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5xiaosh

银虫 (小有名气)

[求助] 菜鸟求助~求大侠帮忙看primer NCBI-blast 的结果

这对引物怎么样?做rt-pcr,需要构建表达载体的,求大侠帮忙分析一下。第一次用blast。
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5xiaosh

银虫 (小有名气)

自身互补性 4, 5 是什么意思
2楼2012-01-13 18:59:01
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frank213

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
5xiaosh(金币+2): complemet 是复制的意思么 谢谢应助 2012-01-14 20:22:54
西瓜(金币+1): 鼓励应助 2012-01-15 11:34:20
应该是自身复制的可能性吧,即无效复制的可能性增大
中庸不中道
3楼2012-01-14 00:11:50
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cllly22

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
西瓜(金币+2): 鼓励应助 2012-01-15 11:34:30
你这个引物恐怕有点问题,你要构建表达载体,5‘端要加酶切位点,酶切位点前面加有利于引物结合的几个碱基。
4楼2012-01-15 10:52:22
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qiyaocheng

木虫 (小有名气)

老虫

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
5xiaosh(金币+2): ★★★很有帮助 就这点金币了,谢谢大侠的应助。 2012-01-15 21:59:34
希望你能这几个方面注意一下,
1、如果做RT-PCR,最好是把自己要选用的酶切位点和保护碱基都加上再去软件里面检测各参数,因为那些碱基加在一起也不少的,约有10个吧,都可以影响到Tm的。
2、两个引物长度不要相差太多,GC含量不要差太大,你这两个的碱基含量快一倍了,这种情况下就可以通过酶切位点和保护碱基来平衡一下了,这点要注意的
3、引物设计的时候有个经验就是末端尽量不用A,虽然也有文章来说明过A无所谓,但是尽量不要去尝试了,出现问题大家都不愿意看到的。
其他自己多做做吧,祝顺利。
毕业回望科研路,满目疮痍一身土
5楼2012-01-15 12:05:24
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海阔天空8158

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
5xiaosh(金币+1): ★★★很有帮助 2012-01-15 21:58:50
应当是自身配对的核苷酸对数(basepair)。结合3‘配对数,可以知道自身配对出现的位置。

这是推测出来的,具体要验证一下。
供参考。
天行健,君子以自强不息;地势坤,君子以厚德载物。
6楼2012-01-15 14:08:29
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