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lilylorry金虫 (初入文坛)
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R软件如何通过bootstrap方法得到ROC曲线下面积(AUC)的95%CI?
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请教各位大侠如何通过bootstrap方法得到AUC的95%CI及其p值。 现找到一段程序,但是看不懂: # Bootstrap 95% CI for R-Squared library(boot) # function to obtain R-Squared from the data rsq <- function(formula, data, indices) { d <- data[indices,] # allows boot to select sample fit <- lm(formula, data=d) return(summary(fit)$r.square) } # bootstrapping with 1000 replications results <- boot(data=mtcars, statistic=rsq, R=1000, formula=mpg~wt+disp) 我的程序中已作出AUC趋势图,但是得不到AUC的95%CI及p值,模仿上面编程出不来结果。 我的程序如下(无AUC的95%CI及p值): fit<-coxph(Surv(survival.time,survival.status)~IPI+β2m,na.action=na.omit) eta0<-fit$linear.predictor AUC.CC=risksetAUC(Stime=survival.time, status=survival.status, marker=eta, method="Cox", tmax=40) |
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lilylorry
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