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杜拉拉314159

铜虫 (初入文坛)

[求助] primer 5 设计引物的问题

我想利用primer 5设计引物,已知模板序列,1kb,然后我想从这上面p出一段200bp的片段,也是已知序列,要保证200bp全部扩增出来,是不是用1kb全长进行设计啊,但是我选择不到能完整扩增我那个200bp产物的引物,求助~!!!怎么设计引物才能扩增出那短序列呢?坐等回复,谢谢大家~!
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自己选择的路,跪着也要走完!
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杜拉拉314159

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
: Originally posted by 大-木-虫 at 2012-02-12 23:03:28:
手动设计,直接在你目的序列两段选择合适长度,然后用Oligo评价一下,或者用PP5设计的时候设置一下上下游引物的范围,就行了。

这两天做实验,回复晚了,不好意思哈,谢谢你的建议~!
自己选择的路,跪着也要走完!
16楼2012-02-16 09:09:36
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查看全部 17 个回答

lxj341401

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
1949stone(金币+1): 同意 2012-02-12 19:30:40
杜拉拉314159(金币+1): 有帮助 2012-02-12 20:42:47
要扩展的200bp片段两端设计引物就好了。不用1kb的序列来设计,先把要扩展片段序列找出来。
2楼2012-02-12 19:10:08
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cxl_yll

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
杜拉拉314159(金币+1): 有帮助 2012-02-12 20:43:10
西瓜(金币+1): 鼓励应助 2012-02-12 22:10:54
以200bp设计引物就可以了,如何需要加酶切位点,根据实验需要记得加保护碱基哦~~ 妹妹 你是哪个学校啊
3楼2012-02-12 19:32:42
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杜拉拉314159

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
: Originally posted by cxl_yll at 2012-02-12 19:32:42:
以200bp设计引物就可以了,如何需要加酶切位点,根据实验需要记得加保护碱基哦~~ 妹妹 你是哪个学校啊

谢谢前辈,弱弱的问一下,你QQ是多少啊?我还有很多问题呢,想问问你。。。
自己选择的路,跪着也要走完!
4楼2012-02-12 20:34:05
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