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boluomi银虫 (小有名气)
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[求助]
怎么知道interleukin-8（白细胞介素-8） 的结构？
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| 大家好。我是学化学的，对生物很不了解。请问一下，我怎么才能查到interleukin-8（白细胞介素-8 ）的分子量、结构等信息呢？ |
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 【分子生物】EPI帖 |
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boluomi
银虫 (小有名气)
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- 虫号: 359777
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送鲜花一朵 4楼2012-02-16 10:12:30
【答案】应助回帖
感谢参与，应助指数 +1
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下载一个pymol 或者wincoot http://www.pdb.org/pdb/explore/explore.do?structureId=1IL8 你要的信息什么都有了 |
2楼2012-02-15 19:54:38
【答案】应助回帖
amisking(金币+4, MolEPI+1): 鼓励积极应助！ 2012-02-15 20:24:08
boluomi(金币+5): ★★★很有帮助 2012-02-16 10:14:53
boluomi(金币+5): ★★★很有帮助 2012-02-16 10:14:53
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序列 >1IL8:A|PDBID|CHAIN|SEQUENCE SAKELRCQCIKTYSKPFHPKFIKELRVIESGPHCANTEIIVKLSDGRELCLDPKENWVQRVVEKFLKRAENS >1IL8:B|PDBID|CHAIN|SEQUENCE SAKELRCQCIKTYSKPFHPKFIKELRVIESGPHCANTEIIVKLSDGRELCLDPKENWVQRVVEKFLKRAENS Number of amino acids: 144 Molecular weight: 16753.5 Theoretical pI: 9.13 Amino acid composition: Ala (A) 6 4.2% Arg (R) 10 6.9% Asn (N) 6 4.2% Asp (D) 4 2.8% Cys (C) 8 5.6% Gln (Q) 4 2.8% Glu (E) 16 11.1% Gly (G) 4 2.8% His (H) 4 2.8% Ile (I) 10 6.9% Leu (L) 12 8.3% Lys (K) 18 12.5% Met (M) 0 0.0% Phe (F) 6 4.2% Pro (P) 8 5.6% Ser (S) 10 6.9% Thr (T) 4 2.8% Trp (W) 2 1.4% Tyr (Y) 2 1.4% Val (V) 10 6.9% Pyl (O) 0 0.0% Sec (U) 0 0.0% (B) 0 0.0% (Z) 0 0.0% (X) 0 0.0% Total number of negatively charged residues (Asp + Glu): 20 Total number of positively charged residues (Arg + Lys): 28 Atomic composition: Carbon C 744 Hydrogen H 1206 Nitrogen N 212 Oxygen O 211 Sulfur S 8 Formula: C744H1206N212O211S8 Total number of atoms: 2381 Extinction coefficients: Extinction coefficients are in units of M-1 cm-1, at 280 nm measured in water. Ext. coefficient 14480 Abs 0.1% (=1 g/l) 0.864, assuming all pairs of Cys residues form cystines Ext. coefficient 13980 Abs 0.1% (=1 g/l) 0.834, assuming all Cys residues are reduced Estimated half-life: The N-terminal of the sequence considered is S (Ser). The estimated half-life is: 1.9 hours (mammalian reticulocytes, in vitro). >20 hours (yeast, in vivo). >10 hours (Escherichia coli, in vivo). Instability index: The instability index (II) is computed to be 26.99 This classifies the protein as stable. Aliphatic index: 83.89 Grand average of hydropathicity (GRAVY): -0.572   |
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3楼2012-02-15 20:00:16
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