应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 氢键计算
41/1返回列表
查看: 663  |  回复: 3
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

phbgp

铁虫 (小有名气)

[求助] 氢键计算

请问一个氧氟沙星分子有几个官能团和水形成H键，怎么得到这个分子和水形成H键的总键能呢？是把每一个位点和水形成的键能相加吗？用一个水分子和氧氟沙星分子做几何优化时，水分子会同时和氧氟沙星上的两个官能团形成H键，这样得到的键能就是两个键能之和，怎么分开两个H键的键能呢？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
1楼 2011-12-15 17:02:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yzwyxnb

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gmy1990(金币+2): 2011-12-16 10:41:27
优化结构之后， 人为的把某一个氢移开（两个氢键中的一个）。转动一定的方向。再算该分子的单电子能（由于不知道你体系什么样子，建议你计算该状态下，水，氧氟沙星，以及两者结合的单电子能。然后简单的相加减）。可以分别求出氢键键能。
赞一下(1人) 回复此楼
好好学习
2楼2011-12-16 10:31:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

phbgp

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
楼: Originally posted by yzwyxnb at 2011-12-16 10:31:04:
优化结构之后， 人为的把某一个氢移开（两个氢键中的一个）。转动一定的方向。再算该分子的单电子能（由于不知道你体系什么样子，建议你计算该状态下，水，氧氟沙星，以及两者结合的单电子能。然后简单的相加减） ...

非常感谢你的回答，我的目的是求出氧氟沙星分子和水分子形成H键的键能总和，因为氧氟沙星上的好几个位点会和水形成H键，所以我不知道怎么计算H键的总和，是把可能形成H键的键能分别计算出来，然后相加吗？
赞一下 回复此楼
3楼2011-12-20 15:47:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yzwyxnb

银虫 (小有名气)
★ ★ ★
小红豆(金币+3): 谢谢 2011-12-21 21:40:01
这个 我就不确定了， 你应该只能算一个结构求出氢键键能吧。我觉得非要算氢键只能算一个最稳定结构的氢键
你把所有可能的构型优化 算出来的氢键 完全没有化学意义啊
赞一下(1人) 回复此楼
好好学习
4楼2011-12-21 15:12:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 phbgp 的主题更新
41/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 时间戳又变了8-15 +6 archvillain 2026-08-15 10/500 2026-08-15 14:29 by 枫叶之巅
[基金申请] 欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律 +26 医学老男孩 2026-08-13 57/2850 2026-08-15 14:25 by JChen2024
[基金申请] 有时候，自然基金真的不能太认真 （我的申报经验） +7 majunge000 2026-08-11 9/450 2026-08-15 13:34 by kiz2011
[博后之家] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 k0dTPqJtl0jt 2026-08-14 3/150 2026-08-15 12:41 by KxMI1BYBxWX1
[基金申请] 哪位老哥知道今年的国自然具体哪一天放榜？ +6 Ldrop2023 2026-08-13 6/300 2026-08-15 10:09 by tuanggou
[公派出国] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 k0dTPqJtl0jt 2026-08-14 5/250 2026-08-15 07:09 by 4wMiSEwB6436
[基金申请] filecode +7 cratir 2026-08-14 11/550 2026-08-15 06:19 by 学员8dgXkO
[找工作] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 k0dTPqJtl0jt 2026-08-14 4/200 2026-08-15 02:21 by 4wMiSEwB6436
[基金申请] 小木虫上这么多卖论文的，真有人买论文么？感觉没必要啊 +11 Tide man 2026-08-10 12/600 2026-08-15 02:12 by home3163
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 k0dTPqJtl0jt 2026-08-14 4/200 2026-08-15 01:28 by 4wMiSEwB6436
[基金申请] 各位道友，我要去昆明玩几天，回来见。 +7 Tide man 2026-08-14 8/400 2026-08-15 01:11 by arzu_hma
[基金申请] 是这周出结果还是下周出结果？ +4 yuleib84 2026-08-11 4/200 2026-08-14 23:05 by lfy8008
[硕博家园] 请教兼职经验 +3 是阿文鸭 2026-08-09 3/150 2026-08-14 12:07 by HER12025
[基金申请] FileCode能看出啥？ +10 要乐观耀哥 2026-08-10 32/1600 2026-08-14 09:37 by 要乐观耀哥
[文学芳草园] 阿姨 +4 汪汪锅 2026-08-09 4/200 2026-08-13 19:43 by arzu_hma
[基金申请] 重要来源：本周末出结果 +10 瞬息宇宙 2026-08-12 10/500 2026-08-13 15:46 by likettle
[基金申请] 分享一下我之前已中青C的计划书的filecode +4 布布和一二 2026-08-11 5/250 2026-08-13 12:56 by cratir
[基金申请] 结合人工智能，周易传统文化，filecode打分制来了，3分以上希望很大。 +3 Tide man 2026-08-12 4/200 2026-08-13 08:35 by ZJTJZ
[基金申请] 2019年青年基金涵评意见，大家看看几个A，几个B? +11 Tide man 2026-08-11 11/550 2026-08-13 07:35 by 撸猫猫
[基金申请] 帮忙看看fileCode +7 wwncly 2026-08-10 13/650 2026-08-11 19:36 by 冰心玉壶晴
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭