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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » GROMACS中能不能改变势能函数或者LJ势的混合规则
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莱维

新虫 (初入文坛)

[求助] GROMACS中能不能改变势能函数或者LJ势的混合规则

如题，本人想计算一个模型系统，原本的真实系统是油水界面，换成球型分子的模型系统，没有静电作用了，想通过该LJ势能参数让系统分相，请问能修改么？
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1楼 2011-12-28 15:17:52
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莱维

新虫 (初入文坛)
★ ★ ★
御剑江湖(金币+3): 鼓励交流 2012-01-04 19:22:56
要做一个模型系统，就是两相都用LJ流体表示，所以么就和力场没关系了。因为没了静电作用，分相怕不是很容易，就像改一下势能函数形式。
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3楼2012-01-01 22:54:17
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leo1252

金虫 (正式写手)
★ ★ ★
御剑江湖(金币+3): 谢谢 2011-12-31 17:48:39
这个好像比较难，但是感觉是可以做的，关键是为什么要让系统分相啊？基于力场的方法，油和水会自动根据分子间相互作用分开的啊。
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2楼2011-12-30 19:08:38
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