24小时热门版块排行榜    

查看: 764  |  回复: 2

txf10

金虫 (著名写手)

[求助] 扩散结果分析

请问下面这种情况怎样获取数据比较快?谢谢
Molecular dynamics equilibration :

  ** Time :            0.10000 ps :
     Properties:                   Instantaneous       Averaged
       Kinetic energy    (eV) =       4.906986          4.906986
       Potential energy  (eV) =    -356.236753       -356.236753
       Total energy      (eV) =    -351.329768       -351.329768
       Temperature       (K)  =     301.286484        301.286484
       Pressure         (GPa) =       2.174644          2.174644
  ** Time :            0.20000 ps :
     Properties:                   Instantaneous       Averaged
       Kinetic energy    (eV) =       4.844123          4.875554
       Potential energy  (eV) =    -360.601346       -358.419050
       Total energy      (eV) =    -355.757224       -353.543496
       Temperature       (K)  =     297.426724        299.356604
       Pressure         (GPa) =       1.236568          1.705606
  ** Time :            0.30000 ps :
     Properties:                   Instantaneous       Averaged
       Kinetic energy    (eV) =       4.829834          4.860314
       Potential energy  (eV) =    -358.363435       -358.400512
       Total energy      (eV) =    -353.533601       -353.540198
       Temperature       (K)  =     296.549385        298.420864
       Pressure         (GPa) =       1.608727          1.673313
  ** Time :            0.40000 ps :
     Properties:                   Instantaneous       Averaged
       Kinetic energy    (eV) =       4.846846          4.856947
       Potential energy  (eV) =    -360.696517       -358.974513
       Total energy      (eV) =    -355.849671       -354.117566
       Temperature       (K)  =     297.593933        298.214131
       Pressure         (GPa) =       1.128608          1.537137
  ** Time :            0.50000 ps :
     Properties:                   Instantaneous       Averaged
       Kinetic energy    (eV) =       4.859858          4.857529
       Potential energy  (eV) =    -358.684920       -358.916594
       Total energy      (eV) =    -353.825062       -354.059065
       Temperature       (K)  =     298.392842        298.249874
       Pressure         (GPa) =       1.869459          1.603601
  ** Time :            0.60000 ps :
     Properties:                   Instantaneous       Averaged
       Kinetic energy    (eV) =       4.842494          4.855023
       Potential energy  (eV) =    -360.093195       -359.112694
       Total energy      (eV) =    -355.250702       -354.257671
       Temperature       (K)  =     297.326707        298.096012
       Pressure         (GPa) =       1.332014          1.558337
  ** Time :            0.70000 ps :
     Properties:                   Instantaneous       Averaged
       Kinetic energy    (eV) =       4.864891          4.856433
       Potential energy  (eV) =    -359.000098       -359.096609
       Total energy      (eV) =    -354.135207       -354.240176
       Temperature       (K)  =     298.701909        298.182569
       Pressure         (GPa) =       1.721916          1.581705
  ** Time :            0.80000 ps :
     Properties:                   Instantaneous       Averaged
       Kinetic energy    (eV) =       4.843353          4.854798
       Potential energy  (eV) =    -360.563921       -359.280023
       Total energy      (eV) =    -355.720568       -354.425225
       Temperature       (K)  =     297.379472        298.082182
       Pressure         (GPa) =       1.118793          1.523841
  ** Time :            0.90000 ps :
     Properties:                   Instantaneous       Averaged
       Kinetic energy    (eV) =       4.863011          4.855710
       Potential energy  (eV) =    -358.713881       -359.217118
       Total energy      (eV) =    -353.850870       -354.361408
       Temperature       (K)  =     298.586450        298.138212
       Pressure         (GPa) =       1.626190          1.535213
  ** Time :            1.00000 ps :
     Properties:                   Instantaneous       Averaged
       Kinetic energy    (eV) =       4.846049          4.854744
       Potential energy  (eV) =    -360.073244       -359.302731
       Total energy      (eV) =    -355.227195       -354.447987
       Temperature       (K)  =     297.544984        298.078889
       Pressure         (GPa) =       1.159913          1.497683

  Molecular dynamics production :

  ** Time :            0.10000 ps :
     Properties:                   Instantaneous       Averaged
       Kinetic energy    (eV) =       4.215498          4.215498
       Potential energy  (eV) =    -359.548580       -359.548580
       Total energy      (eV) =    -355.333083       -355.333083
       Temperature       (K)  =     258.829469        258.829469
       Pressure         (GPa) =       1.394944          1.394944
  ** Time :            0.20000 ps :
     Properties:                   Instantaneous       Averaged
       Kinetic energy    (eV) =       4.483554          4.349526
       Potential energy  (eV) =    -359.813896       -359.681238
       Total energy      (eV) =    -355.330342       -355.331712
       Temperature       (K)  =     275.287966        267.058718
       Pressure         (GPa) =       1.388361          1.391653
  ** Time :            0.30000 ps :
     Properties:                   Instantaneous       Averaged
       Kinetic energy    (eV) =       4.449261          4.382771
       Potential energy  (eV) =    -359.775172       -359.712549
       Total energy      (eV) =    -355.325910       -355.329778
       Temperature       (K)  =     273.182445        269.099960
       Pressure         (GPa) =       1.310541          1.364615
  ** Time :            0.40000 ps :
     Properties:                   Instantaneous       Averaged
       Kinetic energy    (eV) =       4.800062          4.487094
       Potential energy  (eV) =    -360.127679       -359.816332
       Total energy      (eV) =    -355.327617       -355.329238
       Temperature       (K)  =     294.721445        275.505331
       Pressure         (GPa) =       1.297354          1.347800
  ** Time :            0.50000 ps :
     Properties:                   Instantaneous       Averaged
       Kinetic energy    (eV) =       5.213374          4.632350
       Potential energy  (eV) =    -360.543514       -359.961768
       Total energy      (eV) =    -355.330140       -355.329418
       Temperature       (K)  =     320.098607        284.423986
       Pressure         (GPa) =       1.187958          1.315832
  ** Time :            0.60000 ps :
     Properties:                   Instantaneous       Averaged
       Kinetic energy    (eV) =       4.087903          4.541609
       Potential energy  (eV) =    -359.419741       -359.871430
       Total energy      (eV) =    -355.331839       -355.329822
       Temperature       (K)  =     250.995196        278.852521
       Pressure         (GPa) =       1.346239          1.320900
  ** Time :            0.70000 ps :
     Properties:                   Instantaneous       Averaged
       Kinetic energy    (eV) =       4.863431          4.587583
       Potential energy  (eV) =    -360.191387       -359.917139
       Total energy      (eV) =    -355.327957       -355.329555
       Temperature       (K)  =     298.612220        281.675335
       Pressure         (GPa) =       1.216039          1.305919
  ** Time :            0.80000 ps :
     Properties:                   Instantaneous       Averaged
       Kinetic energy    (eV) =       4.320929          4.554252
       Potential energy  (eV) =    -359.647878       -359.883481
       Total energy      (eV) =    -355.326949       -355.329229
       Temperature       (K)  =     265.302918        279.628783
       Pressure         (GPa) =       1.351352          1.311598
  ** Time :            0.90000 ps :
     Properties:                   Instantaneous       Averaged
       Kinetic energy    (eV) =       4.522857          4.550763
       Potential energy  (eV) =    -359.851705       -359.879950
       Total energy      (eV) =    -355.328849       -355.329187
       Temperature       (K)  =     277.701148        279.414602
       Pressure         (GPa) =       1.371274          1.318229
  ** Time :            1.00000 ps :
     Properties:                   Instantaneous       Averaged
       Kinetic energy    (eV) =       5.107191          4.606406
       Potential energy  (eV) =    -360.436212       -359.935577
       Total energy      (eV) =    -355.329022       -355.329171
       Temperature       (K)  =     313.578974        282.831039
       Pressure         (GPa) =       1.310441          1.317450
  ** Time :            1.10000 ps :
     Properties:                   Instantaneous       Averaged
       Kinetic energy    (eV) =       4.704611          4.615334
       Potential energy  (eV) =    -360.035166       -359.944630
       Total energy      (eV) =    -355.330555       -355.329296
       Temperature       (K)  =     288.860775        283.379197
       Pressure         (GPa) =       1.225033          1.309049
  ** Time :            1.20000 ps :
     Properties:                   Instantaneous       Averaged
       Kinetic energy    (eV) =       4.537107          4.608815
       Potential energy  (eV) =    -359.866478       -359.938117
       Total energy      (eV) =    -355.329370       -355.329303
       Temperature       (K)  =     278.576132        282.978941
       Pressure         (GPa) =       1.216535          1.301339
  ** Time :            1.30000 ps :
     Properties:                   Instantaneous       Averaged
       Kinetic energy    (eV) =       4.509535          4.601178
       Potential energy  (eV) =    -359.839552       -359.930535
       Total energy      (eV) =    -355.330017       -355.329358
       Temperature       (K)  =     276.883221        282.510040
       Pressure         (GPa) =       1.428348          1.311109
  ** Time :            1.40000 ps :
     Properties:                   Instantaneous       Averaged
       Kinetic energy    (eV) =       4.539127          4.596746
       Potential energy  (eV) =    -359.867733       -359.926050
       Total energy      (eV) =    -355.328606       -355.329304
       Temperature       (K)  =     278.700135        282.237904
       Pressure         (GPa) =       1.311772          1.311156
  ** Time :            1.50000 ps :
     Properties:                   Instantaneous       Averaged
       Kinetic energy    (eV) =       4.960363          4.620987
       Potential energy  (eV) =    -360.288953       -359.950243
       Total energy      (eV) =    -355.328590       -355.329256
       Temperature       (K)  =     304.563800        283.726297
       Pressure         (GPa) =       1.249788          1.307065
  ** Time :            1.60000 ps :
     Properties:                   Instantaneous       Averaged
       Kinetic energy    (eV) =       4.953894          4.641793
       Potential energy  (eV) =    -360.284236       -359.971118
       Total energy      (eV) =    -355.330342       -355.329324
       Temperature       (K)  =     304.166637        285.003818
       Pressure         (GPa) =       1.251144          1.303570
  ** Time :            1.70000 ps :
     Properties:                   Instantaneous       Averaged
       Kinetic energy    (eV) =       4.454269          4.630763
       Potential energy  (eV) =    -359.787491       -359.960316
       Total energy      (eV) =    -355.333223       -355.329554
       Temperature       (K)  =     273.489881        284.326528
       Pressure         (GPa) =       1.392238          1.308786
  ** Time :            1.80000 ps :
     Properties:                   Instantaneous       Averaged
       Kinetic energy    (eV) =       4.734135          4.636506
       Potential energy  (eV) =    -360.065482       -359.966159
       Total energy      (eV) =    -355.331347       -355.329653
       Temperature       (K)  =     290.673558        284.679140
       Pressure         (GPa) =       1.318716          1.309338
  ** Time :            1.90000 ps :
     Properties:                   Instantaneous       Averaged
       Kinetic energy    (eV) =       4.523277          4.630546
       Potential energy  (eV) =    -359.852858       -359.960196
       Total energy      (eV) =    -355.329582       -355.329649
       Temperature       (K)  =     277.726938        284.313235
       Pressure         (GPa) =       1.348272          1.311387
  ** Time :            2.00000 ps :
     Properties:                   Instantaneous       Averaged
       Kinetic energy    (eV) =       4.333841          4.615711
       Potential energy  (eV) =    -359.665770       -359.945474
       Total energy      (eV) =    -355.331929       -355.329763
       Temperature       (K)  =     266.095709        283.402359
       Pressure         (GPa) =       1.324979          1.312066
  ** Time :            2.10000 ps :
     Properties:                   Instantaneous       Averaged
       Kinetic energy    (eV) =       4.186764          4.595285
       Potential energy  (eV) =    -359.522134       -359.925315
       Total energy      (eV) =    -355.335370       -355.330030
       Temperature       (K)  =     257.065238        282.148210
       Pressure         (GPa) =       1.405459          1.316514
  ** Time :            2.20000 ps :
     Properties:                   Instantaneous       Averaged
       Kinetic energy    (eV) =       4.278477          4.580885
       Potential energy  (eV) =    -359.613167       -359.911127
       Total energy      (eV) =    -355.334690       -355.330242
       Temperature       (K)  =     262.696377        281.264036
       Pressure         (GPa) =       1.305801          1.316027
  ** Time :            2.30000 ps :
     Properties:                   Instantaneous       Averaged
       Kinetic energy    (eV) =       4.672213          4.584855
       Potential energy  (eV) =    -360.003621       -359.915148
       Total energy      (eV) =    -355.331409       -355.330293
       Temperature       (K)  =     286.871548        281.507841
       Pressure         (GPa) =       1.335098          1.316856
  ** Time :            2.40000 ps :
     Properties:                   Instantaneous       Averaged
       Kinetic energy    (eV) =       4.459570          4.579635
       Potential energy  (eV) =    -359.789240       -359.909902
       Total energy      (eV) =    -355.329670       -355.330267
       Temperature       (K)  =     273.815411        281.187323
       Pressure         (GPa) =       1.343519          1.317967
  ** Time :            2.50000 ps :
     Properties:                   Instantaneous       Averaged
       Kinetic energy    (eV) =       4.223575          4.565393
       Potential energy  (eV) =    -359.557718       -359.895815
       Total energy      (eV) =    -355.334143       -355.330422
       Temperature       (K)  =     259.325429        280.312847
       Pressure         (GPa) =       1.421543          1.322110
  ** Time :            2.60000 ps :
     Properties:                   Instantaneous       Averaged
       Kinetic energy    (eV) =       4.567137          4.565460
       Potential energy  (eV) =    -359.901723       -359.896042
       Total energy      (eV) =    -355.334586       -355.330582
       Temperature       (K)  =     280.419928        280.316966
       Pressure         (GPa) =       1.342257          1.322885
  ** Time :            2.70000 ps :
     Properties:                   Instantaneous       Averaged
       Kinetic energy    (eV) =       4.485196          4.562487
       Potential energy  (eV) =    -359.811025       -359.892893
       Total energy      (eV) =    -355.325828       -355.330406
       Temperature       (K)  =     275.388825        280.134442
       Pressure         (GPa) =       1.439400          1.327200
  ** Time :            2.80000 ps :
     Properties:                   Instantaneous       Averaged
       Kinetic energy    (eV) =       4.435513          4.557952
       Potential energy  (eV) =    -359.757415       -359.888055
       Total energy      (eV) =    -355.321902       -355.330102
       Temperature       (K)  =     272.338267        279.856007
       Pressure         (GPa) =       1.323245          1.327059
  ** Time :            2.90000 ps :
     Properties:                   Instantaneous       Averaged
       Kinetic energy    (eV) =       4.642148          4.560856
       Potential energy  (eV) =    -359.973073       -359.890986
       Total energy      (eV) =    -355.330924       -355.330131
       Temperature       (K)  =     285.025609        280.034269
       Pressure         (GPa) =       1.274367          1.325242
  ** Time :            3.00000 ps :
     Properties:                   Instantaneous       Averaged
       Kinetic energy    (eV) =       4.265871          4.551023
       Potential energy  (eV) =    -359.600521       -359.881304
       Total energy      (eV) =    -355.334650       -355.330281
       Temperature       (K)  =     261.922352        279.430539
       Pressure         (GPa) =       1.327419          1.325315
  ** Time :            3.10000 ps :
     Properties:                   Instantaneous       Averaged
       Kinetic energy    (eV) =       4.616313          4.553129
       Potential energy  (eV) =    -359.946529       -359.883408
       Total energy      (eV) =    -355.330216       -355.330279
       Temperature       (K)  =     283.439304        279.559854
       Pressure         (GPa) =       1.279239          1.323828
  ** Time :            3.20000 ps :
     Properties:                   Instantaneous       Averaged
       Kinetic energy    (eV) =       4.430816          4.549307
       Potential energy  (eV) =    -359.748906       -359.879205
       Total energy      (eV) =    -355.318090       -355.329898
       Temperature       (K)  =     272.049889        279.325167
       Pressure         (GPa) =       1.390784          1.325921
  ** Time :            3.30000 ps :
     Properties:                   Instantaneous       Averaged
       Kinetic energy    (eV) =       4.553003          4.549419
       Potential energy  (eV) =    -359.881283       -359.879268
       Total energy      (eV) =    -355.328280       -355.329849
       Temperature       (K)  =     279.552134        279.332045
       Pressure         (GPa) =       1.294322          1.324963
  ** Time :            3.40000 ps :
     Properties:                   Instantaneous       Averaged
       Kinetic energy    (eV) =       4.226615          4.539924
       Potential energy  (eV) =    -359.561384       -359.869918
       Total energy      (eV) =    -355.334769       -355.329994
       Temperature       (K)  =     259.512091        278.749105
       Pressure         (GPa) =       1.333323          1.325209
  ** Time :            3.50000 ps :
     Properties:                   Instantaneous       Averaged
       Kinetic energy    (eV) =       4.174948          4.529497
       Potential energy  (eV) =    -359.498406       -359.859304
       Total energy      (eV) =    -355.323458       -355.329807
       Temperature       (K)  =     256.339759        278.108838
       Pressure         (GPa) =       1.289846          1.324199
  ** Time :            3.60000 ps :
     Properties:                   Instantaneous       Averaged
       Kinetic energy    (eV) =       4.753951          4.535731
       Potential energy  (eV) =    -360.067266       -359.865080
       Total energy      (eV) =    -355.313315       -355.329349
       Temperature       (K)  =     291.890235        278.491655
       Pressure         (GPa) =       1.254116          1.322252
  ** Time :            3.70000 ps :
     Properties:                   Instantaneous       Averaged
       Kinetic energy    (eV) =       5.003134          4.548364
       Potential energy  (eV) =    -360.325466       -359.877523
       Total energy      (eV) =    -355.322332       -355.329159
       Temperature       (K)  =     307.189952        279.267284
       Pressure         (GPa) =       1.166393          1.318039
  ** Time :            3.80000 ps :
     Properties:                   Instantaneous       Averaged
       Kinetic energy    (eV) =       4.528604          4.547844
       Potential energy  (eV) =    -359.863431       -359.877152
       Total energy      (eV) =    -355.334827       -355.329309
       Temperature       (K)  =     278.054021        279.235356
       Pressure         (GPa) =       1.197968          1.314880
  ** Time :            3.90000 ps :
     Properties:                   Instantaneous       Averaged
       Kinetic energy    (eV) =       4.372134          4.543338
       Potential energy  (eV) =    -359.701713       -359.872654
       Total energy      (eV) =    -355.329579       -355.329316
       Temperature       (K)  =     268.446829        278.958727
       Pressure         (GPa) =       1.355995          1.315934
  ** Time :            4.00000 ps :
     Properties:                   Instantaneous       Averaged
       Kinetic energy    (eV) =       4.299306          4.537238
       Potential energy  (eV) =    -359.611232       -359.866118
       Total energy      (eV) =    -355.311926       -355.328881
       Temperature       (K)  =     263.975276        278.584141
       Pressure         (GPa) =       1.266493          1.314698
  ** Time :            4.10000 ps :
     Properties:                   Instantaneous       Averaged
       Kinetic energy    (eV) =       4.514512          4.536683
       Potential energy  (eV) =    -359.835677       -359.865376
       Total energy      (eV) =    -355.321165       -355.328693
       Temperature       (K)  =     277.188808        278.550109
       Pressure         (GPa) =       1.248993          1.313095
  ** Time :            4.20000 ps :
     Properties:                   Instantaneous       Averaged
       Kinetic energy    (eV) =       4.906423          4.545487
       Potential energy  (eV) =    -360.237389       -359.874233
       Total energy      (eV) =    -355.330965       -355.328747
       Temperature       (K)  =     301.251958        279.090629
       Pressure         (GPa) =       1.297588          1.312726
  ** Time :            4.30000 ps :
     Properties:                   Instantaneous       Averaged
       Kinetic energy    (eV) =       4.079880          4.534659
       Potential energy  (eV) =    -359.416440       -359.863587
       Total energy      (eV) =    -355.336560       -355.328928
       Temperature       (K)  =     250.502602        278.425791
       Pressure         (GPa) =       1.391234          1.314552
  ** Time :            4.40000 ps :
     Properties:                   Instantaneous       Averaged
       Kinetic energy    (eV) =       4.787542          4.540406
       Potential energy  (eV) =    -360.115809       -359.869319
       Total energy      (eV) =    -355.328267       -355.328913
       Temperature       (K)  =     293.952729        278.778676
       Pressure         (GPa) =       1.238217          1.312817
  ** Time :            4.50000 ps :
     Properties:                   Instantaneous       Averaged
       Kinetic energy    (eV) =       4.918297          4.548804
       Potential energy  (eV) =    -360.242147       -359.877604
       Total energy      (eV) =    -355.323850       -355.328801
       Temperature       (K)  =     301.980984        279.294283
       Pressure         (GPa) =       1.236188          1.311114
  ** Time :            4.60000 ps :
     Properties:                   Instantaneous       Averaged
       Kinetic energy    (eV) =       4.764147          4.553485
       Potential energy  (eV) =    -360.092869       -359.882284
       Total energy      (eV) =    -355.328722       -355.328799
       Temperature       (K)  =     292.516263        279.581717
       Pressure         (GPa) =       1.228843          1.309326
  ** Time :            4.70000 ps :
     Properties:                   Instantaneous       Averaged
       Kinetic energy    (eV) =       4.777889          4.558260
       Potential energy  (eV) =    -360.110886       -359.887148
       Total energy      (eV) =    -355.332998       -355.328888
       Temperature       (K)  =     293.359989        279.874872
       Pressure         (GPa) =       1.269080          1.308469
  ** Time :            4.80000 ps :
     Properties:                   Instantaneous       Averaged
       Kinetic energy    (eV) =       4.666872          4.560522
       Potential energy  (eV) =    -359.998308       -359.889464
       Total energy      (eV) =    -355.331435       -355.328942
       Temperature       (K)  =     286.543651        280.013805
       Pressure         (GPa) =       1.265617          1.307577
  ** Time :            4.90000 ps :
     Properties:                   Instantaneous       Averaged
       Kinetic energy    (eV) =       4.972379          4.568928
       Potential energy  (eV) =    -360.308457       -359.898015
       Total energy      (eV) =    -355.336078       -355.329087
       Temperature       (K)  =     305.301600        280.529882
       Pressure         (GPa) =       1.144170          1.304242
  ** Time :            5.00000 ps :
     Properties:                   Instantaneous       Averaged
       Kinetic energy    (eV) =       4.646897          4.570487
       Potential energy  (eV) =    -359.980471       -359.899664
       Total energy      (eV) =    -355.333574       -355.329177
       Temperature       (K)  =     285.317175        280.625628
       Pressure         (GPa) =       1.276708          1.303691

  Peak dynamic memory used =       0.77 MB


  Timing analysis for GULP :

--------------------------------------------------------------------------------
  Task / Subroutine                                          Time (Seconds)
--------------------------------------------------------------------------------
  Calculation of real space energy and derivatives              228.5781
  Calculation of many-body energy and derivatives               234.7500
  Global summation overhead                                       0.0156
--------------------------------------------------------------------------------
  Total CPU time                                                464.6094
--------------------------------------------------------------------------------


  GULP trajectory file written as B2.trg                                 


  Job Finished at 21:28.28 16th February   2012
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

njn0516

木虫 (正式写手)

自己编程吧 没有现成工具
2楼2012-03-11 00:17:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

w76990480

荣誉版主 (文坛精英)

super-emuch

优秀版主文献杰出贡献文献杰出贡献

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
jiaoyixiong(金币+1): 2012-03-13 07:58:58
txf10: 金币+5, 有帮助 2012-03-17 15:07:33
txf10: 金币+25 2012-03-19 22:00:01
如果会编程那样就快了,如果不会你就自己手动了
专业文献求助
3楼2012-03-12 23:15:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 txf10 的主题更新
信息提示
请填处理意见