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生物生物

新虫 (初入文坛)


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32楼: Originally posted by 若水5886 at 2012-02-22 12:21:09
首先你要确定你的PCR产物是新鲜的,载体选择的是对的(平端和粘性末端的选择),感受态是好的,还有连接的温度低了,我用的全式金5分钟快速克隆产品,25-37度这样连接十分钟左右就可以的。还有你说的载体和PCR产物比 ...

你好我遇到了和楼主相似的问题,只是我目的条带263bp(Taq酶),我用的是PMD-18。 solution : 5ulpmd-18/19T: 1ul片段:4ul,Takara 的感受态,都是100ul做两只样,涂板(只用30ul菌液)培养后菌很多啊,但是挑了十来个菌落做pcr鉴定都没有目的条带。开始只做的Amp筛选,后来加了X-ga,IPTG,但根本看不到蓝白班现象,挑菌pcr也无果。请你说说看
51楼2013-03-28 07:32:43
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生物生物

新虫 (初入文坛)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
做TA克隆时,直接用PCR产物跟pMD18载体连接,我的PCR产物结果较好,目标片段长度263bp,电泳时看不出非特异扩增,有引物二聚体。1ul载体,4ulpcr产物,5ul自带的solutionI混合,16度连接过夜,42度热激45秒,冰上2分钟导入感受态DH5a摇床培养1小时后,在含X-gal,IPTG,Amp的LB固体培养基平板筛选,看不到蓝白班,但有许多单菌落,挑单菌落于含1ml LB液体培养基的试管中摇菌10小时,用菌液PCR检测(所用引物于前面pcr的引物相同,反映条件也相同,只是94度预变性时间改为10分钟)。但是检测结果没有目的条带,只有100bp左右的引物二聚体。载体说明书上说16度半小时就可以连接上了,师兄说连接过夜试一下,都没有结果。
而且载体,感受态都是TaKara的,新买的。我是一个菜鸟,不知道说的够不够详细,请大家帮我分析分析是什么原因。拜谢。
52楼2013-03-28 12:27:51
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cyp1512

金虫 (初入文坛)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
加一个参照一起转化看一下是连接转化效率低还是感受态问题,一般来说连接转化就是相对质粒转化少,但是没有也不应该
53楼2013-03-28 15:09:35
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my_father

铁虫 (初入文坛)



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补点ATP试试 10mM的 加1μl就可以了
54楼2013-03-28 17:37:25
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hustxiong

木虫 (正式写手)



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引用回帖:
52楼: Originally posted by 生物生物 at 2013-03-28 12:27:51
做TA克隆时,直接用PCR产物跟pMD18载体连接,我的PCR产物结果较好,目标片段长度263bp,电泳时看不出非特异扩增,有引物二聚体。1ul载体,4ulpcr产物,5ul自带的solutionI混合,16度连接过夜,42度热激45秒,冰上2分 ...

能够在AMP平板上长出许多菌落,说明转化时没有问题的,只是空载而已,那就是问题出现在连接上。
1)你的PCR产物 是不是经过割胶回收纯化后  再连接的?如果是,确信你回收回来没有,要检测的,微量紫外或者跑胶都可以
  建议:用TAE胶回收,效果会好于TBE
2)现在takara  有个专卖 solution 的试剂盒,里面有个solution III,据说可以显著提高连接效率。载体我们都是稀释10倍用的,配这个试剂盒,会节省很多成本哦。
55楼2013-03-29 16:14:20
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liucong046

木虫 (小有名气)



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引用回帖:
49楼: Originally posted by 生物生物 at 2013-03-28 07:31:45
你好我遇到了和楼主相似的问题,只是我目的条带263bp(Taq酶),我用的是PMD-18。 solution : 5ulpmd-18/19T: 1ul片段:4ul,Takara 的感受态,都是100ul做两只样,涂板(只用30ul菌液)培养后菌很多啊,但是挑了 ...

我觉得你还是把你的酶和载体换一套再试试,这个一般情况下很好做的,再不然就是你买的感受态有问题?我建议你还是自己花点时间自己制备点感受态。祝顺利!
56楼2013-03-30 09:46:02
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