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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 晶体解析 » 请问高手们，在解析对称性较高的晶体数据时，如何选择空间群？
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calebby

捐助贵宾 (著名写手)

[求助] 请问高手们，在解析对称性较高的晶体数据时，如何选择空间群？已有3人参与

我现在解析一个晶体数据，它默认的空间为P42/mmc，如果按这个空间群来解析的话，能解析到最后没有大的Q峰，R1降到0.1，R2却非常大，GOOF值为2，但事实上晶体数据非常好，信噪比比较高，Rint，Rsigma也都非常合理，所以R2值这么大的原因应该是空间群选错了。我将空间群降到p-1来解，然后用platon升上去，还是原来的那个空间群。求助高手支招，应该如何来选择空间群？每次遇到这样高对称性的晶体，我就非常头疼。
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1楼2014-05-24 08:34:00
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xja1830

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
应该是精修还没完。一般都会默认选择CFOM值最小的空间群去解而不用管实际空间群，解完后，根据经验看是否要提升空间群。另外，也许你的晶胞中含有无序溶剂分子，这也可能导致各指标异常，建议用ins文件squeeze一下看是否有无序溶剂分子。
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以一颗执着不变的心，勇往直前，迎向未来。
2楼2014-05-24 08:52:20
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jackdeng

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
你注意一下wght值的第二项是不是很大？
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3楼2014-05-24 09:51:14
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calebby

捐助贵宾 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by jackdeng at 2014-05-24 09:51:14
你注意一下wght值的第二项是不是很大？

第二项值为0，挺奇怪的。
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4楼2014-05-24 10:39:29
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jackdeng

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
4楼: Originally posted by calebby at 2014-05-24 10:39:29
第二项值为0，挺奇怪的。...

0不奇怪，很多结构解析的时候都会出现这样的值。通常结构解析选择空间群的时候都是秉着就高不就低的原则，但事实上有的时候地空间群是正确的，而高空间群解析的时候往往会出现一些这样或那样的问题，这是就要考虑降低空间群，造成这一现象的主要原因就是某些赝对称性的存在导致的。
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5楼2014-05-24 11:30:14
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calebby

捐助贵宾 (著名写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by jackdeng at 2014-05-24 11:30:14
0不奇怪，很多结构解析的时候都会出现这样的值。通常结构解析选择空间群的时候都是秉着就高不就低的原则，但事实上有的时候地空间群是正确的，而高空间群解析的时候往往会出现一些这样或那样的问题，这是就要考虑降 ...

非常感谢您的回复，通常遇到这种情况我都是将空间群降为p-1来解，但是后来用platon升空间群又升回去了。不知道您在遇到这类问题是如何选择的，恳请指导。
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6楼2014-05-24 12:34:12
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jackdeng

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
6楼: Originally posted by calebby at 2014-05-24 12:34:12
非常感谢您的回复，通常遇到这种情况我都是将空间群降为p-1来解，但是后来用platon升空间群又升回去了。不知道您在遇到这类问题是如何选择的，恳请指导。...

如果根据程序提供的空间群解不出来的话，我们也通常会降低空间群来解，然后再用platon升空间群，只是在将空间群的时候会根据经验选择可能的空间群，而不是直接降到P-1去解，因为在收数据的时候并不是按照三斜去收的，因此，降到P-1去解会碰到数据够的问题，也就无法解出结构了。
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7楼2014-05-24 14:06:00
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luxtal

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
试试自己设定你觉得可信的空间群。
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What_we_observe_is_not_nature_itself,_but_nature_exposed_to_our_method_of_questioning----Werner_Karl_Heisenberg
8楼2014-05-25 05:05:21
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calebby

捐助贵宾 (著名写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by luxtal at 2014-05-25 05:05:21
试试自己设定你觉得可信的空间群。

但选择空间群是要根据消光规律的吧，陈小明的那本书我看过好多遍了，但还没能领略其精髓。
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9楼2014-05-25 10:23:04
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luxtal

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

那是因为那本书没啥精髓,不看也罢!
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What_we_observe_is_not_nature_itself,_but_nature_exposed_to_our_method_of_questioning----Werner_Karl_Heisenberg
10楼2014-05-26 03:29:34
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