24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 401  |  回复: 1

虫尾巴

金虫 (正式写手)

小木虫科研闷骚男联盟盟主

[求助] 求高手指导,三分子体系几何结构优化

要做反应机理分析,优化反应物结构,有分子筛,乙烯,苯三个分子,分子筛是催化剂,选用4T团簇。
优化几何结构时总是不收敛,即使gaussian job完成了,结构也和文献中的相差甚远。不清楚到底是怎么回事。同样的体系,有的文献说固定了分子筛的部分坐标,有的文献说先找的过渡态,然后向前找的反应物结构,我也曾尝试过固定分子筛,但是优化出来还是不一样,找过渡态有些难,总是计算终止。
现在我的理解是:几何结构优化的初猜结构建的不好,没有处理好分子之间的距离和角度。
很无奈,求高手指点一下,有多个反应分子这样的体系,一般进行几何结构优化的时候,关键问题是什么,最容易犯什么错误?
下面是我优化后结构与文献中结构的对比。我优化的结构,苯分子总是被挤到分子筛边缘。。。

我滴结果



文献滴结构
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

海纳百川,有容乃大;壁立千仞,无欲则刚。
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

虫尾巴

金虫 (正式写手)

小木虫科研闷骚男联盟盟主

乙烯和苯应该是共吸附在分子筛上的,苯环应该是吸附于分子筛的上方,苯环上的氢与分子筛上的氧应该有弱相互作用的。但我优化后的结构显示,分子筛末端硅原子上的氢,与苯环的上的碳形成了较强的相互作用。这显然不对。因为文献中苯环上的氢,进攻的是分子筛上的氧原子。。。哎。。。怎么优化都是苯环被边缘硅原子上的氢吸引过去了。
    曾经优化到比较好的结构,并且在这个好的结构附近振荡了一段时间,但最后苯环还是脱离那个位置,被挤到了边儿上。真不知道咋整了。。。
海纳百川,有容乃大;壁立千仞,无欲则刚。
2楼2011-12-28 11:10:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 虫尾巴 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 张芳铭-中国农业大学-环境工程专硕-298 +3 手机用户 2026-03-26 3/150 2026-03-27 21:39 by lbsjt
[考研] 学硕274求调剂 +5 Li李鱼 2026-03-26 5/250 2026-03-27 20:51 by 热情沙漠
[考研] 085602 化工专硕 338分 求调剂 +8 路痴小琪 2026-03-27 8/400 2026-03-27 16:50 by lenovolsw
[考研] 考研调剂 +9 小蜡新笔 2026-03-26 9/450 2026-03-27 11:10 by 不吃魚的貓
[考研] 0856材料专硕353求调剂 +9 NIFFFfff 2026-03-20 9/450 2026-03-27 10:13 by dick_runner
[考研] 材料调剂 +8 匹克i 2026-03-23 8/400 2026-03-27 08:11 by hypershenger
[考研] 351求调剂 +4 麦克阿磊 2026-03-24 4/200 2026-03-27 00:32 by wxiongid
[考研] 327求调剂 +7 prayer13 2026-03-23 7/350 2026-03-26 20:48 by 不吃魚的貓
[考研] 材料277求调剂 +5 min3 2026-03-24 5/250 2026-03-26 15:13 by zzll406
[考研] 0854AI CV方向招收调剂 +4 章小鱼567 2026-03-23 4/200 2026-03-25 17:04 by CoderLoser
[考研] 282求调剂 +3 wcq131415 2026-03-24 3/150 2026-03-25 12:16 by userper
[考研] 311求调剂 +3 冬十三 2026-03-24 3/150 2026-03-24 21:31 by peike
[考研] 一志愿北化315 求调剂 +3 akrrain 2026-03-24 3/150 2026-03-24 19:35 by 了了了了。。
[考研] 一志愿南航材料专317分求调剂 +5 炸呀炸呀炸薯条 2026-03-23 5/250 2026-03-24 16:52 by 星空星月
[考研] 085404电子信息284分求调剂 +4 13659058978 2026-03-24 4/200 2026-03-24 12:15 by syl20081243
[基金申请] 请教下大家 2026年国家基金申请是双盲审吗? +3 lishucheng1 2026-03-22 5/250 2026-03-24 08:22 by gltch
[考研] 求老师收我 +3 zzh16938784 2026-03-23 3/150 2026-03-23 12:56 by ztnimte
[考研] 070300,一志愿北航320求调剂 +3 Jerry0216 2026-03-22 5/250 2026-03-23 09:16 by 。。堂堂
[考研] 308求调剂 +3 墨墨漠 2026-03-21 3/150 2026-03-22 16:54 by i_cooler
[考研] 一志愿东华大学控制学硕320求调剂 +3 Grand777 2026-03-21 3/150 2026-03-21 19:23 by 简之-
信息提示
请填处理意见