24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 400  |  回复: 1

虫尾巴

金虫 (正式写手)

小木虫科研闷骚男联盟盟主

[求助] 求高手指导,三分子体系几何结构优化

要做反应机理分析,优化反应物结构,有分子筛,乙烯,苯三个分子,分子筛是催化剂,选用4T团簇。
优化几何结构时总是不收敛,即使gaussian job完成了,结构也和文献中的相差甚远。不清楚到底是怎么回事。同样的体系,有的文献说固定了分子筛的部分坐标,有的文献说先找的过渡态,然后向前找的反应物结构,我也曾尝试过固定分子筛,但是优化出来还是不一样,找过渡态有些难,总是计算终止。
现在我的理解是:几何结构优化的初猜结构建的不好,没有处理好分子之间的距离和角度。
很无奈,求高手指点一下,有多个反应分子这样的体系,一般进行几何结构优化的时候,关键问题是什么,最容易犯什么错误?
下面是我优化后结构与文献中结构的对比。我优化的结构,苯分子总是被挤到分子筛边缘。。。

我滴结果



文献滴结构
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

海纳百川,有容乃大;壁立千仞,无欲则刚。
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

虫尾巴

金虫 (正式写手)

小木虫科研闷骚男联盟盟主

乙烯和苯应该是共吸附在分子筛上的,苯环应该是吸附于分子筛的上方,苯环上的氢与分子筛上的氧应该有弱相互作用的。但我优化后的结构显示,分子筛末端硅原子上的氢,与苯环的上的碳形成了较强的相互作用。这显然不对。因为文献中苯环上的氢,进攻的是分子筛上的氧原子。。。哎。。。怎么优化都是苯环被边缘硅原子上的氢吸引过去了。
    曾经优化到比较好的结构,并且在这个好的结构附近振荡了一段时间,但最后苯环还是脱离那个位置,被挤到了边儿上。真不知道咋整了。。。
海纳百川,有容乃大;壁立千仞,无欲则刚。
2楼2011-12-28 11:10:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 虫尾巴 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 299求调剂 +6 嗯嗯嗯嗯2 2026-03-27 6/300 2026-03-27 12:43 by 果果妈咪
[考研] 322求调剂 +3 我真的很想学习 2026-03-23 3/150 2026-03-27 12:05 by 不吃魚的貓
[考研] 调剂 +3 李嘉图·S·路 2026-03-27 3/150 2026-03-27 11:19 by wangjy2002
[考研] 0703化学一志愿南京师范大学303求调剂 +3 zzffylgg 2026-03-24 3/150 2026-03-27 10:42 by shangxh
[考研] 275求调剂 +10 Micky11223 2026-03-25 12/600 2026-03-27 09:41 by caszguilin
[考研] 340求调剂 +3 jhx777 2026-03-27 3/150 2026-03-27 08:56 by 不吃魚的貓
[考研] 求调剂,一志愿 南京航空航天大学大学 ,080500材料科学与工程学硕 +4 @taotao 2026-03-26 5/250 2026-03-27 08:10 by hypershenger
[考研] 一志愿武汉理工,总分321,英一数二,求老师收留。 +5 nnnnnnn5 2026-03-25 5/250 2026-03-27 04:42 by wxiongid
[考研] 321求调剂 +6 wasdssaa 2026-03-26 6/300 2026-03-26 20:57 by sanrepian
[考研] 281求调剂 +3 亚克西good 2026-03-26 5/250 2026-03-26 19:48 by 不吃魚的貓
[考研] 生物学 296 求调剂 +4 朵朵- 2026-03-26 6/300 2026-03-26 19:01 by 不吃魚的貓
[考研] 一志愿北京化工大学材料与化工(085600)296求调剂 +9 稻妻小编 2026-03-26 9/450 2026-03-26 16:16 by 不吃魚的貓
[考研] 一志愿天津大学339材料与化工求调剂 +3 江往卖鱼 2026-03-26 3/150 2026-03-26 09:42 by 王小欠i
[考研] 一志愿南航 335分 | 0856材料化工 | GPA 4.07 | 有科研经历 +6 cccchenso 2026-03-23 6/300 2026-03-25 22:25 by 544594351
[考研] 求b区院校调剂 +4 周56 2026-03-24 5/250 2026-03-25 17:12 by yishunmin
[考研] 289材料与化工(085600)B区求调剂 +4 这么名字咋样 2026-03-22 5/250 2026-03-25 08:20 by mx.yue
[考研] 求调剂 +6 研研,接电话 2026-03-24 7/350 2026-03-24 17:01 by barlinike
[考研] 300求调剂,材料科学英一数二 +5 leaflight 2026-03-24 5/250 2026-03-24 16:25 by laoshidan
[考研] 一志愿北京化工大学070300 学硕336求调剂 +5 vv迷 2026-03-21 8/400 2026-03-22 14:20 by ColorlessPI
[考研] 336求调剂 +5 rmc8866 2026-03-21 5/250 2026-03-21 17:24 by 学员8dgXkO
信息提示
请填处理意见