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boluomi

银虫 (小有名气)

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[求助] 怎么知道interleukin-8（白细胞介素-8）的结构？

大家好。我是学化学的，对生物很不了解。请问一下，我怎么才能查到interleukin-8（白细胞介素-8 ）的分子量、结构等信息呢？

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1楼 2012-02-15 18:59:14

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nach

铜虫 (著名写手)

不让吃就去死

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【答案】应助回帖

amisking(金币+4, MolEPI+1): 鼓励积极应助！ 2012-02-15 20:24:08
boluomi(金币+5): ★★★很有帮助 2012-02-16 10:14:53

序列

>1IL8:A|PDBID|CHAIN|SEQUENCE
SAKELRCQCIKTYSKPFHPKFIKELRVIESGPHCANTEIIVKLSDGRELCLDPKENWVQRVVEKFLKRAENS
>1IL8:B|PDBID|CHAIN|SEQUENCE
SAKELRCQCIKTYSKPFHPKFIKELRVIESGPHCANTEIIVKLSDGRELCLDPKENWVQRVVEKFLKRAENS

Number of amino acids: 144

Molecular weight: 16753.5

Theoretical pI: 9.13

Amino acid composition:
Ala (A) 6    4.2%
Arg (R)  10    6.9%
Asn (N) 6    4.2%
Asp (D) 4    2.8%
Cys (C) 8    5.6%
Gln (Q) 4    2.8%
Glu (E)  16    11.1%
Gly (G) 4    2.8%
His (H) 4    2.8%
Ile (I)  10    6.9%
Leu (L)  12    8.3%
Lys (K)  18    12.5%
Met (M) 0    0.0%
Phe (F) 6    4.2%
Pro (P) 8    5.6%
Ser (S)  10    6.9%
Thr (T) 4    2.8%
Trp (W) 2    1.4%
Tyr (Y) 2    1.4%
Val (V)  10    6.9%
Pyl (O) 0    0.0%
Sec (U) 0    0.0%

(B) 0    0.0%
(Z) 0    0.0%
(X) 0    0.0%

Total number of negatively charged residues (Asp + Glu): 20
Total number of positively charged residues (Arg + Lys): 28

Atomic composition:

Carbon    C          744
Hydrogen H       1206
Nitrogen N          212
Oxygen    O          211
Sulfur    S          8

Formula: C744H1206N212O211S8
Total number of atoms: 2381

Extinction coefficients:

Extinction coefficients are in units of  M-1 cm-1, at 280 nm measured in water.

Ext. coefficient 14480
Abs 0.1% (=1 g/l) 0.864, assuming all pairs of Cys residues form cystines

Ext. coefficient 13980
Abs 0.1% (=1 g/l) 0.834, assuming all Cys residues are reduced

Estimated half-life:

The N-terminal of the sequence considered is S (Ser).

The estimated half-life is: 1.9 hours (mammalian reticulocytes, in vitro).
                        >20 hours (yeast, in vivo).
                        >10 hours (Escherichia coli, in vivo).

Instability index:

The instability index (II) is computed to be 26.99
This classifies the protein as stable.

Aliphatic index: 83.89

Grand average of hydropathicity (GRAVY): -0.572