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cfmzxf84

木虫 (正式写手)

[求助] 求助,Amber10做并行出错,内附代码,希望前辈指教,谢谢

用的是AMBER10自带的lam

输出错误如下:
The configuration file, config_amber.h, was successfully created.

root@chen-Precision-WorkStation-490:/usr/local/amber10/src# make parallel
Starting installation of Amber10 (parallel) at 2012年 02月 16日 星期四 22:00:24 CST.
cd sander; make parallel
make[1]: 正在进入目录 `/usr/local/amber10/src/sander'
./checkparconf
cpp -traditional -I/usr/local/amber10/include -P -xassembler-with-cpp -Dsecond=ambsecond -DBINTRAJ -DMPI  constants.f > _constants.f
/usr/local/amber10/bin/mpif77 -c -O3 -fno-range-check -fno-second-underscore -ffree-form  -o constants.o _constants.f
make[1]: /usr/local/amber10/bin/mpif77:命令未找到
make[1]: *** [constants.o] 错误 127
make[1]:正在离开目录 `/usr/local/amber10/src/sander'
make: *** [parallel] 错误 2
还有其他什么办法做并行呢?谢谢各位了
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godcook

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

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cfmzxf84(金币+22): ★★★★★最佳答案 2012-02-20 12:56:20
make parallel的时候需要指定是用什么并行软件,比如./configure -mpi gnu编译。一般gnu编译的amber是用openmpi管理并行。intel编译的amber是用mpich2管理并行。
你这里的问题应该是你装并行之前没有make clean。不管装并行还是装串行,在装完一个再装另一个之前都要make clean一次。
3楼2012-02-19 18:37:15
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