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issp-hao

银虫 (正式写手)

[求助] lammps可视化?

我用lammps模拟聚合物链,请问怎么写dump命令才能用vmd观察到聚合物链,用xyz, dtc等格式只能看到一个一个的原子,看不到原子之间的键,请您指点,十分感谢!
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madfarmer

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
chaizhm(金币+2): 2012-02-23 09:00:58
在vmd tk console 里用这个命令 topo readlammpsdata
具体怎么用看帮助,或者google。
4楼2012-02-22 13:41:51
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查看全部 6 个回答

chaizhm

木虫 (著名写手)

vmd可以在原子之间加键的啊

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

壁立万仞,无欲则刚
2楼2012-02-21 19:56:57
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issp-hao

银虫 (正式写手)

送鲜花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by chaizhm at 2012-02-21 19:56:57:
vmd可以在原子之间加键的啊

能说的再详细点吗,我想能不能这样做,把lammps的运行结果dump出来键的信息,然后读进vmd,要是在vmd直接加的话,是不是把本来没成键,但靠的很近的原子用键链接起来了呢?
3楼2012-02-22 10:46:27
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wjl1314

银虫 (小有名气)

chaizhm: 应助指数-1, 没有应助不要点应助回帖 2013-03-19 08:57:10
你好,请问版主你会如何构建聚合物链吗?求助哈
5楼2013-03-18 20:56:57
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