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qiuqiming

金虫 (正式写手)

[求助] 空间群定的不对,会导致R值升高吗?

RT
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zbdfwq5777

木虫之王 (文学泰斗)

至尊山羊

文献杰出贡献

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感谢参与,应助指数 +1
qiuqiming(金币+2): 2011-12-20 16:11:55
空间群要是不对的话,整个结构都不对了。
2楼2011-12-20 12:58:49
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
qiuqiming(金币+3): 2011-12-20 16:12:13
也可能使得R值得降低。 比如空间群的对称性定低了。
xi2004-emuch@163.com
3楼2011-12-20 13:45:04
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wormma

木虫 (正式写手)

One for All, All for One

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
qiuqiming(金币+1): 2011-12-20 20:47:44
关于P-1空间群,Z=1情况下,分子本身的对称性问题,是一个很有有意思的问题。这里先从点阵理论和空间群理论的角度在原理上做些说明。供虫虫们参考讨论。

先说明一下P-1空间群和Z的有关问题。
P-1空间群是具有对称性的最简单的空间群之一。此空间群中,有8个等价的对称中心,分别位于(000)( 1/2 0 0)(0 ½ 0)(0 0 ½ )(1/2 /1/2 0)(1/2 0 1/2) (01/2 1/2) 和(1/21/21/2)。除此以外再无其他任何对称性。当分子占据具有P-1对称的点阵时,只有两种位置选择:一是点对称为-1的位置,即上述8个位置之一;二是点对称为1的位置。

Z定义为单胞里的“分子数”。若晶体中有真是的分子存在,则Z=单胞中的原子数/(每个分子的原子数);若晶体中不存在分子,如NaCl晶体,则Z=单胞中的原子数/(最简式的原子数)。比较负载的情况是晶体中有溶剂分子存在,或晶体本身有两种以上的分子组成。此时上述公式中的‘每个分子的原子数’是指分子和溶剂按一定比例组合成的基团的原子数。两种以上分子组成的晶体类似处理。

上一贴中,有如下陈述:
Z=1, 意味着你的unit cell 里面只有一个分子。
P-1, 意味着unit cell 里面的所有原子都必须遵从-1对称。
这很明显。

1)        对于比较直观的情况
晶胞中所有原子都服从中心对称,而且已经链接成一个分子。此时分子必然是中心对称的,起对称心和晶体学对称心(1/2,1/2,1/2)重合。
2)        更为一般的情况是晶胞中的原子服从中心对称,起数量也能组成一个分子,但是的确没有(而不是不能)组成一个分子。要想包这些离散的原子组合成一个分子,必须对其平移。
那么问题是经过平移以后的原子分布是否仍然具有中心对称?若是,分子具有对称心。否则,分子没有对称心。
在讨论P-1空间群时提到,P-1点阵中所有位置的点对称只有两种:-1和1.也就是说,形成的分子只有两种位置可以占据。当占据-1位时,分子本身亦需具有-1对称,即中心对称。当分子占据1位置时,分子本身不必具有对称心(当然如果有也可以,暂不讨论)。此时由于点阵中对称中心的存在,而且分子不位于对称中心上,必然会产生一个与原来分子呈中心对称的像分子。那么此像分子是否可能与原来的分子位于不同的晶胞,从而保证Z=1呢?一般情况不可能。因为如果像分子与原来分子位于两个晶胞,则这连个分子必须具有点阵平移对称。而实际上像分子即原来的分子是中心对称的关系,二者之间不可能有平移关系。
因此,若晶胞中的原子服从中心对称,起数量也能组成一个分子,经适当平移组成分子后,此分子也需具有中心对称。
OneforAll,AllforOne
4楼2011-12-20 20:35:03
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wormma

木虫 (正式写手)

One for All, All for One

【答案】应助回帖

qiuqiming(金币+2): 2011-12-20 20:47:38
非常抱歉,把另一个回帖贴在这里了。
重新回复一下:
若定高了,非等效反射按等效反射合并,Rint升高,|F|也不正确。结构很难解析。
若定低了,且低群是正确空间群的子群,则可以解析。R也会降低。如3L所述。但是此时部分原子坐标之间会存在明显的相关性。
OneforAll,AllforOne
5楼2011-12-20 20:39:17
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xiaoshan1988

木虫 (小有名气)

空间群不对,一般解不出来,因为i一个晶体一般只有一个空间群。如果一直解r值都不降低,要嘛是已经完全解好,再精修也没用了,要嘛是空间群搞错了。
6楼2012-01-12 21:12:42
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