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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » MS 结构优化的结果不能理解 求高人指点
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leachmond

金虫 (著名写手)

[求助] MS 结构优化的结果不能理解 求高人指点

我研究的是TiO2，先切割一个面，加上真空层之后进行优化以看其稳定性。第一幅是切割并处理好后的一个表面，后面一幅就是优化之后的结果，个人感觉很不妥，为什么一开始在一起，优化完了却分开了，这明显是破坏了晶格结构，但是却不能找出出错的原因。我已经检查，建模、切割所依据的参数都是对的，操作也无误（或者还有隐藏的没有被我发现的错误），故求高人指点，感激不尽

优化之前的



优化之后的



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善于发现别人的优点，并把它转化为自己的长处，你就会成为聪明人；善于把握人生际遇，并把它转化为自己的机遇，你就会成为优秀者。
1楼 2012-02-20 10:13:17
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yadong80

铜虫 (小有名气)
WDD880227(金币+1): 感谢交流提示 2012-02-23 13:57:34
引用回帖:
5楼: Originally posted by leachmond at 2012-02-21 17:19:19:
1、“分开”指的就是优化完了后，原本在一边的原子分到两边了，因为后面还要做吸附，这样没有办法操作，导师说以前的结构优化没有出现过这种情况，所以就觉得错了，让我自己找原因（实际上他也不知道，对MS不是太 ...

点击了yes，就是允许程序自动寻找当前模型满足的对称性，结果就是，程序会给模型添加一个更高的对称性，引入更高的对称性不会对结构本身产生太多影响，我指原子的位置，但是晶胞的选取，就是重复单元的选取，会依据所添加的对称性作调整，所以，确实如你所说，晶胞参数会变化，但是原子位置没变，对于吸附的研究没有明显影响，不过，在表面添加吸附质时会受到模型对称性的影响，最好先Make P1.
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10楼2012-02-23 13:19:55
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shmilylxc

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
WDD880227(金币+1): 感谢提示 2012-02-21 08:36:23
我感觉应该是参数设置有问题
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2楼2012-02-20 21:43:56
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yadong80

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
WDD880227(金币+1): 感谢提示 2012-02-21 08:36:37
leachmond(金币+2): ★有帮助 有帮助 如果能在接下来的问题中回答的更详细 加金币奖励 2012-02-21 16:59:42
我不知道你所说的分开是什么意思？你是指在盒子两端都出现了Ti、O原子？如果是这样，我觉得你得看看你目前的表面结构，还是P1对称性吗？你在开始优化的时候，程序是否提醒，可以引入更高的对称性优化计算？而你又点了Yes。
退一步说，你目前的结构也没有什么错误，破坏晶体结构实在危言耸听了，程序只是调整了重复单元的取法，你可以在Display style中选择Lattice，在这个面板下面，调整显示重复单元的数目，然后比较一下优化前后的结构，就能发现这一点。
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3楼2012-02-20 23:00:57
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leachmond

金虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by shmilylxc at 2012-02-20 21:43:56:
我感觉应该是参数设置有问题

说的详细一点儿呗
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善于发现别人的优点，并把它转化为自己的长处，你就会成为聪明人；善于把握人生际遇，并把它转化为自己的机遇，你就会成为优秀者。
4楼2012-02-21 16:58:13
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