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congming

金虫 (正式写手)

[求助] Flack因子是-0.03,手性群,说明什么。。。

得到一个单核的晶体,是手性群,Flack参数低,非手性配体做的,有必要做CD谱吗,想写到毕业论文里,怎么解释下呢,请各位大侠指点!!
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wormma

木虫 (正式写手)

One for All, All for One

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
帝夫(金币+5, CMEI+1): 很不错的回答哦!授予CMEI一枚,欢迎继续关注晶体版! 2011-12-29 17:09:49
congming(金币+1): 多谢大侠,好高深啊,看不太懂,还有就是sigma/Flack 2011-12-29 22:05:34
因为手性分子本身的重要性,导致经常出现尝试从手性结构(即具有手性的晶体结构)来判断分子手性(绝对构型)的问题。这是个很有意思的问题。简言之,即手性晶体结构和手性分子之间到底是怎样的关系。

首先要明确的是手性分子结构,手性晶体结构和手性空间群是完全不同的三个概念。三者谈论的对象分别是分子结构,(分子)晶体的结构和空间群本身。在230个空间群中,有11对(22个)为手性空间群。但是可以与手性晶体结构兼容的空间群有65个。具有手性的晶体结构一定是非中心对称的。

手性晶体结构的绝对结构是可以通过Flack参数判断的。Flack 参数定义的物理背景是由两个或更多components构成的反演孪晶。Flack=0 和1分别对应于呈中心对称的两个部分。这就意味这Flack参数适用于所有非中心对称的空间群,共有138个。

只有当Flack 参数本身及其标准差都满足一定条件的时候,我们可以认为绝对晶体结构能够确定下来。一般来说,这样的条件是:Flack<0.04, sigma(Flack)/Flack<3.0.当有其他证据时,Flack可以放松到0.10.这一条件还式比较严格的,目的是使结构分析的人不要仅仅根据一个Flack参数,轻易就给出绝对结构的信息。

如果结构修正的结果给出了可靠的Flack参数,只能够证明绝对晶体结构是正确的。此时,空间群一定是非中心对称的。中心对称的结构,Flack 参数没有定义,这可以从Flack 参数的物理背景去理解,因为中心对称的结构不可能存在反演孪晶,也就无所谓Flack参数。

那么对于一个正确的绝对结构,其中的分子手性有是怎样的呢?
1)        如果空间群中含有旋转反演,旋转反映,或滑移,则分子的绝对构型不能确定。原因如下:  因为若上述动作存在于分子内,则分子为非手性,若存在于分子间,则对映体同时存在与晶体中。
2)        若空间群不含上述对称,则有3种情况:
A.        晶体有单一手性的分子构成,此时可以确定分子绝对构型;
B.        晶体由对映体分子构成,即对映体同时存在于晶体中。例如很多结构中不对称单元有两个分子构成,这两个分子为对映体,且通过非晶体学对称中心联系。此时无法确定分子绝对构型。
C.        晶体有非手性分子构成。没有可能也没有必要确定分子的绝对构型。

总之,需注意一下几点
1.        Flack 参数首先要判断是否有意义。在有意义的时候,可以确定的是晶体的绝对结构,而不是组成晶体的分子的绝对构型。
2.        晶体的绝对结构和分子的绝对构型之间的关系还是比较复杂,没有简单的一一对应关系。
3.        但是有一点是非常明确的:如果晶体仅由一种绝对构型的手性分子组成,则其晶体结构一定是手性的。反之不成立。

1L Flack=-0.03, 如果其标准差也不大的话,可以认为晶体的绝对结构是正确的。其中的分子绝对构型仍然需要具体分析判断。1L所说的手性群,我理解很可能是与手性晶体结构兼容的65种空间群之一,但不一定是那22个手性群之一。

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OneforAll,AllforOne
7楼2011-12-29 16:31:38
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lxwnny

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
congming(金币+2): 有帮助 我认为也是这样,不过对于单核化合物,老板根本没兴趣啊,估计CD不给测了。。 2011-12-27 11:06:31
Flack因子接近0说明是单一手性的晶体/化合物,但只能说明你测试的那颗单晶/化合物是某种手性的,并不代表着你同一溶液中合成出的所有晶体都是这一手性的,只有经过CD谱验证才能说明这个问题,因为一般在溶液中得到的都是外消旋体混合物,它们的晶体很难从外观区分,而测结构只用一颗晶体。
2楼2011-12-26 15:44:30
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zhai021

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
congming(金币+2): 有帮助 没有偏光显微镜的说。。。。。 2011-12-27 11:05:32
可以现在偏光显微镜下大体看看,要数据的话还得做CD
3楼2011-12-26 17:50:02
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lovexieting

金虫 (小有名气)

弱弱的问一下,CD是什么?
4楼2011-12-27 13:29:29
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