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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » lammps可视化？
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issp-hao

银虫 (正式写手)

[求助] lammps可视化？

我用lammps模拟聚合物链，请问怎么写dump命令才能用vmd观察到聚合物链，用xyz， dtc等格式只能看到一个一个的原子，看不到原子之间的键，请您指点，十分感谢！
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1楼 2012-02-21 16:11:07
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chaizhm

木虫 (著名写手)
vmd可以在原子之间加键的啊
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issp-hao
壁立万仞，无欲则刚
2楼2012-02-21 19:56:57
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issp-hao

银虫 (正式写手)
送鲜花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by chaizhm at 2012-02-21 19:56:57:
vmd可以在原子之间加键的啊

能说的再详细点吗，我想能不能这样做，把lammps的运行结果dump出来键的信息，然后读进vmd，要是在vmd直接加的话，是不是把本来没成键，但靠的很近的原子用键链接起来了呢？
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3楼2012-02-22 10:46:27
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madfarmer

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
chaizhm(金币+2): 2012-02-23 09:00:58
在vmd tk console 里用这个命令 topo readlammpsdata
具体怎么用看帮助，或者google。
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4楼2012-02-22 13:41:51
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wjl1314

银虫 (小有名气)
chaizhm: 应助指数-1, 没有应助不要点应助回帖 2013-03-19 08:57:10
你好，请问版主你会如何构建聚合物链吗？求助哈
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5楼2013-03-18 20:56:57
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dswkohaku

木虫 (小有名气)
还是不知道哎
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6楼2013-05-10 04:29:13
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