11 4/200 2026-03-13 21:39 by peike
[考研] 333求调剂 +3 球球古力 2026-03-11 3/150 2026-03-13 21:27 by JourneyLucky
[考研] 301求调剂 +6 Liyouyumairs 2026-03-11 6/300 2026-03-13 20:11 by JourneyLucky
[考研] 【0856】化学工程(085602)313 分,本科学科评估A类院校化学工程与工艺,诚求调剂 +7 小刘快快上岸 2026-03-11 7/350 2026-03-13 16:06 by ruiyingmiao
[考研] 一志愿211化学学硕310分求调剂 +8 努力奋斗112 2026-03-12 9/450 2026-03-13 15:41 by JourneyLucky
[考研] 085600材料与化工 309分请求调剂 +7 dtdxzxx 2026-03-12 8/400 2026-03-13 14:43 by jxchenghu
信息提示
请填处理意见