应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 晶体解析 » list 文件中关于氢键的问题
51/1返回列表
查看: 694  |  回复: 3
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

471276585

金虫 (正式写手)

[求助] list 文件中关于氢键的问题

N2-H2A         0.890    2.938   142.25    3.682    I5 [ x, -y, z-1/2 ]

N2-H2B         0.890    3.148   128.38    3.766    I7 [ x, y, z-1 ]

N2-H2C         0.890

N4-H4A         0.890    3.262   127.21    3.866    I5 [ x, -y, z-1/2 ]

N4-H4B         0.890

N4-H4C         0.890

N5-H5A         0.860    2.935   142.86    3.657    I10 [ x, y, z-1 ]

O1-H1          0.791
------------------------------------------------------------------------------
Alternative approximate positions for H attached to O1:
------------------------------------------------------------------------------

O1-H15         0.793


想问一下中间几行就前面有后面没有氢键的受体，这个怎么解决，有什么问题么？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2012-01-03 16:46:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

471276585

金虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by yytsnake at 2012-01-03 18:59:39:
checkCIF,看看有没有与其相关的错误提示。没有，就不要管它了。若有就需要看看它周围的相关原子谁能接受该H原子，形成合理的H键。

这个是CHECKcif后的错误，您能帮我看看问题所在吗
PLAT415_ALERT_2_B Short Inter D-H..H-X       H1     ..  H19A    ..       1.97 Ang.
PLAT415_ALERT_2_B Short Inter D-H..H-X       H1     ..  H19A    ..       1.97 Ang.
PLAT420_ALERT_2_B D-H Without Acceptor       O1     -   H1     ...          ?      
PLAT420_ALERT_2_B D-H Without Acceptor       O1     -   H15    ...          ?
赞一下 回复此楼
3楼2012-01-04 09:20:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 4 个回答

yytsnake

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
471276585(金币+3): 谢谢，checkcif后水的H找不见氢键的受体 2012-01-04 09:21:05
checkCIF,看看有没有与其相关的错误提示。没有，就不要管它了。若有就需要看看它周围的相关原子谁能接受该H原子，形成合理的H键。
赞一下 回复此楼
2楼2012-01-03 18:59:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yytsnake

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by 471276585 at 2012-01-04 09:20:01:
这个是CHECKcif后的错误，您能帮我看看问题所在吗
PLAT415_ALERT_2_B Short Inter D-H..H-X       H1     ..  H19A    ..       1.97 Ang.
PLAT415_ALERT_2_B Short Inter D-H..H-X       H1     ..  H19A    ...

好象需要调整H1或H19A的位置，使它们远离，不再指向同一个点的方向。
H15也一样需要调整方向吧。
赞一下 回复此楼
4楼2012-01-04 09:44:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 4 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 国自然评审意见 +7 wangmingqi 2026-08-28 8/400 2026-08-28 18:42 by zhuzg0628
[基金申请] 投票:  有多少人是今天查系统知道结果的？ +16 爱看书的可乐 2026-08-26 18/900 2026-08-28 17:09 by winsaint
[基金申请] 为什么资助数各大高校都创新高，自己申请怎么就这么难 +11 Kittylucky 2026-08-27 12/600 2026-08-28 16:26 by lyxiaomc
[基金申请] 基金不中，共勉 +11 eulota 2026-08-26 11/550 2026-08-28 14:22 by 火星超人xi
[基金申请] 2026年叶企孙基金 +3 bud_bud 2026-08-27 6/300 2026-08-28 11:53 by bud_bud
[基金申请] 基金系统什么内容也没有 30+4 winsaint 2026-08-27 9/450 2026-08-28 11:06 by maolC
[基金申请] 怎么查啊 +6 huang1991js 2026-08-26 6/300 2026-08-28 08:42 by winsaint
[基金申请] 哪位高人中了，把查询到的截图贴出来让我看看，让我长长见识 +5 yuleib84 2026-08-26 6/300 2026-08-28 00:02 by yudaoqian88
[基金申请] 面上合作单位盖章 +5 ssyjh 2026-08-27 5/250 2026-08-27 20:50 by gdfollow
[基金申请] 申请删除本帖 +6 lyz123lyz 2026-08-27 7/350 2026-08-27 17:31 by 宁静致远sy
[基金申请] 怎么看青基中了没有啊 +5 叶九微 2026-08-26 5/250 2026-08-27 10:35 by l_zh2008
[基金申请] 为什么 国际(地区)合作与交流项目 没有放榜？ 10+3 majunge000 2026-08-26 11/550 2026-08-27 08:42 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +9 炎黄贵胄 2026-08-22 10/500 2026-08-26 15:40 by semaglutide
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +23 koalala 2026-08-24 26/1300 2026-08-26 14:29 by 宝贝虫子
[基金申请] 为什么国自然不能直接公布 +4 bjdxyxy 2026-08-26 4/200 2026-08-26 13:12 by qingmu1201
[基金申请] 国际合作可查了，中了面上 (EPI+1)(金币+50) +18 Ldrop2023 2026-08-26 18/900 2026-08-26 11:15 by cmrandy
[基金申请] 项目信息和经费信息在系统里都可以看到了 +6 wittyboy 2026-08-26 14/700 2026-08-26 10:55 by wittyboy
[基金申请] 国合现在查不到了吗？ +10 chengyan1220 2026-08-24 20/1000 2026-08-26 08:57 by peasantsprig
[基金申请] 某些机构，以效率低为荣，以效率低作为存在感 +9 yuleib84 2026-08-25 10/500 2026-08-25 17:14 by alexon
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑，不妨来听听这首《基金之外》 +8 scalable 2026-08-24 8/400 2026-08-25 12:52 by jnhyjjm
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭