| 查看: 5895 | 回复: 18 | ||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||
[求助]
关于使用Dmol3进行过渡态搜索的问题！已有2人参与
|
||
|
本人新手 刚接触Dmol3不久 目前正在做吸附过渡态的搜索，有几个问题想请教大家： 1、对于吸附态轨迹文件的生成，我是把吸附前和吸附后的结构分别进行优化，然后分别做为反应物和生成物进行原子match，生成轨迹文件。但是我发现有一次有一种吸附结构居然不能生成轨迹文件 好像说反应物和生成物的晶体参数不一致。为什么会出现这种情况呢？还有我经常要手动进行一些原子match，正常吗？ 2、对于轨迹文件进行过渡态的搜索后，出现错误 Unable to bracket maximum from both endpoints Please check endpoints Cumulative number of energy/gradient calls : 17 这个问题我在论坛上搜索过，挺多的 但是回答的大部分是反应物和生成物的结构不对 需要调整。可是我的反应物和生成物都是优化过的，应该是稳定的还怎么进行调整呢？？ 3、关于反应物和生成物的优化，我好像看过有人说过渡态搜索时一些参数设置最好和优化时的一样，是这样吗？如果我对他们都用Castep进行优化，然后再到Dmol3进行TS搜索可以吗？如果想较容易的搜索出过渡态那么参数应该如何设置比较好呢？ 最后还是关于这个问题 Unable to bracket maximum from both endpoints Please check endpoints Cumulative number of energy/gradient calls : 17 是不是在参数设置上有什么问题呢？ 希望大家可以指点一下啊！~ 不胜感激~~ |
回复此楼» 猜你喜欢
博士读完未来一定会好吗
已经有6人回复
-
小论文投稿
已经有3人回复
-
Bioresource Technology期刊，第一次返修的时候被退回好几次了
已经有9人回复
-
心脉受损
已经有3人回复
-
到新单位后，换了新的研究方向，没有团队，持续积累2区以上论文，能申请到面上吗
已经有8人回复
-
申请2026年博士
已经有6人回复
-
请问哪里可以有青B申请的本子可以借鉴一下。
已经有5人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
关于dmol3进行过渡态搜索中的energy of barrier
已经有12人回复- 怀疑不存在过渡态的反应，DMOL3用LST/QST 过渡态搜索，得到的结构和产物一样
已经有10人回复
- 利用MS里的Dmol模块搜索过渡态不收敛
已经有5人回复
- 【求助】MS进行过渡态搜索失败，请教原因
已经有7人回复
- 【求助】dmol3 过渡态消虚频！！
已经有4人回复
- 【求助】关于Dmol3中消去过渡态的虚频！！急！！
已经有7人回复
- 【求助】dmol3计算过渡金属
已经有12人回复
- 【求助】DMOL3搜索过渡态计算失败——关于虚频
已经有20人回复
- 【求助】过渡态搜索失败原因？？
已经有6人回复
- 【求助】关于dmol中部分原子固定的几何优化问题
已经有10人回复
- 【求助】Dmol3和Castep的区别
已经有13人回复
- 【求助】DMol3过渡态搜索的相关问题
已经有6人回复
stefsui
木虫 (小有名气)
- 应助: 11 (小学生)
- 金币: 2252.3
- 散金: 114
- 红花: 1
- 帖子: 155
- 在线: 472.7小时
- 虫号: 872985
- 注册: 2009-10-15
- 专业: 理论和计算化学
8楼2012-03-19 20:43:58
2楼2011-12-12 12:04:57
3楼2011-12-14 15:59:24
4楼2011-12-14 20:53:57